Human Microbiome Project
Mikroskopische Untersuchung des gesunden menschlichen Körpers hat gezeigt, dass mikrobielle Zellen menschliche Zellen um etwa zehn zu eins übertreffen. Vor dem Start des HMP blieb diese reichhaltige Gemeinschaft von human-assoziierten Mikroben weitgehend unerforscht, so dass ihr Einfluss auf die menschliche Entwicklung, Physiologie, Immunität und Ernährung fast völlig unbekannt blieb. Das HMP wurde mit der Mission gegründet, Forschungsressourcen zu generieren, die schnell und breit geteilt wurden, um eine umfassende Charakterisierung der menschlichen Mikrobiota und ihrer metabolischen Fähigkeiten sowie eine Analyse ihrer Rolle für die menschliche Gesundheit und Krankheit zu ermöglichen. Die von HMP generierten Informationen sind jetzt weltweit verfügbar und können von Forschern und anderen Personen verwendet werden, um die menschliche Gesundheit zu verstehen und zu verbessern.
Die erste Phase von HMP konzentrierte sich auf die Entwicklung von DNA-Sequenzdatensätzen und Computerwerkzeugen zur Charakterisierung des Mikrobioms bei gesunden Erwachsenen und bei Menschen mit spezifischen mikrobiomassoziierten Erkrankungen. Eine ethische, rechtliche und gesellschaftliche Implikationen (ELSI) Komponente des Programms bewertet Fragen, die aus der menschlichen Mikrobiomforschung entstehen. Die zweite Phase von HMP, bekannt als integratives HMP oder iHMP, konzentrierte sich auf die Erstellung integrierter Datensätze mehrerer biologischer Eigenschaften sowohl des Mikrobioms als auch des Wirts im Laufe der Zeit bei Menschen mit spezifischen mikrobiomassoziierten Erkrankungen. Das langfristige Ziel des iHMP war es, Datensätze und Werkzeuge zu entwickeln, mit denen die Gemeinschaft bewerten kann, welche biologischen Eigenschaften des Mikrobioms und des Wirts wichtige neue Erkenntnisse zum Verständnis der menschlichen Gesundheit und Krankheit liefern.
Zu den wichtigsten Errungenschaften des HMP gehören:
- Sequenzierung von ~ 3000 aus dem menschlichen Körper isolierten Referenzbakteriengenomen
- Umfassendes Profil des Mikrobioms von über 300 gesunden Menschen
- Weltweit größter Metagenomsequenzdatensatz aus einer menschlichen Kohorte
- Weltweit einziger vollständiger Datensatz der Zusammensetzung von Bakterien, Pilzen, Viren und Protisten aus einer menschlichen Kohorte
- Integrierte Datensätze von Metagenom-, Transkript-, Protein- und Metabolitenprofilen aus Mikrobiom und Wirt in mehreren menschlichen Kohorten
- Software und Online-Ressourcen zur Unterstützung der Untersuchung der mikrobiom
- iHMP-Studien und -Datensätze zu Frühgeburten, entzündlichen Darmerkrankungen und Prädiabetes, die unsere Undestanding-Interaktionen zwischen Wirt und Mikrobiom erweitern
Weitere Informationen zum HMP, einschließlich der entwickelten Datensätze, Tools und Methoden, finden Sie auf der Website des HMP Data Analysis and Coordination Center.
Beispiele für wichtige Rollen des Mikrobioms bei menschlichen Erkrankungen, die von HMP-Forschern entdeckt wurden, finden Sie auf der Seite Programmhighlights sowie auf der Seite Relevanz für die öffentliche Gesundheit.