syntaasi

noin syntaasi:

syntaasi on entsyymi, joka katalysoi uusien yhdisteiden synteesiä elimistössä. Tämän vuoksi se on uskomattoman yleinen ja monipuolinen entsyymi, jota esiintyy sekä ylempien että alempien lahkojen lajeissa.
on tärkeää huomata, että syntaasin määritelmä on muuttunut ajan myötä. Alun perin biologisessa nimikkeistössä oli ero, joka erotti syntaasit ja syntetaasit toisistaan. Syntaasit eivät alkuperäisen määritelmän mukaan käyttäneet energiaa nukleotiditrifosfaateista ATP: n tapaan, kun taas syntetaasit käyttivät.
Joint Commission on Biochemical Nomenclature kuitenkin päivitti määritelmää kuvaamalla syntaasin miksi tahansa entsyymiksi, joka katalysoi synteesiä energialähteestä riippumatta. Tämän jälkeen he säätivät, että syntetaasit ovat nykyään synonyymejä ligaasille.

syntaasifunktio
Monoterpeenisyntaaseja esiintyy kasveissa ja ne auttavat niitä luomaan terpeenejä, joita ne tarvitsevat puolustautuakseen ympäristönsä uhkia vastaan. Mielenkiintoista on, että syntaasien avulla kasvin sisälle voidaan luoda valtava määrä erilaisia rakenteita, ja jotkin lajit rakentavat kehittyessään yli tuhat yksilöllisesti tunnistettavaa rakennelmaa.
syntaasi on ratkaiseva myös kapselin rakenteessa, synteesissä ja säätelyssä. Streptococcus Pneumoniae-lehdessä vuonna 2015 julkaisseet tutkijat havaitsivat, että serotyyppien 3 ja 37 käyttämä syntaasin CPS-biosynteesi eroaa hyvin paljon aiemmin kuvatuista mekanismeista.
joitakin syntaaseja käytetään myös ihmisten ja eläinten ruokinnassa. Esimerkiksi PFA-syntaasi on esimerkki FAS / PKS-biosynteettisestä logiikasta, jolla voidaan tuottaa erilaisia molekyylejä, joilla on paljon taloudellisia sovelluksia. Syntaasien kaupallinen hyödyntäminen esimerkiksi yksisolutuotannossa voisi johtaa edullisempien ja energiatehokkaampien menetelmien kehittämiseen biokemiallisten tuotteiden valmistamiseksi.

Syntaasien yhteisvaikutukset
Syntaasit vuorovaikuttavat biologisissa rakenteissa olevien muiden yhdisteiden kanssa eri tavoin. Syntaasin CPS-biosynteesissä CPSs kiinnittyy soluun fosfatidyyliglyserolikalvoankkurin tai syntaasientsyymin välityksellä. Siksi syntaasiriippuvaisessa CPS-biosynteesissä yksi entsyymi vastaa monivaiheisesti polysakkaridien polymeroitumisessa. Näin syntaasi ei ainoastaan aloita itse biosynteesiä, vaan se myös yhdistää molekyyliketjuja ja tarjoaa sitten mekanismin niiden jakamiseksi muihin synteesipaikan ulkopuolisiin kudoksiin.

Syntaasimekanismit
syntaasien tarkka toimintatapa on vielä tieteellisen tutkimuksen kohteena.
varhainen syntaasimekanismeja koskeva työ keskittyi 5-fluorouridiinia sisältäviin substraattianalogeihin. Alustavat tutkimukset ehdottivat ”Michael-mekanismia”, johon liittyi katalyyttisen Asp: n ja C6: n lisääminen isomeroituneen uridiinin pyrimidiinirenkaaseen.
tuoreempi teos kuitenkin kyseenalaistaa nämä johtopäätökset. Ajatus Miraccon ja Muellerin vuoden 2011 jälkeen viittaa kohti ”glykaalimekanismia.”Tutkijat asettivat tämän uuden mekanismin havaittuaan epimerisaation 5-fluorouridiinin riboosirenkaan C2′ – kohdassa RNA: ssa. Koe osoitti, että ainoa tapa selittää entsymaattinen aktiivisuus oli C2′: n deprotonaatio ja sen jälkeen uudelleenprotonaatio glykaaliväliaineen avulla. Ilman glykaalimekanismia on epäselvää, miten tällainen reaktio voisi tapahtua.