Infections bactériennes secondaires chez les patients atteints de Grippe saisonnière A et de grippe pandémique H1N1

Résumé

Le but de la présente étude est d’analyser les infections bactériennes secondaires chez un grand groupe de patients atteints de grippe saisonnière A et de grippe A (H1N1) pdm09. Des patients ayant reçu un diagnostic de grippe saisonnière A et de grippe A (H1N1) pdm09 entre 2005 et 2009 ont été inclus dans l’étude. Les données ont été extraites des dossiers médicaux et des systèmes d’information de laboratoire (SIL). Au total, 1094 patients atteints de grippe confirmée en laboratoire ont été étudiés. Il y avait 352 patients atteints de la grippe saisonnière A et 742 patients atteints de la grippe A (H1N1) pdm09. Les patients atteints de la grippe A étaient plus âgés et présentaient une comorbidité plus élevée que les patients atteints de la grippe A (H1N1) pdm09 (et, resp.). L’admission à l’hôpital était plus élevée dans le groupe grippal A (). En revanche, l’admission aux soins intensifs était plus élevée chez les patients atteints de la grippe A (H1N1) pdm09 que chez les patients atteints de la grippe A (). Le nombre d’échantillons bactériens prélevés et la positivité de la culture étaient plus élevés chez les patients atteints de la grippe A que chez les patients atteints de la grippe A (H1N1) pdm09 (et, resp.). Dans les deux groupes, la majorité des patients ayant des cultures bactériennes positives présentaient des maladies sous-jacentes. La présente étude montre que les caractéristiques du patient et la fréquence des infections bactériennes secondaires étaient différentes chez les patients atteints de grippe saisonnière A et chez les patients atteints de grippe A (H1N1) pdm09.

1. Introduction

Il a été démontré que l’interaction entre les virus de la grippe humaine et différents sous-types de virus de la grippe humaine et animale donne naissance à de nouvelles variantes du virus à potentiel pandémique. Les trois pandémies précédentes, 1918, 1957 et 1968, ont contribué à une surmortalité en partie due à des infections bactériennes secondaires. Dans le cas de la pandémie de 1918, des taux de mortalité allant jusqu’à 2,5 % ont été signalés. Il a été suggéré que les infections bactériennes secondaires étaient la raison sous-jacente de ces taux de mortalité excessifs. Après la pandémie de 1968, les épidémies saisonnières du virus de la grippe ont été dominées par des variantes du virus A / H3N2 générées par la dérive antigénique, et aucune nouvelle pandémie ne s’est produite pendant cette période. Cependant, en avril 2009, un nouveau virus de la grippe A / H1N1 a émergé chez les humains au Mexique et en Californie, se propageant rapidement dans le monde entier entre les humains, générant la première pandémie de grippe du 21e siècle.

Au cours de pandémies grippales antérieures, des infections bactériennes secondaires causées par Streptococcus pneumoniae, Haemophilus influenzae, Staphylococcus aureus et Streptococcus pyogenes ont contribué de manière importante à la morbidité et à la mortalité. Les informations sur l’épidémiologie des infections bactériennes secondaires pourraient donc jouer un rôle important dans la réduction des taux de mortalité et de morbidité dus à la grippe par la mise en œuvre précoce d’un traitement antibactérien empirique précis.

Des études antérieures ont suggéré que la grippe A (H1N1) pdm09 diffère des pandémies grippales précédentes, et les infections bactériennes secondaires semblent jouer un rôle limité dans les décès dus à la grippe pendant la pandémie actuelle. Cependant, à notre connaissance, il n’existe aucune étude comparative antérieure sur les infections bactériennes secondaires dues à la grippe saisonnière A et à la grippe A (H1N1) pdm09. Ces types d’études comparatives pourraient nous aider à comprendre les caractéristiques des infections bactériennes secondaires avec le type de grippe respectif.

Le but de la présente étude est d’analyser les infections bactériennes secondaires chez un grand groupe de patients atteints de grippe saisonnière A et de grippe A (H1N1) pdm09.

2. Méthodes

2.1. Matériel et conception de l’étude

Une étude rétrospective analysant la présence d’infections bactériennes secondaires chez des patients atteints de grippe saisonnière A (entre 2005 et 2008) ou de grippe A (H1N1) pdm09 (2009) a été conçue. Tous les patients ayant reçu un diagnostic de grippe saisonnière A et de grippe A (H1N1) pdm09 entre 2005 et 2009 ont été inclus dans l’étude. Les patients atteints de grippe entre 2005 et 2008 ont été regroupés en « grippe A ». Il est important de noter que les patients du groupe « grippe A » n’étaient pas homogènes puisque plusieurs virus grippaux différents, dont H1N1 et H3N2, dominaient pendant différentes périodes entre 2005 et 2008. Il n’a pas été possible de sous-grouper ces patients en fonction du type de virus grippal car le typage moléculaire du virus respectif pour chaque patient n’a pas été effectué. Les patients présentant des résultats bactériologiques positifs dans les deux groupes ont été étudiés plus avant. Les évaluateurs ont utilisé un formulaire normalisé. Toutes les données ont été extraites des dossiers médicaux, y compris l’âge, le sexe, la présence de comorbidités, la présentation clinique et l’évolution, y compris les rapports d’autopsie, la durée du séjour à l’hôpital (y compris le séjour en unité de soins intensifs) et l’utilisation d’un traitement antibiotique / antiviral. Un résultat bactériologique positif a été défini comme toute croissance dans les hémocultures ou la croissance de bactéries pathogènes pertinentes dans les échantillons de voies respiratoires. Les résultats de microbiologie ont été recueillis à partir des dossiers médicaux et des systèmes d’information de laboratoire (LIS).

2.2. Détection de virus

Des écouvillons floqués ou des aspirations nasopharyngées avaient été utilisés pour prélever des cellules épithéliales respiratoires du nasopharynx postérieur.

Le diagnostic en laboratoire de la grippe saisonnière A a été posé par détection de l’antigène grippal A avec immunofluorescence (IF). Les échantillons ont été centrifugés à 1000 tr/min pendant 10 min pour granuler les cellules en immunofluorescence directe (DFA). Les pastilles cellulaires ont ensuite été remises en suspension dans une petite quantité de solution saline tamponnée au phosphate, et 100 µL ont été appliqués sur des lames de verre, par cytocentrifugation (Shandon Cytospin 2, Thermo Scientific, Waltham, MA, USA) à 1200 tr/min pendant 10 min. Les lames sont séchées à l’air puis fixées dans de l’acétone froide pendant 10 min. Les taches cellulaires ont été colorées avec 25 µL d’anticorps monoclonaux conjugués provenant d’un kit DFA commercial de PathoDx Respiratory Virus Panel (Diagnostic Product Corporation, Los Angeles, CA, USA) pendant 15 minutes à 37 ° C. Le bleu d’Evan a été utilisé comme contre-coloration. Après un lavage répété dans une solution saline tamponnée au phosphate, les lames ont été montées dans du glycérol à 70% et examinées au microscope. Un résultat positif a été indiqué par la présence d’au moins une cellule intacte présentant une fluorescence spécifique à l’aide d’un microscope à fluorescence (Carl Zeiss, Oberkochen, Allemagne). La présence de ≥50 cellules épithéliales par lame de verre était nécessaire pour que l’échantillon soit considéré comme adéquat pour les tests de DFA. Des témoins positifs et négatifs de PathoDx ainsi que des témoins de souches de grippe A cultivées ont été utilisés.

Pour diagnostiquer la grippe pandémique H1N1, une réaction en chaîne transcriptase inverse-polymérase (rRT-PCR) en temps réel avec des amorces spécifiques au sous-type pour la grippe A (H1N1) pdm09 a été utilisée. Un volume d’échantillon de 400 µL a été extrait à l’aide du kit MagAttract Virus Mini M48 (Qiagen GmbH, Hilden, Allemagne) selon les instructions du fabricant avec le BioRobot Qiagen M48. L’ARN a été élué jusqu’à un volume final de 100 µL. L’eau a été utilisée comme témoin négatif et un isolat du virus de la grippe, A/Stockholm2/2009 H1N1, a été utilisé comme témoin positif pour chaque extraction. La méthode de PCR utilisée était une rRT-PCR en une étape fournie par l’Institut Suédois de Lutte contre les maladies Transmissibles. Les amorces utilisées étaient 5’GGC TGC TTT GAA TTT TAC CAC AA 3′ et 5′ TTT GGG TAG TCA TAA GTC CCA TTT T 3′, amplifiant le gène de l’hémagglutinine. La sonde utilisée était 5′-FAM-TGC GAT AAC ACG TGC ATG GAA AGT GTC-TAMRA-3′. Pour la PCR, le système de RT-PCR quantitatif en une étape Exposant III Platinum a été utilisé (Invitrogen Corporation, Carlsbad, CA, USA). Le programme de PCR utilisé était la transcription inverse pendant 15 minutes à 50 °C suivie de 2 minutes à 95 °C, 45 cycles de 95°C pendant 5 secondes, 60°C pendant 60 secondes et 40 °C pendant 30 secondes avec LightCycler 480 (Roche Diagnostics GmbH, Mannheim, Allemagne). Un cycle de seuil () ≤40 associé à une courbe de fluorescence sigmoïde était nécessaire pour que le résultat soit considéré comme positif.

2.3. Détection de bactéries

Tous les patients atteints de grippe saisonnière A ou de grippe A (H1N1) pdm09 positifs ont été contre-examinés dans la base de données du laboratoire de microbiologie clinique de l’Hôpital universitaire Karolinska de Huddinge, pour la présence de cultures de bactéries positives provenant des voies respiratoires ou du sang. Des échantillons de sang ont été cultivés dans le BacT/ALERT 3D (bioMérieux Inc., Durham, Caroline du Nord, États-Unis) système d’hémoculture automatisé. La détection des bactéries à partir d’échantillons cliniques a été effectuée par des méthodes standard.

3. Analyse statistique

Le test exact de Fisher et le test t de Students ont été utilisés pour la comparaison catégorielle et pour comparer les deux groupes, respectivement. Les valeurs de ont été considérées comme statistiquement significatives.

3.1. Autorisation éthique

L’étude a été approuvée par le Conseil régional d’Examen éthique de Stockholm, Suède (Dnr 2010/266-31).

4. Résultats

4.1. Résultats bactériens

Au total, 1094 patients atteints de grippe confirmée en laboratoire ont été étudiés. Dans le groupe d’étude, il y avait 352 patients atteints de grippe saisonnière A et 742 patients atteints de grippe A (H1N1) pdm09. Le nombre de prélèvements bactériologiques était plus élevé chez les patients atteints de grippe saisonnière A que chez les patients atteints de grippe A (H1N1) pdm09, 240/352 (68,18 %) contre 99/742 (13,34 %), respectivement ().

Les cultures bactériennes positives ont été analysées plus en détail par rapport au nombre total de patients atteints de la grippe A (H1N1) pdm09 et de la grippe A. Parmi les patients atteints de grippe A, 33/352 (9,38 %) avaient des échantillons bactériologiques positifs. Les nombres de patients positifs à la grippe A qui avaient des cultures positives des voies respiratoires supérieures, des voies respiratoires inférieures et du sang étaient les suivants 20/352 (5.68%), 13/352 (3.69%), et 8/352 (2,27%), respectivement (tableau 1).

Grippe A H1N1 Analyse statistique
Nombre total de patients 352 742
Année 2005-2008 2009
Patients avec des échantillons bactériens prélevés 240 (68.18%) 99 (13.34%)
Patients présentant des résultats bactériens positifs 33 (9.38%) 38 (5.12%)
Cultures respiratoires
Patients présentant des cultures positives des voies respiratoires supérieures* (nasopharynx/gorge) 20 (5.68%) 15 (2.02%)
S. pneumoniae 10 (2.84%) 10 (1.35%) ND
H. influenzae 5 (1.42%) 4 (0.54%) ND
M. catarrhalis 8 (2.27%) 3 (0.40%) ND
L. aureus 0 3 (0.40%) ND
S. pyogenes (streptocoques du groupe A) 2 (0.57%) 0 ND
Patients présentant des cultures positives des voies respiratoires inférieures (lavage des expectorations/broncho-alvéolaires) 13 (3.69%) 12 (1.62%)
S. pneumoniae 5 (1.42%) (0.1%) ND
H. grippe 2 (0.57%) 0 ND
M. catarrhalis 1 (0.28%) 1 (0.13%) ND
S. aureus 3 (0.85%) 5 (0.67%) ND
Coagulase negative staphylococci 0 2 (0.27%) ND
S. dysgalactiae (group G streptococci) 0 2 (0.27%) ND
S. pyogenes (group A streptococci) 1 (0.28%) 0 ND
Enterobacteriaceae 1 (0.28%) 1 (0.13%) ND
Hémocultures**
Toutes les hémocultures positives 8 (2.27%) 12 (1.62%) NS
S. pneumoniae 1 (0.28%) 4 (0.54%) ND
S. aureus 1 (0.28%) 1 (0.13%) ND
H. influenzae 1 (0.28%) 0 ND
Viridans streptocoques 1 (0.28%) 0 ND
S. pyogenes (streptocoques du groupe A) 0 1 (0.13%) ND
Staphylocoques à coagulase négative 4 (1.14%) 6 (0.81%) ND
Plusieurs patients ont eu plusieurs découvertes. ** Un patient a eu plusieurs découvertes. ND : non déterminé; NS : non significatif.
Tableau 1
Nombre de patients atteints de grippe saisonnière A et de grippe pandémique H1N1 et nombre de bactéries pertinentes spp. isolé de ces patients. Nombre (% du total).

Chez 38/742 (5,12 %) des patients atteints de la grippe A (H1N1) pdm09 positifs, les cultures étaient positives pour la croissance bactérienne. Les nombres de patients positifs à la grippe A (H1N1) pdm09 qui avaient des cultures positives des voies respiratoires supérieures, des voies respiratoires inférieures et du sang étaient 15/742 (2.02%), 12/742 (1.62%), et 12/742 (1,62%), respectivement. Les différentes espèces bactériennes identifiées dans les cultures sont représentées dans le tableau 1. Aucun cas de Staphylocoque doré résistant à la méthicilline (SARM) n’a été observé dans le matériel étudié.

Au total, les patients atteints de la grippe A présentaient un nombre plus élevé de cultures positives que les patients atteints de la grippe A (H1N1) pdm09 (). Le nombre de cultures positives des voies respiratoires supérieures et inférieures était plus élevé chez les patients atteints de la grippe A que chez les patients atteints de la grippe A (H1N1) pdm09 (et, resp.). Aucune différence n’a été observée dans le nombre d’hémocultures positives entre les deux groupes (tableau 1).

4.2. Caractéristiques du patient

Afin de comprendre les mécanismes sous-jacents possibles de l’apparition d’infections bactériennes secondaires, les caractéristiques des patients présentant des résultats bactériologiques pertinents positifs dans les voies respiratoires et le sang ont été analysées en détail. Les dossiers médicaux de ces patients ont été examinés et les caractéristiques de base sont présentées dans le tableau 2. Pour ces patients, la signification clinique des découvertes bactériennes a été déterminée par l’évaluation de la réponse des cliniciens aux résultats du laboratoire de microbiologie.

Grippe A H1N1 Analyse statistique
Patients grippaux présentant des résultats pertinents sur le plan bactériologique 33 38
Âge médian (min-max) 57.5 (38-74) 30.5 (17-43)
Sexe féminin / total (%) 19/33 (57.58%) 25/38 (65.79%) NS
Comorbidité
Diabète sucré 2/33 (6.06%) 0 NS
Maladie pulmonaire chronique* 5/33 (15.15%) 8/38 (21.05%) NS
Maladies cardiovasculaires chroniques 7/33 (21.21%) 1/38 (2.63%)
Immunosuppression** 12/33 (36.36%) 11/38 (28.95%) NS
Maladie rénale chronique 3/33 (9.09%) 4/38 (10.53%) NS
Nombre total de patients présentant une comorbidité 26/33 (78.79%) 19/38 (50.0%)
Hospitalisation
Délai entre les premiers symptômes et l’admission à l’hôpital (jours) 3 4 ND
Admission à l’hôpital 30/33 (90.90%) 24/38 (63.16%)
Admission aux soins intensifs 2/33 (6.06%) 11/38 (28.95%)
Durée du séjour à l’hôpital, y compris les soins intensifs (jours) 8.5 13.5
Traitement antimicrobien
Traitement antiviral 10/30 (30.30%) 18/38 (47.37%) NS
Traitement antibactérien 26/33 (78.79%) 25/38 (65.79%) NS
Mortalité
Mortalité globale 12/33 (36.36%) 3/38 (7.89%)
Mortalité dans les 4 semaines suivant le diagnostic de la grippe 2/33 (6.06%) 1/38 (2.63%) NS
Mortalité due aux complications de la grippe 4/33 (12.12%) 3/38 (7.89%) NS
ND : non déterminé; NS : non significatif; * asthme ou BPCO, fibrose kystique; ** transplantation rénale/ hépatique, tumeur solide, chimiothérapie, leucémie myéloïde aiguë (LMA), leucémie myéloïde chronique (LMC), greffe de cellules souches autologues (ASCT) et leucémie lymphoïde chronique (LLC).
Tableau 2
Caractéristiques de base des patients atteints de grippe saisonnière A et de grippe pandémique H1N1 avec des cultures bactériologiques positives pertinentes. Nombre (% du total).

Il y avait des différences dans les caractéristiques initiales entre les patients atteints de la grippe saisonnière A et les patients atteints de la grippe A (H1N1) pdm09. L’âge médian des patients atteints du groupe de la grippe saisonnière A était significativement plus élevé que celui du groupe de la grippe A (H1N1) pdm09, soit 57,5 ans contre 30,5 ans, respectivement (). Les femmes étaient majoritaires dans les deux groupes de patients, 57,58 % chez les patients atteints de la grippe saisonnière A et 65,79 % chez les patients atteints de la grippe A (H1N1) pdm09.

Le nombre total de patients atteints de comorbidité était significativement plus élevé dans le groupe de la grippe saisonnière A (). En comparant la morbidité pré-étudiée dans les groupes, les patients atteints de grippe saisonnière A présentaient une maladie cardiovasculaire significativement plus importante que les patients atteints de grippe A (H1N1) pdm09 7/33 (21,21%) contre 1/38 (2,63%), respectivement (). Deux patients grippaux saisonniers A sur 33 (6 %) présentaient un diabète sucré, comparativement à aucun parmi les patients atteints de la grippe A (H1N1) pdm09. Les affections conduisant à une immunosuppression étaient également courantes dans les deux groupes et comprenaient une maladie lymphoproliférative, une leucémie myéloïde aiguë (LMA) ou une leucémie lymphocytaire chronique (LLC), une transplantation de cellules souches et une immunodéficience secondaire (hypogammaglobulinémie ou VIH) (données non présentées). La présence d’une maladie pulmonaire chronique et d’une maladie rénale chronique était similaire dans les deux groupes.

Le temps médian entre l’apparition des symptômes et le temps nécessaire pour obtenir des soins médicaux était similaire dans les deux groupes d’étude. En revanche, il y avait des différences considérables dans la durée du séjour à l’hôpital et l’admission aux unités de soins intensifs (USI). Les patients atteints de la grippe A étaient plus souvent hospitalisés que les patients atteints de la grippe A (H1N1) pdm09 30/33 (90,90 %) contre 24/38 (63,16 %), respectivement (). Malgré des taux élevés d’admission à l’hôpital chez les patients atteints de la grippe A, la durée du séjour à l’hôpital était plus courte chez les patients atteints de la grippe saisonnière A par rapport aux patients atteints de la grippe A (H1N1) pdm09, respectivement 8,5 contre 13,5 jours, bien que cette différence ne soit pas statistiquement significative (). Fait intéressant, l’admission aux soins intensifs était plus faible chez les patients grippaux saisonniers A que chez les patients atteints de la grippe A (H1N1) pdm09, 2/33 (6,06 %) contre 11/38 (28,95 %), respectivement ().

4.3. Traitement antimicrobien

Un traitement antiviral (Oseltamivir ou Zanamivir) a été utilisé chez 10/33 (30,30 %) patients atteints de grippe saisonnière A et chez 18/38 (47,37 %) patients atteints de grippe A (H1N1) pdm09. La durée du traitement était de 5 jours pour tous les patients atteints de la grippe saisonnière A et la plupart des patients atteints de la grippe A (H1N1) pdm09. Un traitement antiviral prolongé a été administré à 6 patients atteints de la grippe A (H1N1) pdm09 ayant subi un long séjour aux soins intensifs (> 7 jours). La durée du traitement antiviral chez ces patients variait entre 6 et 35 jours (moyenne = 22 jours). Tous ces patients souffraient d’une maladie hématologique préexistante (myélome, LLC ou LAM) ou d’une maladie pulmonaire chronique sévère. Plusieurs de ces patients sont restés positifs à la PCR pour la grippe A (H1N1) pdm09 tout au long de leur séjour aux soins intensifs, malgré un traitement antiviral.

Les nombres de patients atteints de la grippe saisonnière A et de patients atteints de la grippe A (H1N1) pdm09 ayant reçu un traitement antibactérien étaient respectivement de 26/33 (78,79 %) et de 25/38 (65,79 %) (tableau 2). Il y avait une plus grande hétérogénéité dans laquelle le régime antibactérien qui a été choisi dans les épidémies de grippe saisonnière A. La pénicilline et l’amoxicilline étaient les plus couramment utilisées comme traitement oral (PO), suivies de près par la doxycycline. Dans les cas plus graves, lorsque l’administration intraveineuse (IV) a été préférée, le céfuroxime seul ou la pénicilline G associée à un aminoglycoside ont été choisis comme traitement empirique. Lorsqu’un passage de la thérapie IV à la PO a été effectué, de l’amoxicilline ou de la doxycycline a été utilisée. D’autres choix d’antibiotiques empiriques étaient les carbapénèmes, les quinolones et les macrolides associés à l’aminoglycoside. Les traitements antibiotiques duraient généralement de 7 à 10 jours. Les patients traités en USI pendant une longue période (> 7 jours) ont reçu un traitement antimicrobien IV avec un spectre plus large. Cela était, dans la majorité des cas, lié à des infections des voies respiratoires associées au ventilateur ou à d’autres infections liées aux soins intensifs (données non présentées).

Lorsque les patients atteints de la grippe A (H1N1) pdm09 ont été traités avec des antibiotiques PO, l’amoxicilline ou l’acide amoxicilline-clavulanique a été préférée comme traitement empirique. Lorsque le traitement par voie intraveineuse a été choisi, la pénicilline G ou une céphalosporine de deuxième / troisième génération était la plus couramment utilisée. Les patients admis aux soins intensifs recevaient toujours une céphalosporine de deuxième / troisième génération. En cas de réponse inflammatoire sévère et / ou d’insuffisance respiratoire sévère, une quinolone (moxifloxacine) a été ajoutée comme traitement empirique. En cas de choc septique / SDRA, le traitement par les céphalosporines était souvent associé à des aminoglycosides. La pipéracilline/tazobactame et les carbapénèmes ont été rarement utilisés chez les patients en USI, sauf s’ils ont été traités en USI pendant une longue période (> 7 jours) (données non présentées).

5. Discussion

Les infections bactériennes secondaires ont contribué de manière importante à la morbidité et à la mortalité lors des pandémies grippales précédentes. Il a été démontré que S. pneumoniae et S. aureus ont contribué à la surmortalité dans ces groupes de patients. Il n’existe aucune étude antérieure comparant les caractéristiques et la survenue d’infections bactériennes secondaires avec différents types de virus grippaux dans le même cadre.

Ici, nous avons analysé les infections bactériennes secondaires chez un grand groupe de patients atteints de grippe saisonnière A et de grippe A (H1N1) pdm09, diagnostiquées à l’Hôpital universitaire de Karolinska, au cours de la période 2005-2009.

Le nombre de patients atteints de la grippe A (H1N1) pdm09 positifs en un an était significativement plus élevé que le nombre de patients atteints de la grippe A saisonnière en 4 ans, 742 contre 352 patients, respectivement. En 2009, les tests diagnostiques visant à identifier la grippe A (H1N1) pdm09 ont été largement utilisés. Le Conseil national suédois de la Santé et du bien-être a chargé les cliniciens de tester chaque cas suspect de grippe A (H1N1) pdm09 afin de suivre l’extension de la pandémie et d’identifier les patients des groupes à risque qui devraient recevoir un traitement antiviral. Le nombre élevé de patients positifs à la grippe A (H1N1) pdm09 dans l’étude pourrait probablement dépendre d’un nombre élevé d’échantillons pour ce virus. Dans l’étude, les méthodes de diagnostic utilisées pour la grippe saisonnière A et la grippe A (H1N1) pdm09 étaient également différentes. La méthode de PCR utilisée pour la grippe A (H1N1) pdm09 s’est déjà révélée plus sensible que la méthode IF, utilisée pour la grippe saisonnière A entre 2005 et 2008. La différence de performance des deux méthodes pourrait également jouer un rôle dans un nombre élevé de positivité au pdm09 de la grippe A (H1N1). Une autre possibilité est que le virus de la grippe A (H1N1) pdm09 ait infecté un nombre plus élevé de patients que le virus de la grippe saisonnière A.

Des études antérieures ont montré que la grippe A (H1N1) pdm09 infecte principalement les jeunes patients. Les données actuelles suggèrent que les jeunes patients infectés par la grippe A (H1N1) pdm09 qui développent une grippe sévère souffrent souvent de maladies compliquées préexistantes. L’admission à l’hôpital était plus élevée dans le groupe grippal A (). En revanche, l’admission aux soins intensifs était plus élevée chez les patients atteints de la grippe A (H1N1) pdm09 que chez les patients atteints de la grippe A (). Les patients atteints de la grippe A (H1N1) pdm09, en tant que groupe plus jeune et en meilleure santé, étaient probablement plus susceptibles de sortir des urgences, mais les personnes hospitalisées présentaient souvent une infection plus grave, en particulier dans le sous-groupe de personnes souffrant d’immunosuppression.

Le nombre d’échantillons bactériens prélevés et la positivité de la culture étaient plus élevés chez les patients atteints de la grippe A que chez les patients atteints de la grippe A (H1N1) pdm09 (et, resp.). Cependant, les deux groupes de patients de l’étude différaient en taille et en partie en sélection, car les cultures bactériennes étaient réalisées dans une plus grande proportion chez les patients grippaux saisonniers A. Dans les deux groupes, la majorité des patients présentant des cultures bactériennes positives présentaient des maladies sous-jacentes. Dans les hémocultures, S. pneumoniae et le staphylocoque à coagulase négative étaient les isolats les plus courants dans les deux groupes. Les trois espèces bactériennes les plus courantes isolées d’échantillons de voies respiratoires inférieures chez les patients atteints de grippe A étaient S. pneumoniae, S. aureus et H. influenzae. Chez les patients atteints de la grippe A (H1N1) pdm09, les cultures des voies respiratoires inférieures étaient plutôt dominées par S. aureus, Streptococcus dysgalactiae et staphylocoques à coagulase négative. La raison de cette différence n’est pas connue.

Dans le matériel étudié, la croissance de S. aureus et de S. pneumoniae dans les voies respiratoires inférieures ou le sang a conduit à un traitement antibiotique. La majorité des hémocultures positives avec des staphylocoques à coagulase négative ont été interprétées comme une contamination et n’ont par la suite pas été soumises à un traitement antibiotique. Les patients avec des cultures positives des voies respiratoires supérieures ont reçu un traitement antibiotique dans une moindre mesure que ceux qui avaient une culture et une hémoculture positives des voies respiratoires inférieures. Cela pourrait s’expliquer en partie par une colonisation accrue des voies respiratoires supérieures de nombreuses bactéries, y compris des agents pathogènes lors d’une maladie respiratoire virale aiguë, comme l’ont montré d’autres précédemment.

Dans la présente étude, 30,30% des patients atteints de grippe saisonnière A et 47,37% des patients atteints de grippe A (H1N1) pdm09 ont reçu un traitement antiviral. Pendant la pandémie, le Conseil national suédois de la Santé et du bien-être a demandé aux médecins d’initier un traitement antiviral dans les 2 à 3 jours suivant le début des symptômes de la grippe. Il a été démontré que les patients grippaux bénéficient d’un traitement antiviral s’il est initié dans les 4 premiers jours de la maladie. Plusieurs patients atteints de la grippe A (H1N1) pdm09 ont demandé de l’aide médicale après 4 jours de symptômes grippaux et ont donc été disqualifiés pour un traitement antiviral.

Malgré une faible fréquence d’infections bactériennes secondaires dans les études actuelles et précédentes, la majorité des patients atteints de grippe saisonnière A ou de grippe A (H1N1) pdm09 ont reçu un traitement antibactérien. Nos résultats concernant l’étiologie bactérienne de ces infections suggèrent que l’antibiothérapie empirique chez les patients atteints de grippe A et de grippe A (H1N1) pdm09 devrait être dirigée principalement contre S. pneumoniae et S. aureus. Dans le contexte suédois, il n’est généralement pas nécessaire de couvrir empiriquement le SARM.

Rétrospectivement, l’évolution de la grippe A (H1N1) pdm09 en Suède n’était pas aussi grave que ce qui avait été suspecté pour la première fois. L’absence d’un grand nombre d’infections bactériennes secondaires, telles que présentées ici, pourrait être l’une des raisons sous-jacentes de l’évolution bénigne de la maladie, en particulier lorsqu’on la compare à la pandémie de 1918. Cependant, pour quelques individus, les infections par la grippe A (H1N1) pdm09 ont eu une évolution sévère due à une pneumonie virale ainsi qu’à des infections bactériennes secondaires. Par conséquent, un diagnostic précis précoce de la grippe ainsi que des infections bactériennes secondaires pourrait être important pour réduire les taux de mortalité et de morbidité chez ces patients.

Contribution des auteurs

Karin Liderot et Marcus Ahl ont également contribué à l’étude.

Remerciements

Cette étude a été soutenue par les subventions du Karolinska Institutet. Aucun conflit d’intérêts pertinent à cet article n’a été signalé par les auteurs.