Projet sur le microbiome humain
Une étude microscopique du corps humain en bonne santé a démontré que les cellules microbiennes sont plus nombreuses que les cellules humaines d’environ dix à une. Avant le début du PGH, cette communauté abondante de microbes associés à l’homme restait en grande partie non étudiée, laissant leur influence sur le développement humain, la physiologie, l’immunité et la nutrition presque entièrement inconnue. Le PGH a été créé avec pour mission de générer des ressources de recherche, qui ont été rapidement et largement partagées, permettant une caractérisation complète du microbiote humain et de ses capacités métaboliques et une analyse de leur rôle dans la santé humaine et les maladies. Les informations générées par HMP sont maintenant disponibles dans le monde entier pour être utilisées par les chercheurs et d’autres personnes dans le but de comprendre et d’améliorer la santé humaine.
La première phase de HMP était axée sur le développement d’ensembles de données de séquences d’ADN et d’outils de calcul pour caractériser le microbiome chez les adultes en bonne santé et chez les personnes atteintes de maladies spécifiques associées au microbiome. Une composante des Implications éthiques, juridiques et sociétales (ELSI) du programme a évalué les questions qui découlent de la recherche sur le microbiome humain. La deuxième phase de HMP, connue sous le nom de HMP intégrative ou iHMP, était axée sur la création d’ensembles de données intégrés de multiples propriétés biologiques du microbiome et de l’hôte au fil du temps chez des personnes atteintes de maladies spécifiques associées au microbiome. L’objectif à long terme de l’iHMP était de développer des ensembles de données et des outils que la communauté peut utiliser pour évaluer les propriétés biologiques du microbiome et de l’hôte qui fournissent de nouvelles informations importantes pour comprendre la santé humaine et les maladies.
Les faits saillants des principales réalisations du PGH comprennent:
- Séquençage d’environ 3000 génomes bactériens de référence isolés du corps humain
- Profil complet du microbiome de plus de 300 humains en bonne santé
- Le plus grand ensemble de données de séquences de métagénomes au monde provenant d’une cohorte humaine
- Le seul ensemble de données complet au monde sur la composition de communautés bactériennes, fongiques, virales et protistes provenant d’une cohorte humaine
- Ensembles de données intégrés de profils métagénomiques, de transcriptions, de protéines et de métabolites provenant à la fois du microbiome et de l’hôte dans de multiples cohortes humaines
- Logiciels et ressources en ligne pour aider à l’étude de la microbiome
- Études iHMP et ensembles de données sur les naissances prématurées, les maladies inflammatoires de l’intestin et le prédiabète qui élargissent nos interactions hôte / microbiome peu exigeantes
Pour plus d’informations sur le HMP, y compris les ensembles de données, les outils et les méthodes développés, consultez le site Web du Centre d’analyse et de coordination des données HMP.
Pour des exemples de rôles importants pour le microbiome dans les maladies humaines découverts par les chercheurs du PGH, veuillez visiter la page Faits saillants du programme ainsi que la page Pertinence en santé publique.