Qu’est-ce que l’excrétion virale?

Par Benedette Cuffari, M.Sc. Revu par Sophia Coveney, B.Sc .

Comprendre la durée de l’excrétion virale du coronavirus du syndrome respiratoire aigu sévère 2 (SARS-CoV-2), ainsi que son lien avec un test PCR positif ou négatif, est crucial pour la mise en œuvre d’efforts de santé publique efficaces visant à contrôler la propagation du virus.

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Définition de l’excrétion virale

Lorsqu’un individu est infecté par un virus respiratoire tel que le SARS-CoV-2, les particules virales se lient aux différents types de récepteurs viraux, en particulier les récepteurs de l’enzyme de conversion de l’angiotensine 2 (ACE2) dans le cas du SARS-CoV-2, qui tapissent les voies respiratoires.

Tout au long de ce processus en cours, les personnes infectées, qui ne présentent peut-être pas encore l’un des symptômes viraux, rejettent des particules virales pendant qu’elles parlent, expirent, mangent et effectuent d’autres activités quotidiennes normales.

Dans des circonstances normales, l’excrétion virale ne persistera pas plus de quelques semaines; cependant, à mesure que les chercheurs acquièrent une compréhension plus approfondie de la clairance virale du SARS-CoV-2, ils ont constaté que certaines populations transmettront ce virus pendant des durées beaucoup plus longues.

En fait, un nombre croissant de preuves indiquent que l’excrétion virale du SARS-CoV-2 commence avant qu’un patient soit symptomatique, atteint son apogée au moment ou peu de temps après l’apparition des symptômes et peut continuer à être libérée même après la résolution des symptômes de l’individu.

Persistance de l’excrétion du SARS-CoV-2

La durée de l’excrétion virale peut être utilisée pour catégoriser l’infectiosité d’une personne; par conséquent, cette information est cruciale pour la mise en œuvre de stratégies efficaces de prévention des infections, telles que des durées de quarantaine appropriées et des exigences de masque.

Actuellement, l’infection par le SRAS-CoV-2 est confirmée par un test de réaction en chaîne par polymérase (PCR) positif qui peut être effectué, qu’un individu présente ou non des symptômes. Grâce à de tels tests PCR, l’excrétion virale du SARS-CoV-2 a une durée médiane de 12 à 20 jours, avec une persistance pouvant atteindre jusqu’à 63 jours après l’apparition des symptômes initiaux.

Alors qu’il a été constaté qu’environ 90% des cas bénins éliminaient le virus dans un délai moyen de 10 jours après l’apparition des symptômes, les personnes qui se sont remises de la maladie grave ont subi une excrétion prolongée d’ARN viral d’une durée médiane de 31 jours.

En plus de la gravité des symptômes qui est un facteur prédictif de la durée de l’excrétion virale, le lieu d’échantillonnage semble également déterminer le moment où les charges virales maximales se produisent. Dans les voies respiratoires supérieures (URT), par exemple, la charge virale maximale semble se produire entre les jours 4 et 6 suivant l’apparition des symptômes, dans la semaine suivant l’apparition des symptômes, tandis que les charges virales maximales dans les voies respiratoires inférieures semblent survenir plus tard.

L’excrétion virale du SARS-CoV-2 se produit également dans le tractus gastro-intestinal (GI) sous forme de selles jusqu’à 33 jours après un test PCR négatif; cependant, ces charges virales semblent être moins élevées que celles identifiées dans les voies respiratoires et surviennent plus tard. Notamment, l’excrétion virale du SARS-CoV-2 du tractus gastro-intestinal ne semble pas avoir de corrélation avec la gravité de la maladie.

Comment l’excrétion virale contribue-t-elle à sa transmission?

Malheureusement, il reste des informations incertaines sur la proportion de cas de SARS-CoV-2 qui sont asymptomatiques. Les valeurs rapportées des cas asymptomatiques peuvent varier de 1% à 78%.

De plus, il n’est pas clair si ces cas « asymptomatiques » sont vraiment asymptomatiques en ce sens que ces personnes infectées ne présenteront jamais aucun des symptômes viraux, ou sont plutôt présymptomatiques, ce qui signifie que ces personnes n’avaient aucun symptôme au moment de leur test PCR positif, mais ont finalement développé des symptômes plus tard.

Même chez les patients présymptomatiques, le taux plus élevé d’excrétion virale du SRAS-CoV-2 par l’URT est un facteur clé de sa transmissibilité élevée, en particulier par rapport à son prédécesseur génétiquement similaire, le SRAS, qui s’est principalement produit dans les voies respiratoires inférieures.

Pris ensemble, ces facteurs plaident pour que les gouvernements fédéraux du monde entier appliquent les mandats nationaux de masques au grand public, en particulier lorsque les individus se trouvent dans des espaces extérieurs ou intérieurs bondés.

Outre l’excrétion virale qui survient chez les personnes asymptomatiques et/ ou présymptomatiques, cette caractéristique sensible au temps du SARS-CoV-2 peut également contribuer à un large éventail d’efforts de surveillance de la santé publique.

Pendant l’épidémie de SRAS de 2002 et de 2003, ainsi que pendant la pandémie actuelle, les chercheurs ont émis l’hypothèse que des particules virales vivantes présentes dans les matières fécales se déplaçant à travers les tuyaux d’égout pourraient infecter les individus par des aérosols ou des gouttelettes.

L’ARN du SARS-CoV-2 a été détecté couramment dans les selles des patients. Cependant, d’autres preuves sont encore nécessaires pour évaluer les quantités de virus dans les matières fécales et ses capacités de réplication afin de déterminer si une transmission virale fécale-orale est possible.

Combinés à des informations sur la durée de l’excrétion virale du SARS-CoV-2 dans le tractus gastro-intestinal, les chercheurs ont pu tester les réserves d’eaux usées comme méthode de surveillance de la propagation communautaire.

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•  » Clinique Mayo Q & Un podcast: Qu’est-ce que l’excrétion virale? » – Chaîne Youtube de la Clinique Mayo
• Campiolo, C. C., Cevallos, E. C., Assi, M., et al. (2020). Prédicteurs cliniques et moment de l’arrêt de l’excrétion d’ARN viral chez les patients atteints de COVID-19. Journal de Virologie clinique 130. doi: 10.1016/ j.jcv.2020.104577.
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Écrit par

Benedette Cuffari

Après avoir obtenu son Baccalauréat Science sciences en Toxicologie avec deux mineures en espagnol et en Chimie en 2016, Benedette a poursuivi ses études pour compléter son Master en Toxicologie en mai 2018. Pendant ses études supérieures, Benedette a étudié la dermatotoxicité de la mécloréthamine et de la bendamustine; deux agents alkylants à la moutarde à l’azote utilisés en thérapie anticancéreuse.

Citations