Human Microbiome Project
az egészséges emberi test mikroszkópos vizsgálata kimutatta, hogy a mikrobiális sejtek körülbelül tíz-egy arányban meghaladják az emberi sejteket. A HMP kezdete előtt az emberhez kapcsolódó mikrobák bőséges közössége nagyrészt tanulmányozatlan maradt, így az emberi fejlődésre, fiziológiára, immunitásra és táplálkozásra gyakorolt hatásuk szinte teljesen ismeretlen maradt. A HMP-t azzal a küldetéssel hozták létre, hogy gyorsan és széles körben megosztott kutatási erőforrásokat generáljon, lehetővé téve az emberi mikrobiota és anyagcsere képességeinek átfogó jellemzését, valamint az emberi egészségben és betegségben betöltött szerepük elemzését. A HMP által generált információ ma már világszerte elérhető a kutatók és mások számára az emberi egészség megértésére és javítására irányuló erőfeszítések során.
a HMP első fázisa a DNS-szekvencia adatkészletek és számítási eszközök kifejlesztésére összpontosított a mikrobiom jellemzésére egészséges felnőtteknél és specifikus mikrobiomhoz kapcsolódó betegségekben szenvedőknél. A Program etikai, jogi és társadalmi következményei (ELSI) a humán mikrobiom kutatásából eredő kérdéseket értékelték. A HMP második fázisa, az úgynevezett integratív HMP vagy iHMP, több biológiai tulajdonságú integrált adatkészlet létrehozására összpontosított mind a mikrobiomból, mind a gazdaszervezetből idővel specifikus mikrobiomhoz kapcsolódó betegségekben szenvedő embereknél. Az iHMP hosszú távú célja az volt, hogy olyan adatkészleteket és eszközöket dolgozzon ki, amelyeket a közösség felhasználhat annak értékelésére, hogy a mikrobiom és a gazdaszervezet mely biológiai tulajdonságai adnak fontos új betekintést az emberi egészség és betegség megértéséhez.
kiemeli a HMP főbb teljesítmények közé:
- az emberi testből izolált ~3000 referencia baktériumgenom szekvenálása
- A mikrobiom átfogó profilja több mint 300 egészséges embertől
- a világ legnagyobb metagenom szekvencia adatkészlete egy emberi kohorszból
- a világ egyetlen teljes adatkészlete a bakteriális, gombás, vírusos és Protista közösség összetételéről egy emberi kohorszból
- metagenomikus, transzkriptum, fehérje és metabolit profilok integrált adatkészletei mind a mikrobiomból, mind a gazdaszervezetből több emberi kohorszban
- szoftver és online források a microbiome
- iHMP vizsgálatok és adatkészletek koraszülés, gyulladásos bélbetegség, és prediabetes, hogy bővítse a undestanding host/microbiome kölcsönhatások
további információk a HMP beleértve az adatkészletek, eszközök és módszerek kifejlesztett megtalálható ellátogat a HMP Data Analysis and Coordinationng Center honlapján.
a HMP kutatói által felfedezett mikrobiom fontos szerepének példái, kérjük, látogasson el a Program kiemelései oldalra, valamint a közegészségügyi relevancia oldalra.