Minamoto no Yoritomo
Seigan-ji kapuja Nagoyában, az egykori családi villa helyén és szülőhelyén
Yoritomo Minamoto no Yoshitomo harmadik fia volt, a Minamoto (Seiwa Genji) Klán örököse, hivatalos felesége, Urahime pedig Fujiwara no Suenori lánya volt, aki a jeles Fujiwara klán tagja volt. Yoritomo a családi villában született Atsuta ban ben Nagoya, Owari tartomány (a mai Seigan-ji). Abban az időben Yoritomo nagyapja, Minamoto no Tameyoshi volt a Minamoto feje. Mint Benkei, gyermekkori neve Oniwakamaru volt (ons). Seiwa császár leszármazottja volt.
1156-ban az udvar frakcionális megosztottsága nyílt háborúba tört ki a fővárosban. A kolostori Toba császár és fia, Go-Shirakawa császár Fujiwara no tadazane, Fujiwara no Tadamichi és Taira no Kiyomori (az akkori Taira Klán örököse) fia mellé állt,míg Sutoku császár tadazane kisebbik fia, Fujiwara no Yorinaga mellé állt. Ez az úgynevezett H Enterprises lázadás.:210-211, 255
a Minamoto Klán kettészakadt. A klán feje, Tameyoshi, Sutoku mellé állt. Fia, Jositomo (Yoritomo apja) azonban Toba és Go-Shirakawa, valamint Kijomori mellé állt. Végül Go-Shirakawa támogatói megnyerték a polgárháborút, így biztosítva Yoshitomo és Kiyomori győzelmét. Sutokut házi őrizetbe helyezték, Yorinaga pedig halálosan megsebesült a csatában. Tameyoshi-t yoshitomo erői hajtották végre. Ennek ellenére Go-Shirakawa és Kijomori könyörtelenek voltak, Jositomo pedig a Minamoto Klán fejeként találta magát, míg Yoritomo lett az örökös.
Yoritomo és a Minamoto Klán apai ágon a császári családból származott. Ennek ellenére Kiotóban a Taira Klán, most Kiyomori vezetésével, és a Minamoto Klán, Jositomo vezetésével, ismét frakcionálni kezdett.:239-241, 256-257
négy évvel később Kiyomori támogatta Fujiwara no Michinorit. Yoshitomo azonban támogatta Fujiwara no Nobuyori. Ez volt az úgynevezett Heiji lázadás. A volt császári kastélyt felgyújtották, míg Sinzeit elfogták és lefejezték. Ennek ellenére a Minamoto-k nem voltak jól felkészülve, és a Taira átvette Kiotó irányítását. Jositomo elmenekült a fővárosból, de később egy csatlósa elárulta és kivégezte.
ezt követően kemény feltételeket szabtak a Minamotóknak és szövetségeseiknek. Csak Jositomo három fia maradt életben, így Kiyomori és a Taira Klán lett Japán vitathatatlan vezetője.258-260 Yoritomót, a Minamoto új vezetőjét száműzték. Yoritomót Kiyomori nem hajtotta végre Kiyomori mostohaanyjának jogalapjai miatt. Yoritomo testvérei, Minamoto no Noriyori és Minamoto no Yoshitsune is életben maradtak.