szintáz
a Szintázról:
a szintáz olyan enzim, amely katalizálja az új vegyületek szintézisét a szervezetben. Emiatt hihetetlenül gyakori és változatos enzim, amely mind a magasabb, mind az alacsonyabb rendű fajokban megtalálható.
fontos megjegyezni, hogy a szintáz meghatározása az idő múlásával megváltozott. Kezdetben különbség volt a biológiai nómenklatúrában, amely megkülönböztette a szintázokat és a szintetázokat. A szintázok az eredeti meghatározás szerint nem használtak nukleotid-trifoszfátokból származó energiát, mint az ATP, míg a szintetázok igen.
a biokémiai nómenklatúra vegyes bizottsága azonban frissítette a meghatározást, leírva a szintáz mint bármely enzim, amely katalizálja a szintézist, függetlenül az energiaforrástól. Ezután elrendelték, hogy a szintetázok ma már a ligáz szinonimái.
szintáz funkció
a monoterpén szintázok megtalálhatók a növényekben, és segítenek létrehozni azokat a terpéneket, amelyekre szükségük van ahhoz, hogy megvédjék magukat a környezetükben lévő fenyegetésekkel szemben. Érdekes módon a szintázok felhasználhatók a növényen belüli struktúrák hatalmas változatosságának létrehozására,egyes fajok fejlődésük során több mint ezer egyedileg azonosítható struktúrát építenek.
a szintáz szintén kulcsfontosságú a kapszula szerkezetében, szintézisében és szabályozásában. A Streptococcus Pneumoniae-ben 2015-ben megjelent kutatók azt találták, hogy a 3-as és 37-es szerotípusok által használt szintáz CPS bioszintézis nagyon különbözik a múltban leírt mechanizmusoktól.
egyes szintázokat az emberi és állati takarmányozási iparban is alkalmaznak. A Pfa-szintáz például a FAS/PKS bioszintetikus logika egyik példája, amely sokféle molekulát képes előállítani, sok gazdasági alkalmazással. A szintetázok kereskedelmi hasznosítása például az egycellás termelési műveletekben a biokémiai termékek előállításának olcsóbb és energiahatékonyabb módjainak kifejlesztéséhez vezethet.
szintáz kölcsönhatások
a Szintázok különböző módon kölcsönhatásba lépnek más vegyületekkel a biológiai struktúrákban. A szintáz CPS bioszintézisében a CPSs foszfatidilglicerin membránhorgonyon vagy a szintáz enzimen keresztül kapcsolódik a sejthez. Ezért a szintázfüggő CPS bioszintézisben egyetlen enzim felelős a poliszacharidok polimerizációjának több lépéséért. Így a szintáz nemcsak maga indítja el a bioszintézist, hanem összekapcsolja a molekulák láncait is, majd mechanizmust biztosít a szintézis helyén kívüli más szövetekbe történő elosztásra.
szintáz mechanizmusok
a szintázok működésének pontos módja még mindig tudományos vizsgálat tárgya.
a szintáz mechanizmusokkal kapcsolatos korai munka az 5-fluorouridint tartalmazó szubsztrát analógokra összpontosított. A kezdeti vizsgálatok a “Michael-mechanizmust” javasolták, amely magában foglalta a katalitikus Asp és C6 hozzáadását az izomerizált uridin pirimidin gyűrűjéhez.
egy újabb munka azonban kétségbe vonja ezeket a következtetéseket. A Miracco és a Mueller 2011-es ötlete a “glycal mechanizmus” felé mutat.”A kutatók ezt az új mechanizmust feltételezték, miután megfigyelték az epimerizációt az 5-fluorouridin ribózgyűrűjének C2′ helyén az RNS-ben. A kísérlet kimutatta, hogy az enzimatikus aktivitás magyarázatának egyetlen módja a C2′ deprotonálása, majd a glikális köztitermék alkalmazásával történő újra protonálás. A glikális mechanizmus nélkül nem világos, hogy egy ilyen reakció hogyan következhet be.