Human Microbiome Project

mikroskopisk undersøgelse af den sunde menneskelige krop har vist, at mikrobielle celler overstiger humane celler med omkring ti til en. Før starten af HMP forblev dette rigelige samfund af humanassocierede mikrober stort set ustuderet og efterlod deres indflydelse på menneskelig udvikling, fysiologi, immunitet og ernæring næsten helt ukendt. HMP blev oprettet med det formål at generere forskningsressourcer, som hurtigt og bredt blev delt, muliggør omfattende karakterisering af den humane mikrobiota og deres metaboliske evner og analyse af deres rolle i menneskers sundhed og sygdom. Oplysningerne genereret af HMP er nu tilgængelige over hele verden til brug for efterforskere og andre i bestræbelserne på at forstå og forbedre menneskers sundhed.

den første fase af HMP var fokuseret på udvikling af DNA-sekvensdatasæt og beregningsværktøjer til karakterisering af mikrobiomet hos raske voksne og hos mennesker med specifikke mikrobiomassocierede sygdomme. En etisk, juridiske og samfundsmæssige implikationer (ELSI) komponent i programmet evaluerede spørgsmål, der stammer fra human mikrobiomforskning. Den anden fase af HMP, kendt som integrativ HMP eller iHMP, var fokuseret på at skabe integrerede datasæt med flere biologiske egenskaber fra både mikrobiomet og værten over tid hos mennesker med specifikke mikrobiomassocierede sygdomme. Det langsigtede mål med iHMP var at udvikle datasæt og værktøjer, som samfundet kan bruge til at evaluere, hvilke biologiske egenskaber ved mikrobiomet og værten, der giver vigtig ny indsigt i forståelsen af menneskers sundhed og sygdom.

højdepunkter i HMP ‘ s store resultater omfatter:

• sekventering af ~3000 referencebakterielle genomer isoleret fra menneskekroppen
• omfattende profil af mikrobiomet fra over 300 raske mennesker
• verdens største metagenomsekvensdatasæt fra en human kohorte
• verdens eneste komplette datasæt af bakteriel, svampe -, viral og protistisk samfundssammensætning fra en human kohorte
• integrerede datasæt af metagenomiske, transkript -, protein-og metabolitprofiler fra både mikrobiom og Host i flere humane kohorter
• programmel og online ressourcer til at hjælpe med undersøgelsen af microbiome
• iHMP undersøgelser og datasæt i for tidlig fødsel, inflammatorisk tarmsygdom og prediabetes, der udvider vores undestanding af host/microbiome interaktioner

flere oplysninger om HMP herunder datasæt, værktøjer og metoder udviklet kan findes ved at besøge HMP Data Analysis and Coordinationng Center hjemmeside.

for eksempler på vigtige roller for mikrobiomet i human sygdom opdaget af HMP-forskere, kan du besøge programhøjdepunkterne samt siden folkesundhedsrelevans.