Human Microbiome Project

Lo studio microscopico del corpo umano sano ha dimostrato che le cellule microbiche superano le cellule umane di circa dieci a uno. Prima dell’inizio dell’HMP, questa abbondante comunità di microbi associati all’uomo rimase in gran parte non studiata, lasciando la loro influenza sullo sviluppo umano, sulla fisiologia, sull’immunità e sulla nutrizione quasi del tutto sconosciute. L’HMP è stato istituito con la missione di generare risorse di ricerca, che sono state rapidamente e ampiamente condivise, consentendo una caratterizzazione completa del microbiota umano e delle loro capacità metaboliche e l’analisi del loro ruolo nella salute umana e nelle malattie. Le informazioni generate da HMP sono ora disponibili in tutto il mondo per l’uso da parte degli investigatori e di altri nel tentativo di comprendere e migliorare la salute umana.

La prima fase di HMP è stata focalizzata sullo sviluppo di set di dati di sequenza del DNA e strumenti computazionali per caratterizzare il microbioma in adulti sani e in persone con specifiche malattie associate al microbioma. Una componente etica, legale e implicazioni sociali (ELSI) del programma ha valutato i problemi che derivano dalla ricerca sul microbioma umano. La seconda fase di HMP, nota come integrativa HMP o HMP, è stata focalizzata sulla creazione di set di dati integrati di molteplici proprietà biologiche sia dal microbioma che dall’ospite nel tempo in persone con specifiche malattie associate al microbioma. L’obiettivo a lungo termine di iHMP era quello di sviluppare set di dati e strumenti che la comunità può utilizzare per valutare quali proprietà biologiche del microbioma e dell’ospite producono importanti nuove intuizioni nella comprensione della salute umana e della malattia.

I punti salienti delle principali realizzazioni dell’HMP includono:

• Sequenziamento del ~3000 di riferimento del genoma batterico isolato dal corpo umano
• Completa il profilo del microbioma da oltre 300 esseri umani sani
• più grande del Mondo metagenome sequenza di set di dati da un essere umano coorte
• solo il Mondo di set di dati completo di infezioni batteriche, fungine, virali e protista la composizione della comunità da uomo a uomo coorte
• Integrato di set di dati di metagenomica, trascrizione, proteine e metaboliti di profili sia microbioma e host in più umana coorti
• Software e risorse online per aiuto nello studio della microbiome
• iHMP studi e set di dati in parto pretermine, malattia infiammatoria intestinale, e prediabete che espandere il nostro undestanding di host/microbiome interazioni

Ulteriori informazioni sulla HMP compresi i set di dati, strumenti e metodi sviluppati possono essere trovati visitando il sito web HMP Data Analysis and Coordinationng Center.

Per esempi di ruoli importanti per il microbioma nella malattia umana scoperti dai ricercatori di HMP, si prega di visitare la pagina degli highlights del programma e la pagina di rilevanza per la salute pubblica.