プロテイナーゼK
カルシウムによって活性化され、酵素は疎水性アミノ酸(脂肪族、芳香族および他の疎水性アミノ酸)の後に優先的にタンパク質を消化する。 カルシウムイオンは酵素活性に影響を与えませんが、それらはその安定性に寄与します。インキュベーション時間が長く、プロテアーゼ濃度が十分に高い場合、タンパク質は完全に消化されます。 カルシウムイオンを除去すると、酵素の安定性は低下するが、タンパク質分解活性は残る。 プロテイナーゼKは、活性中心の近くに位置しているが、触媒機構に直接関与していないCa2+のための二つの結合部位を持っています。 残留活性は、通常、核酸調製物を汚染するタンパク質を消化するのに十分である。 したがって、核酸の精製のためのプロテイナーゼKによる消化は、通常、EDTA(ヌクレアーゼのような金属イオン依存性酵素の阻害)の存在下で行われる。
プロテイナーゼKは、広いpH範囲(4-12)にわたって安定であり、pH最適値はpH8.0である。37℃から50–60℃までの反応温度の上昇は、0.5-1%ドデシル硫酸ナトリウム(SDS)または塩化グアニジニウム(3M)、チオシアン酸グアニジニウム(1M)および尿素(4M)の添加のように、活性を数回増加させる可能性がある。 上記の条件は、その基質切断部位をよりアクセス可能にすることにより、プロテイナーゼK活性を増強する。 65°Cの上の温度、トリクロロ酢酸(TCA)またはセリンプロテアーゼ抑制剤AEBSF、PMSFまたはDFPは活動を禁じます。 プロテイナーゼKは、塩化グアニジニウム、チオシアン酸グアニジニウム、尿素、サルコシル、トリトンX−1 0 0、Tween2 0、SDS、クエン酸塩、ヨード酢酸、EDTA、またはNa−トシル−Lysクロロメチルケトン(TLCK)およびNa−トシル−Pheクロロメチルケトン(TPCK)のような他のセリンプロテアーゼ阻害剤によって阻害されない。
一般的に使用される緩衝液中のプロテアーゼK活性
緩衝液(pH=8.0、50℃、1.25μ g/mLプロテアーゼK、15分間インキュベーション) | プロテイナーゼK活性(%) |
---|---|
30 mMトリス-クロ | 100 |
30 mMトリス・Cl;30mM EDTA; 5%Tween20;0.5%Triton X-100;800mM GuHCl | 313 |
36 mM Tris*Cl;36mM EDTA;5%Tween20;0.36%Triton X-100;735mM GuHCl;36mM EDTA;5%Tween20;0.36%Triton X-100;735mM GuHCl | 301 |
10 Mmトリス・Cl;25mM EDTA;100mM NaCl;0.5%SDS;25mM EDTA;100mM NaCl;0.5% | 128 |
10 mMトリス・Cl;100MM EDTA;20mM NaCl;1%サルコシル | 74 |
10 mM Tris·Cl;50mM KCl;1.5mM Mgcl2;0.45%Tween20;0.5%Triton X;0.45%Tween20;0.45%Tween20;0.5%Triton X-100 | 106 |
10 mM Tris*Cl;100mM EDTA;0.5%のSDS | 120 |
30 Mmトリス・Cl;10mM EDTA;1%SDS | 203 |