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タンパク質またはペプチドのアミノ酸配列は、Pehr Edmanによって開発されたEdman degradationによって同定することができます。 この方法は、他のアミノ酸残基間のペプチド結合を破壊することなく、n末端からペプチドを標識して切断することができる。 エドマン分解反応は1967年にエドマンとベッグスによって自動化された。 この頃は、自動化されたEdmanの低下（蛋白質のsequenator）は広く使用され、ペプチッドを50までアミノ酸配列できます。

Edman-degradation-1

フェニルイソチオシアネートとＮ末端残基の遊離アミノ基との反応に基づくペプチドの環状分解により，アミノ酸が一度に一つずつ除去され，それらのフェニルチオヒダントイン誘導体として同定された。 特定のプロセスに言えば、荷を積まれていないペプチッドはphenylthiocarbamoyl派生物（PTCペプチッド）を与えるためにアミノの末端のphenylisothiocyanate（PITC）と穏やかにアルカリ条件の下で 次に、酸性条件下では、誘導体のチオカルボニル硫黄がN末端アミノ酸のカルボニル炭素を攻撃する。 最初のアミノ酸はanilinothiazolinoneの派生物（ATZアミノ酸）として開裂され、ペプチッドの残りは隔離され、次の低下周期に服従させることができます。 形成されると、このチアゾロン誘導体はフェニルチオカルバミル誘導体よりも安定である。 ATZのアミノ酸はエチルacerateとの抽出によってそれから取除かれ、phenylthiohydantoinの派生物（PTHアミノ酸）に変えられます。 そしてクロマトグラフィーが各周期によって発生するPTHの残余を識別するのに使用することができます。

自動化されたEdman分解に関しては、tfaフィルターに溶液中で適用し、Edman sequencing instrumentにロードすることによってタンパク質を分析することができます。 混合物中のタンパク質は、最初に1Dまたは2Dゲルによって分離され、次にPVDF膜上にブロットされる。 蛋白質はCoomassieの青、Amidoの黒またはPoncau Sの汚損によって検出され、目的の蛋白質は切り取られ、Edmanのsequencerに荷を積まれるPVDFの膜の部分。

質量分析法が開発されたことで、エドマン分解シークエンシングの使用が減少し始めました。 しかし、それは静止しているいくつかのタイプのタンパク質構造解析アプリケーションのための方法のままである。 それは組換え蛋白質のN末端の境界を確認するか、または特に蛋白質か範囲が>40から80kDaであるか、または容易に浄化することができないときプロテアーゼ抵抗力がある範囲のn末端を定めるのに使用することができます。 またそれが蛋白質の片の新しいN末端および蛋白質分解開裂部位を識別するのに使用することができます。 さらに、配列データベースがＭＳ／ＭＳデータベース検索のために利用できないいくつかの新規タンパク質およびペプチドに関して、Ｅｄｍａｎ分解を分析に使用することが

タンパク質のN末端アミノ酸を切断することができる。 したがって、このプロセスでは、最初のサイクルは、したがって、正確なN末端アミノ酸を同定する。 また、放出されたアミノ酸はクロマトグラフィーによって同定され定量されるため、同一の分子量を有するアミノ酸を同定することができる。 例えば、イソロイシンとロイシンは113Daの質量を有するが、それらは異なる保持時間を有する。 さらに、Edmanの配列決定は混合物の蛋白質のn末端の配列決定を可能にする1Dおよび2DゲルからのPVDFのしみで行うことができます。 しかしながら、Ｅｄｍａｎ分解配列決定は、そのｎ末端が化学的に修飾されているペプチド、例えばアセチル化されている場合には利用できないであろう。 そしてPITCが非αアミノ酸と反応できないので非αアミノ酸がisoaspartic酸のように見つけられれば配列決定は停止します。 さらに、より大きい蛋白質はEdmanの配列決定によって配列決定することができません。

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