가상 셀
가상 셀 모델은 계층적 트리 구조를 갖는다. 트렁크 레벨은 구획,종 및 화학 반응,농도의 기능인 반응 속도로 구성된”생리학”입니다. 종의 초기 농도를 감안할 때,브이셀은 이러한 농도가 시간이 지남에 따라 어떻게 변하는지를 계산할 수 있습니다. 이러한 수치 시뮬레이션이 수행되는 방법은 시뮬레이션이 결정적인지 확률 적인지,공간적 또는 구획적인지 여부를 지정하는 여러”응용 프로그램”을 통해 결정됩니다; 여러”응용 프로그램”은 초기 농도,확산 계수,유속 및 다양한 모델링 가정을 지정할 수도 있습니다. 따라서”응용 프로그램”은 생리적 시스템에 대한 아이디어를 테스트하기위한 계산 실험으로 볼 수 있습니다. 각”응용 프로그램”은 수학 설명에 해당하며,이 설명은 자동으로 수학 설명 언어로 번역됩니다. 매개 변수 검사 및 솔버 사양 변경을 포함한 여러”시뮬레이션”을 각”응용 프로그램”내에서 실행할 수 있습니다.
모델은 단순한 것에서 매우 복잡한 것까지 다양 할 수 있으며 실험 데이터와 순전히 이론적 인 가정의 혼합물을 나타낼 수 있습니다.
가상 셀은 인터넷을 통한 분산 응용 프로그램이나 독립 실행형 응용 프로그램으로 사용할 수 있습니다. 그래픽 사용자 인터페이스를 통해 구획 치수 및 모양,분자 특성 및 상호 작용 매개 변수와 같은 생물학적으로 관련된 용어로 복잡한 모델을 구성 할 수 있습니다. 미분 방정식의 동등한 수학적 시스템으로 생물학적 설명을 변환합니다. 사용자는 일반적인 그래픽 인터페이스에서 개략적 인 생물학적 뷰와 수학적 뷰 사이를 앞뒤로 전환 할 수 있습니다. 실제로 사용자가 원하는 경우 개략도를 우회하여 수학적 설명을 직접 조작 할 수 있습니다. 가상셀은 사용자가 숫자 해법을 선택하여 수학적 설명을 시뮬레이션 수행을 위해 실행되는 소프트웨어 코드로 변환할 수 있도록 합니다. 결과는 온라인으로 표시 할 수 있습니다,또는 수출 형식의 다양한 사용자의 컴퓨터에 다운로드 할 수 있습니다. 가상 셀 라이센스를 통해 과학 커뮤니티의 모든 구성원에게 무료로 액세스 할 수 있습니다.
사용자는 미국 코네티컷의 서버에서 유지 관리되는 브이셀 데이터베이스에 자신의 모델을 저장할 수 있습니다. 사용 권한이있는 액세스 제어 시스템을 사용하여 사용자가 모델을 비공개로 유지 관리하거나 선택한 공동 작업자와 공유하거나 공개 할 수 있습니다. 이 웹 사이트는 공개 및 연구 출판물과 관련된 모델의 검색 가능한 목록을 유지 관리합니다.
