레카

레카는 유전자의 수리 및 유지에 필수적인 38 킬로달톤 단백질입니다. 레카 구조 및 기능적 동족은 심각하게 추구 된 모든 종에서 발견되었으며 이러한 종류의 상동 유전자 복구 단백질의 원형으로 사용됩니다. 상동 단백질은 진핵 생물에서 라다 51,고세균에서 라다라고합니다.

structures / ECOD

RCSB PDB; PDBe; 596>

구조 요약

레카 박테리아 재조합 단백질

이 복합체의 결정 구조는 다음과 같습니다. 2018 년 11 월 13 일
Identifiers
Symbol RecA
Pfam PF00154
Pfam clan CL0023
InterPro IPR013765
PROSITE PDOC00131
SCOP2 2reb / SCOPe / SUPFAM
Available protein structures: Pfam PDB

레카에는 여러 가지 활동이 있으며 모두 유전자 수리와 관련이 있습니다. 박테리아 조난 신호 반응에서,그것은 렉사 억압 기 및 제 1 억압 기의자가 촉매 절단에 공 프로테아제 기능을 갖는다.

RecA 협회와 DNA 는 주요에 따라 그것의 중심적인 역할을에서 일치하는 재결합입니다. 레카 단백질은 핵단백질 필라멘트를 형성하기 위해 강하게 그리고 긴 클러스터에 결합한다. 단백질은 하나 이상의 유전자 결합 부위를 가지므로 단일 가닥과 이중 가닥을 함께 보유 할 수 있습니다. 이 기능은 단일 좌초 유전자의 상보 영역 사이의 유전자 시냅 시스 반응을 촉매하는 것을 가능하게합니다. 이 필라멘트는 시퀀스 유사성을 검색합니다. 레카,루프 2 의 무질서 유전자 루프에는 유전자 상동 재조합을 담당하는 잔류 물이 포함되어 있습니다. 일부 박테리아에서 루프 2 의 세린 잔기의 인산화를 통한 레카 전이 후 변형은 상동 재조합을 방해 할 수 있습니다.

검색 프로세스는 시퀀스 보완 인식(구조적 교정 이라고 하는 메커니즘)을 향상 시킵니다. 이 반응은 두 개의 재조합 이중 나선 사이의 가닥 교환을 시작합니다. 시냅 시스 이벤트 후 이종 이중 영역에서 분기 마이그레이션이라는 프로세스가 시작됩니다. 분기 마이그레이션에서 단일 가닥 중 하나의 쌍을 이루지 않은 영역은 다른 단일 가닥의 쌍을 이룬 영역을 대체하여 기본 쌍의 총 수를 변경하지 않고 분기점을 이동합니다. 자발적인 분기 마이그레이션이 발생할 수 있지만,일반적으로 양방향으로 동일하게 진행되므로 효율적으로 재조합을 완료 할 가능성은 거의 없습니다. 레카 단백질은 단방향 분기 마이그레이션을 촉매하고 그렇게함으로써 재결합을 완료 할 수 있습니다,긴 염기쌍의 수천 헤테로 이중 유전자의 영역을 생산.

[잡담][2018-09-11 00:00:00][2018-09-21 00:00:00]

대장균에서 레카에 의해 매개되는 상동 재조합 사건은 자매 유전자좌가 가까이 남아있는 유전자 복제 후 기간 동안 발생할 수 있습니다. 레카는 또한 상 동성 페어링,상 동성 재조합 및 대장균 세포의 반대쪽 절반으로 분리 된 먼 자매 유전자좌 사이의 유전자 파괴 수리를 중재 할 수 있습니다.

레카 결핍 대장균 균주는 분자 생물학 실험실에서 복제 절차에 유용합니다. E. 대장균 균주는 종종 돌연변이 레카 대립 유전자를 포함하도록 유전자 변형되어 플라스미드로 알려진 염색체 외 분절의 안정성을 보장합니다. 변형이라는 과정에서 플라스미드는 다양한 조건에서 박테리아에 의해 흡수됩니다. 외인성 플라스미드를 함유 한 박테리아를”변형제”라고합니다. 변형 제 복구 하 고 다른 응용 프로그램에서 사용할 수 있도록 세포 분열에 걸쳐 플라스미드를 유지 합니다. 기능성 레카 단백질이 없으면 외인성 플라스미드는 박테리아에 의해 변경되지 않습니다. 박테리아 배양에서 이 플라스미드를 정제하면 원래의 플라스미드 서열의 고 충실도 증폭이 가능합니다.