Human Microbiome Project

Mikroskopisk studie av den sunne menneskekroppen har vist at mikrobielle celler overgår menneskelige celler med om lag ti til en. Før STARTEN av HMP, dette rikelig fellesskap av menneskeassosierte mikrober forble i stor grad unstudied, forlater sin innflytelse på menneskelig utvikling, fysiologi, immunitet, og ernæring nesten helt ukjent. HMP ble etablert med oppdrag å generere forskningsressurser, som ble raskt og bredt delt, slik at omfattende karakterisering av den menneskelige mikrobiota og deres metabolske evner og analyse av deres rolle i menneskers helse og sykdom. Informasjonen som genereres AV HMP er nå tilgjengelig over hele verden for bruk av etterforskere og andre i arbeidet med å forstå og forbedre menneskers helse.

den første fasen AV HMP var fokusert på utvikling AV DNA-sekvensdatasett og beregningsverktøy for å karakterisere mikrobiomet hos friske voksne og hos personer med spesifikke mikrobiomassosierte sykdommer. EN Etisk, Juridisk Og Samfunnsmessig Implikasjoner (ELSI) del av programmet evaluerte problemer som oppstår fra menneskelig mikrobiomforskning. Den andre fasen av HMP, kjent som den integrerende hmp eller iHMP, var fokusert på å skape integrerte datasett av flere biologiske egenskaper fra både mikrobiomet og verten over tid hos mennesker med spesifikke mikrobiomassosierte sykdommer. Det langsiktige målet med iHMP var å utvikle datasett og verktøy som samfunnet kan bruke til å evaluere hvilke biologiske egenskaper av mikrobiomet og verten gir viktig ny innsikt i å forstå menneskers helse og sykdom.

Høydepunkter AV HMP store prestasjoner inkluderer:

  • Sekvensering av ~3000 referanse bakterielle genomer isolert fra menneskekroppen
  • Omfattende profil av mikrobiomet fra over 300 friske mennesker
  • Verdens største metagenom-sekvensdatasett fra en menneskelig kohort
  • Verdens eneste komplette datasett av bakteriell, sopp, viral og protist samfunnssammensetning fra en menneskelig kohort
  • integrerte datasett av metagenomiske, transkripsjons -, protein-og metabolittprofiler fra både mikrobiom og vert i flere humane kohorter
  • programvare og elektroniske ressurser til hjelp i studien av mikrobiom
  • iHMP studier og datasett i prematur fødsel, inflammatorisk tarmsykdom og prediabetes som utvider vår undestanding av vert / mikrobiom interaksjoner

Mer informasjon om HMP inkludert datasett, verktøy og metoder utviklet kan bli funnet ved å besøke hmp Data Analysis And Coordinationng Center nettsted.

for eksempler på viktige roller for mikrobiomet i menneskelig sykdom oppdaget AV hmp-forskere, vennligst besøk programhøydesiden samt folkehelsens relevansside.