Hva er forskjellen mellom ikke-homolog slutt sammenføyning (NHEJ) og homologi-rettet reparasjon (HDR)?

CRISPR-genomredigering utnytter Cas9s evne til å indusere målrettede DNA-dobbelttrådbrudd (Dsb), vanligvis noen få nukleotider oppstrøms av pam-sekvensen. Den etterfølgende reparasjon av kromosomale Dsb av cellen kan klassifiseres i to kategorier av reparasjonsveier: ikke-homolog endeforbindelse (NHEJ) og homologi-rettet reparasjon (HDR). Kjernen KAN nhej-break-ender ligeres uten en homolog mal, MENS HDR-pauser krever en mal for å veilede reparasjon.
NHEJ er en meget effektiv reparasjonsmekanisme som er mest aktiv i cellen. Det er også utsatt for hyppige mutasjonsfeil på grunn av nukleotidinnsatser og slettinger (indels). HDR regnes som den dominerende mekanismen for presis dsb-reparasjon, men lider av lav effektivitet da det krever høyere sekvenslikhet mellom de avskårne og intakte donorstrengene AV DNA. Det er færre feil eller sjanser for mutasjoner hvis DNA-malen som brukes under reparasjon, er identisk med den opprinnelige ubeskadigede DNA-sekvensen.1,2
når man gjør endringer i et gen ved HJELP AV CRISPR, vil populasjonen av transfiserte celler inneholde en kombinasjon AV NHEJ-reparerte og HDR-reparerte alleler. HDR-redigert DNA er mye mer onskelig for a sikre kontrollerte modifikasjoner.

1. H. Ghezraoui, et al., «Kromosomale translokasjoner i humane celler genereres av kanonisk ikke-homologe end-sammenføyning,» Mol Cell 55(6):829-842, 2014.
2. M. Jasin Og R. Rothstein. «Reparasjon Av Strandbrudd Ved Homolog Rekombinasjon,» Cold Spring Harb Perspect Biol 2013.