Henry Morgenthau Sr.
als een vroege Wilson supporter, Morgenthau nam aan dat Wilson hem zou benoemen tot een kabinet-niveau positie, maar de nieuwe President had andere plannen voor hem. Net als andere prominente Joodse Amerikanen, Oscar Straus en Solomon Hirsch voor hem, werd Morgenthau benoemd tot ambassadeur in het Ottomaanse Rijk. Wilson ‘ s aanname dat Joden op de een of andere manier een brug tussen islamitische Turken en christelijke Armeniërs vertegenwoordigden rankled Morgenthau; in antwoord Wilson verzekerde hem dat de Porte in Istanbul “was het punt waarop de belangstelling van de Amerikaanse Joden in het welzijn van de Joden van Palestina is gericht, en het is bijna onmisbaar dat ik een Jood in die post”. Hoewel geen Zionist zelf, Morgenthau bezorgd “fervidly” over de benarde situatie van zijn geloofsgenoten. Hij verwierp het standpunt aanvankelijk, maar na een reis naar Europa, en met de aanmoediging van zijn pro-Zionistische vriend Rabbi Stephen Wise, heroverweegde hij zijn beslissing en accepteerde Wilson ‘ s aanbod. In 1913 werd hij benoemd tot ambassadeur van de Verenigde Staten in het Ottomaanse Rijk.Hoewel de veiligheid van Amerikaanse burgers in het Ottomaanse Rijk, voornamelijk christelijke missionarissen en Joden, al vroeg in zijn ambassadeurschap groot was, zei Morgenthau dat hij zich het meest bezighield met de Armeense kwestie. Na het uitbreken van de oorlog in 1914, de VS de Amerikaanse ambassade – en bij uitbreiding Morgenthau-vertegenwoordigde bovendien veel van de geallieerden in Constantinopel (Istanbul), omdat ze hun diplomatieke missies hadden teruggetrokken vanwege de vijandelijkheden. Toen de Ottomaanse autoriteiten begonnen met de Armeense Genocide in 1914-1915, overspoelden de Amerikaanse consuls die in verschillende delen van het rijk woonden het Bureau van Morgenthau met verslagen die bijna elk uur de slachtingen en deportatiemarsen documenteerden. Geconfronteerd met het accumulerende bewijs, informeerde hij officieel de VS. regering van de activiteiten van de Ottomaanse regering en vroeg Washington om in te grijpen.
de Amerikaanse regering wilde zich echter niet laten meeslepen in geschillen, maar bleef destijds een neutrale macht in het conflict en gaf weinig officiële reactie. Morgenthau hield bijeenkomsten op hoog niveau met de leiders van het Ottomaanse Rijk om de positie van de Armeniërs te helpen verlichten, maar de Turken zagen af en negeerden zijn protestaties. Hij vermaande de Ottomaanse minister van Binnenlandse Zaken Talaat Pasha met de woorden: “ons volk zal deze bloedbaden nooit vergeten.”Terwijl de slachtingen onverminderd doorgingen, besloten Morgenthau en een aantal andere Amerikanen om een publiek fondsenwervingscomité te vormen om de Armeniërs te helpen-het Comité voor Armeense wreedheden (later omgedoopt tot het Nabije Oosten Relief) – om meer dan $100 miljoen aan hulp op te halen, het equivalent van $1 miljard vandaag. Door zijn vriendschap met Adolph Ochs, uitgever van de New York Times, zorgde Morgenthau er ook voor dat de massamoorden prominent aandacht bleven krijgen. De New York Times publiceerde alleen al in 1915 145 artikelen.In 1916 nam hij ontslag uit het ambt van ambassadeur, omdat hij verbolgen was over zijn relatie met de Ottomaanse regering. Terugkijkend op die beslissing in Zijn the Murder of a Nation, schreef hij dat hij Turkije was gaan zien als “een plaats van horror. Ik had het einde van mijn middelen bereikt. Ik vond mijn verdere dagelijkse omgang met mannen ondraaglijk, hoe vriendelijk en meegaand ook … die nog stonken van het bloed van bijna een miljoen mensen. Hij publiceerde zijn gesprekken met Ottomaanse leiders en zijn verslag van de Armeense genocide in 1918 onder de titel Ambassador Morgenthau ‘ s Story.In juni 1917 vergezelde Felix Frankfurter Morgenthau, als vertegenwoordiger van het Ministerie van oorlog, op een geheime missie om Turkije te overtuigen de centrale machten in de oorlog op te geven. De missie had als doel”de toestand van de Joodse gemeenschappen in Palestina te verbeteren”. In 1918 gaf Morgenthau publieke toespraken in de Verenigde Staten waarin werd gewaarschuwd dat de Grieken en Assyriërs werden onderworpen aan de” dezelfde methoden “van deportatie en” grootschalige slachting ” als de Armeniërs, en dat twee miljoen Armeniërs, Grieken en Assyriërs al waren omgekomen.