Northern blot

een northernblot is een laboratoriummethode die wordt gebruikt om specifieke RNA-moleculen te detecteren onder amixtuur van RNA. Het noordelijke bevlekken kan worden gebruikt om een steekproef van RNA van aparticulair weefsel of celtype te analyseren om de uitdrukking van RNA van particulaire genen te meten. Deze methode werd genoemd naar de gelijkenis met de techniek die bekend staat als een zuidelijke vlek.

de eerste stap in een noordelijke vlek is het denatureren of scheiden van het RNA in de steekproef tot enkele strengen, waardoor de strengen worden ontvouwd en er geen binding tussen de strengen is. De molecules van RNA worden dan gescheiden volgens hun grootte gebruikend een methode genoemd gelelektroforese. Na scheiding, wordt RNA overgebracht van het gel op een het bevlekken membraan.(Hoewel deze stap is wat geeft de techniek de naam “northern blotting,” de term wordt meestal gebruikt om de hele procedure te beschrijven.) Zodra de transferis voltooid, draagt het bevlekkende membraan alle banden van RNA oorspronkelijk op het gel. Vervolgens wordt het membraan behandeld met een klein stuk van de sonde van DNA of van RNA calleda, die is ontworpen om een opeenvolging te hebben die aan aparticulaire opeenvolging van RNA in de steekproef complementair is; dit staat de sonde toe om, orbind, aan een specifiek fragment van RNA op het membraan te kruisen. Bovendien heeft de sonde alabel, die typisch een radioactief atoom of een fluorescente kleurstof is. Aldus, na kruising, staat de sonde de molecule van RNA van belang toe aan bedetected van onder de vele verschillende molecules van RNA op het membraan.