Cohesin

Cohesins są kompleksami białkowymi w kształcie pierścienia, których wiele funkcji zależy głównie od ich zdolności do Zbliżenia dwóch różnych cząsteczek DNA lub dwóch odległych części tej samej cząsteczki DNA w bliską odległość. Pierwotnie odkryte ze względu na ich zasadniczą rolę w siostrzanej spójności chromatyd (SCC), stwierdzono, że uczestniczą w różnych procesach jądrowych, takich jak montaż fabryk replikacji DNA, naprawa dwuniciowych przerw DNA (DSB), kondensacja chromosomów i morfologia, Kontrola transkrypcji, rearanżacja receptora limfocytów T i montaż wrzeciona mitotycznego (ostatnie recenzje patrz Haering & Jessberger, 2012; Merkenschlager, 2010; Nasmyth, 2011; Nasmyth & Haering, 2012 2009; Wood, Severson, & Meyer, 2010). Kohezyny są niezbędne w mejozie, gdzie odgrywają kilka ról, które są omówione w niniejszym przeglądzie. Cohesin core complex (rys. 1.1 A) opiera się na heterodimerze dwóch białek SMC (strukturalne utrzymanie chromosomów), SMC1 i SMC3, które łączą się ze sobą z wysokim powinowactwem poprzez ich Centralne domeny zawiasowe. Białko α-kleisin (SCC1, zwane także RAD21 / MCD1) zamyka pierścień poprzez interakcję z kulistymi domenami końcowymi białek SMC. Rozszczepienie α-kleisyny przy przejściu metafazy do anafazy rozwiązuje spójność i umożliwia segregację chromosomów. Czwarte białko o nazwie SA (antygen stromalny, zwany także SCC3) wiąże się ze składnikiem α-kleisin pierścienia trójdzielnego. Dokładne funkcje białek SA pozostają niejasne, ale biorą one udział w zależnym od fosforylacji szlaku uwalniania kohezyny (patrz punkt 4). W ssaczych komórkach somatycznych dwa różne białka SA, SA1 i SA2, ulegają ekspresji z dwóch różnych genów i wykazano, że odpowiadają za niektóre z funkcjonalnej różnorodności kompleksów kohezyn. Bardzo niedawno wykazano, że utrata SA1 powoduje śmiertelność zarodków, defekty segregacji chromosomów, aneuploidię i specyficzne zmiany we wzorcach transkrypcji, podczas gdy spójność centromeryczna zależy od SA2 (Remeseiro, Cuadrado, Carretero i in., 2012; Remeseiro, Cuadrado, Gomez-Lopez, Pisano, & Losada, 2012). Oprócz tych dwóch różnych podjednostek SA, komórki mejotyczne wyrażają trzecie białko SA (SA3, zwane również STAG3), ponownie z innego genu, dostarczając komórkom mejotycznym jeszcze większą liczbę różnych kompleksów kohezyn do wykonywania różnych funkcji. Jednak różnorodność w mejocytach jest jeszcze większa: jeden dodatkowy gen kodujący białko typu SMC1 (SMC1ß) i dwa inne geny kodujące białka α-kleisin (RAD21L i REC8) ulegają ekspresji wyłącznie w mejocytach, rozszerzając możliwą kombinację do co najmniej 18 różnych kompleksów rdzenia kohezynowego podczas mejozy. Biorąc pod uwagę czynniki związane z kohezyną i/lub regulacyjne, o których bardzo niewiele wiadomo w komórkach mejotycznych, liczba ta prawdopodobnie wzrośnie jeszcze bardziej; na przykład dwa paralogi czynnika pds5 związanego z kohezyną (PDS5A i PDS5B) współistnieją w komórkach somatycznych (Losada, Yokochi, & Hirano, 2005). Dane eksperymentalne potwierdziły istnienie co najmniej sześciu kompleksów (Jessberger, 2011; Uhlmann, 2011).

rysunek 1.1. Kohezyna w mejozie. A) Model pierścienia kohezynowego otaczającego dwie chromatydy. SMC3 (szary) występuje we wszystkich kompleksach kohezyn. Istnieją dwa geny i białka SMC1: SMC1a (ciemnoniebieski) i smc1ß specyficzny dla mejozy (Jasnoniebieski). Pierścień trójdzielny zamyka się poprzez skojarzenie podjednostki α-kleisin, z której istnieją trzy warianty: wszechobecny RAD21 (ciemny turkus) i dwie formy specyficzne dla mejozy, REC8 i RAD21L (jasny turkus). Trzeci składnik, którego istnieją trzy warianty, wiąże się z kompleksem poprzez wiązanie z α-kleisin: kanoniczny SA1 lub SA2 (Ciemnopomarańczowy) lub specyficzny dla mejozy STAG3 (SA3) (Jasnopomarańczowy). Obciążenie kompleksu kohezynowego na chromosomy i jego utrzymanie na chromosomach jest kontrolowane przez czynniki obciążające, czynniki establishment i antyestablishment. Ładowanie kompleksu kohezyny na chromosomy mitotyczne odbywa się przez kompleks SCC2-SCC4 (kollerin) i dysocjację kohezyny przez pds5-WAPL (releasin). Acetylotransferazy kohezynowe (ESCO1 i ESCO2) są niezbędne do ustanowienia spójności w mitotycznej fazie s poprzez acetylację SMC3, która rekrutuje Sororynę, czynnik podtrzymujący, który przeciwdziała aktywności releasin podczas mitotycznych faz S I G2. B) schemat etapów mejotycznych od (i) do (ix), pokazujący postęp jednej pary homologicznych chromosomów (jeden czerwony i drugi niebieski, każdy narysowany jako dwie pojedyncze linie reprezentujące chromatydy siostrzane bez pętli chromatyny w celach ilustracyjnych) przez różne etapy. W rzeczywistości postęp jest ciągły. Obecność specyficznych białek kohezynowych, o ile jest znana, jest przedstawiona w dolnych częściach paneli (nie bierze się pod uwagę ani względnych ilości, ani potencjalnych oddziaływań między podjednostkami). Istnieją sprzeczne doniesienia na temat obecności białek kohezyn na niektórych etapach. W takich przypadkach spójniki są przedstawione w niekolorowych polach. O SA1 jest bardzo mało informacji. Przedstawione tutaj dane oparte są na analizach spermatocytów. (i) podczas fazy s przedmeiotycznej nowo utworzone chromatydy siostrzane (czerwone lub niebieskie) są utrzymywane razem przez kompleksy kohezynowe (nie pokazano). Obecne są podjednostki kohezyny mitotycznej. Specyficzny dla mejozy SMC1ß nie jest jeszcze obecny; jednak REC8, RAD21L, a także być może STAG3 w kilku komórkach zaczynają już ulegać ekspresji; (ii) podczas leptotenu chromosomy zaczynają się kondensować i tworzą się elementy osiowe, STAG3 i SMC1ß są teraz obecne na chromosomach; (iii) synapsis homologicznych chromosomów rozpoczyna się podczas zygotenu, ułatwione przez częste DSBS DNA, z których jeden jest reprezentowany we wstawce, dsbs są inicjowane w leptotenie; (iv) tworzenie SC jest kompletne w pachytene z wszystkimi homologami w pełni synapsed, rekombinacja mejotyczna przebiega zgodnie ze wskazaniami we wstawce; (v) zwrotnice (pokazano dwa przykłady), które powstały między homologami podczas pachytenu, fizycznie łączą homology razem w diplotenie. Na tym etapie SC w dużej mierze się rozpada, jednak zostaje zachowana siostrzana spójność chromatyd. Oocyty zatrzymają się wkrótce po tym etapie, na etapie zwanym aresztowaniem dyktatorskim—nie pokazanym) – przez wiele lat u ludzi—i spójność musi być utrzymana w tym czasie; (vi) w metafazie i przyczepione wrzeciona powstają w jedno zorientowanych centromerach homologów, a chiasmata nadal opiera się siłom ciągnącym mikrotubule; (vii) rozszczepienie podjednostki α-kleisin kohezyny przez separazę powoduje rozdzielenie homologów, gdy chiasmata ustępuje przy braku spójności ramienia. Spójność centromeryczna jest chroniona przez Shugoshin/PP2A (nie pokazano) i pulę defosforylowanych podjednostek kohezyn; (viii) chromatydy siostrzane wyrównują się na płytce metafazy podczas metafazy II, a mikrotubule wrzeciona przyłączają się do biorientowanych kinetochorów; (ix) spójność jest tracona, a chromatydy siostrzane są rozrywane w anafazie II, tworząc haploidalne gamety.