syntaza
o Syntazie:
syntaza jest enzymem katalizującym syntezę nowych związków w organizmie. Z tego powodu jest to niezwykle powszechny i zróżnicowany enzym występujący zarówno w gatunkach wyższego, jak i niższego rzędu.
należy zauważyć, że definicja tego, co stanowi syntazę, zmieniała się z czasem. Początkowo istniała różnica w nomenklaturze biologicznej, która różnicowała syntazy i syntetazy. Syntazy, zgodnie z pierwotną definicją,nie wykorzystywały energii z trifosforanów nukleotydów, jak ATP, podczas gdy syntetazy.
jednak Wspólna Komisja Nomenklatury biochemicznej zaktualizowała definicję, opisując syntazę jako każdy enzym katalizujący syntezę, niezależnie od źródła energii. Następnie udali się do dekretu, że syntetazy są teraz synonimami ligazy.
funkcja syntazy
syntazy Monoterpenowe znajdują się w roślinach i pomagają im tworzyć terpeny, których potrzebują do obrony przed zagrożeniami w ich środowisku. Co ciekawe, syntazy mogą być wykorzystywane do tworzenia ogromnej różnorodności struktur wewnątrz rośliny, przy czym niektóre gatunki budują w swoim rozwoju ponad tysiąc indywidualnie identyfikowalnych struktur.
syntaza ma również kluczowe znaczenie w strukturze kapsułek, syntezie i regulacji. Naukowcy publikujący w Streptococcus Pneumoniae w 2015 roku odkryli, że biosynteza syntazy CPS, stosowana przez serotypy 3 i 37, bardzo różni się od mechanizmów opisanych w przeszłości.
niektóre syntazy są również stosowane w przemyśle żywienia ludzi i zwierząt . Syntaza Pfa, na przykład, jest przykładem logiki biosyntetycznej FAS / PKS, która może wytwarzać różnorodne cząsteczki o wielu zastosowaniach ekonomicznych. Na przykład komercyjne wykorzystanie syntaz w produkcji pojedynczych komórek może prowadzić do opracowania tańszych i bardziej energooszczędnych sposobów wytwarzania produktów biochemicznych.
interakcje syntazy
syntazy oddziałują z innymi związkami w strukturach biologicznych na różne sposoby. W biosyntezie syntazy CPS, CPSs przyłącza się do komórki za pomocą kotwicy membranowej fosfatydyloglicerolu lub enzymu syntazy. Dlatego w biosyntezie CPS zależnej od syntazy, pojedynczy enzym jest odpowiedzialny za wiele etapów polimeryzacji polisacharydów. Tak więc syntaza nie tylko inicjuje samą biosyntezę, ale także łączy łańcuchy cząsteczek, a następnie zapewnia mechanizm ich dystrybucji do innych tkanek zewnętrznych do miejsca syntezy.
mechanizmy syntazy
dokładny sposób działania syntaz jest nadal kwestią badań naukowych.
wczesne prace nad mechanizmami syntazy skupiały się na analogach substratów zawierających 5-fluorourydynę. Wstępne badania sugerowały „Mechanizm Michaela”, który obejmował dodanie katalitycznego Asp i C6 do pierścienia pirymidynowego izomeryzowanej urydyny.
nowsze prace budzą jednak te wnioski w wątpliwość. Pomysł miracco i Muellera z 2011 roku wskazuje na ” mechanizm glikalny.”Naukowcy postulowali ten nowy mechanizm po obserwacji epimeryzacji w miejscu C2′ pierścienia rybozowego 5-fluorourydyny w RNA. Eksperyment wykazał, że jedynym sposobem na Wyjaśnienie aktywności enzymatycznej było deprotonowanie C2′, a następnie ponowne protonowanie przy użyciu półproduktu glikolowego. Bez mechanizmu glikolowego nie jest jasne, w jaki sposób taka reakcja mogłaby zachodzić.