Human Microbiome Project

mikroskopisk studie av den friska människokroppen har visat att mikrobiella celler överträffar mänskliga celler med cirka tio till en. Före starten av HMP, denna rikliga gemenskap av mänskliga associerade mikrober förblev i stort sett ostudierad, lämnar deras inflytande på mänsklig utveckling, fysiologi, immunitet, och näring nästan helt okänd. HMP grundades med uppdraget att generera forskningsresurser, som snabbt och brett delades, vilket möjliggjorde omfattande karakterisering av den mänskliga mikrobioten och deras metaboliska förmåga och analys av deras roll i människors hälsa och sjukdom. Informationen som genereras av HMP är nu tillgänglig över hela världen för användning av utredare och andra i försök att förstå och förbättra människors hälsa.

den första fasen av HMP var inriktad på utveckling av DNA-sekvensdataset och beräkningsverktyg för att karakterisera mikrobiomen hos friska vuxna och hos personer med specifika mikrobiomassocierade sjukdomar. En etisk, juridisk och samhällelig implikationer (ELSI) del av programmet utvärderade frågor som uppstår från mänsklig mikrobiomforskning. Den andra fasen av HMP, känd som integrativ hmp eller iHMP, fokuserade på att skapa integrerade dataset med flera biologiska egenskaper från både mikrobiomet och värden över tid hos personer med specifika mikrobiomassocierade sjukdomar. Det långsiktiga målet med iHMP var att utveckla dataset och verktyg som samhället kan använda för att utvärdera vilka biologiska egenskaper hos mikrobiomet och värden ger viktiga nya insikter för att förstå människors hälsa och sjukdom.

höjdpunkter i HMP: s stora prestationer inkluderar:

• sekvensering av ~3000 referensbakteriegenom isolerade från människokroppen
• omfattande profil av mikrobiomen från över 300 friska människor
• världens största metagenomsekvensdataset från en mänsklig kohort
• världens enda kompletta dataset av bakteriell, svamp -, viral och protistisk gemenskapssammansättning från en mänsklig kohort
• integrerade dataset av metagenomiska, transkript, protein-och metabolit profiler från både mikrobiom och värd i flera humana kohorter
• programvara och online-resurser för att hjälpa till i studien av microbiome
• iHMP studier och datamängder i för tidig födsel, inflammatorisk tarmsjukdom, och prediabetes som utökar vår undestanding av värd/microbiome interaktioner

mer information om HMP inklusive datamängder, verktyg och metoder som utvecklats kan hittas genom att besöka HMP Data analys och Coordinationng Center webbplats.

för exempel på viktiga roller för mikrobiomet i mänsklig sjukdom upptäckt av HMP-forskare, besök programhöjdpunkter sida såväl som folkhälsans relevans sida.