I Lake of the Woods
huvudhistorien grenar ofta ut till flashbacks av betydande träd i John Wades förflutna. Hans barndom kallas ständigt tillkomsten av hans persona, trollkarl. Som barn missbrukades John ofta verbalt och känslomässigt av en alkoholiserad far, som beundrades av andra barn för sin offentliga persona. John besökte ofta Karras Studio of Magic, där han köpte Dödens Guillotin, köpt av sin far. John blev förstörd efter sin fars död och kanaliserade sin sorg till magi.
Wade träffade sin framtida fru Kathy under sina collegeår och blev intim med henne trots sin hemliga natur. John spionerade på Kathy, som hon var medveten om, precis som han var medveten om hennes affär med en tandläkare. När John utplacerades till Vietnam kommunicerade han och Kathy genom brev; några av hans rädda Kathy. John blev djupt uppslukad av sin identitet som trollkarl. Han porträtteras som medlem i Charlie Company, som var inblandade i My Lai-massakern. När han arbetade ett skrivbordsjobb i records raderade John sitt engagemang i företaget.
efter kriget gick John in i politiken. Han valdes till löjtnantguvernör i Minnesota och sprang senare för den amerikanska senaten, med sin kampanj som hanterades av den affärsinriktade Tony Carbo. Vid ett tillfälle har Kathy en abort, trots sin stora önskan att få barn, för John kände att hon hade ett barn skulle vara problematiskt för hans politiska karriär.
efter hans jordskred förlust i senaten race, under vilken det fanns uppenbarelse av Johns roll i My Lai, John och Kathy ta en semester på en stuga i Lake of the Woods. De är oroliga över uppenbarelsen av Johns Vietnam hemligheter, men låtsas vara lyckliga. En natt vaknar John och bestämmer sig för att koka vatten för te. Han häller kokande vatten över några hushållsplantor och reciterar”döda Jesus”. Han kommer ihåg att klättra tillbaka i sängen med Kathy, men nästa morgon är hon borta.
efter en dag med att gå runt i området och upptäcka båtens frånvaro pratar John med sina närmaste grannar, Rasmussens. Efter en tid ringer de sheriffen och organiserar en sökfest. Myndigheterna är misstänksamma mot Johns lugna uppförande och brist på deltagande i sökinsatsen. Kathys syster går med i sökningen, och John gör det också. Efter arton dagar avbryts sökpartiet; utredningen av John värms upp. Med en båt från Claude och leveranser från Mini-Mart leder John norrut på sjön. Claude är den sista personen som pratar med John över båtens radio och tror att han låter desorienterad.
O ’ Brien introducerar många alternativ under romanens gång. Kanske Kathy hade rusade över sjön för snabbt, slog en grov fläck av vatten, och hade kastats i sjön och drunknade. Kanske hade hon gått vilse i vildmarken, och fick slut på förnödenheter. Eller möjligen John hade återvänt till sovrummet med kokande vatten och hade hällt det över hennes ansikte, skållning och döda henne. Efteråt kunde han ha sjunkit båten och kroppen i sjön, tyngt av ett antal stenar. Eller händelsen kan ha varit Johns sista stora magiska trick, en försvinnande handling.
John och Kathy kan ha planerat hennes försvinnande tillsammans, för avsikt att John ska gå med henne och börja om. O ’ Brien introducerar detaljer som stöder var och en av möjligheterna och lämnar slutsatser upp till läsaren. Även om det ofullständiga slutet irriterade många läsare, hävdade O ’ Brien att detta är det sannaste sättet att berätta en historia. Det påminner om hans bok, de saker de bar, som presenterar flera länkade berättelser med olika karaktärer och ibland olika uppfattningar om samma händelser.