Porin (bílkovina)
podle TCDB existuje pět evolučně nezávislých superrodin porinů. Porinová nadčeledi i zahrnuje 47 rodin porinů s rozsahem počtů trans-membránových β-řetězců (β-TMS). Patří sem rodiny GBP, SP a RPP porin. Zatímco PSF i zahrnuje 47 rodin, PSF II – V každá obsahuje pouze 2 rodiny. Zatímco PSF i odvozuje členy z gramnegativních bakterií primárně jedna rodina eukaryotických mitochondriálních porinů, PSF II a v poriny jsou odvozeny z Aktinobakterií. PSF III A V jsou odvozeny od eukaryotických organel.
Porin Superfamily IEdit
1.B. 1-Obecná bakteriální rodina porinů
1.B. 2-Rodina chlamydiových porinů (CP)
1.B. 3-Rodina cukrových porinů (SP)
1.B. 4-Rodina Brucella-Rhizobium porin (BRP)
1.B. 5-Rodina Pseudomonas OprP Porin (POP)
1.B. 6 – OmpA-OmpF Porin (OOP) rodina
1.B. 7 Rodina Rhodobacter PorCa porin (RPP)
1.B. 8 Rodina mitochondriálních a plastidových porinů (MPP)
1.B. 9 Fadl vnější membránový protein (Fadl) rodina
1.B. 10 nukleosidově specifický kanál tvořící vnější membránový Porin (Tsx) rodina
1.B.11 vnější membrána fimbriální uvaděč Porin (FUP) rodina
1.B. 12 Rodina Autotransporter-1 (AT-1)
1.B. 13 alginát export porin (AEP) rodina
1.B. 14 Rodina receptorů pro vnější membránu (OMR)
1.B. 15 Rafinóza porin (RafY) rodina
1.B. 16 Rodina amidů s krátkým řetězcem a močoviny (SAP)
1.B. 17 Rodina vnějších membránových faktorů (OMF)
1.B. 18 skupina proteinů pomocné vnější membrány (Oma)
1.B. 19 glukózově selektivní skupina oprb porinu (OprB)
1.B. 20 Rodina sekrece dvou partnerů (TPS)
1.B. 21 OmpG porin (OmpG) rodina
1.B.22 vnější bakteriální membránová sekretinová (sekretinová) rodina
1.B. 23 rodina Sinicových porinů (CBP)
1.B. 24 mykobakteriální porin
1.B. 25 Rodina Porinových vnějších membrán (Opr)
1.B. 26 cyklodextrin Porin (CDP) rodina
1.B. 31 Rodina Campylobacter jejuni major outer membrane porin (MomP)
1.B. 32 Fusobakteriální vnější membrána Porin (Fomp) rodina
1.B. 33 rodina porinů (Bam complex) (OmpIP) s vložením vnějších membránových proteinů
1.B. 34 Korynebakteriální poriny
1.B. 35 oligogalakturonát-specifická rodina porinů (KdgM)
1.B. 39 bakteriální porin, Rodina OmpW (OmpW)
1.B.42-vnější membrána lipopolysacharid Export Porin (LPS-EP) Rodina
1.B. 43-Rodina Coxiella Porin P1 (CPP1)
1.B. 44-pravděpodobný protein Translokující rodinu Porphyromonas gingivalis Porin (PorT)
1.B. 49-Rodina Porinů Anaplasma P44 (A-P44)
1.B. 54 – Intimin/Invazin (Int/Inv) nebo rodina Autotransporter-3
1.B. 55-Rodina Poly Acetylglukosamin Porinu (PgaA)
1.B. 57-Rodina Legionella Major-Outer Membrane Protein (lm-OMP)
1.B. 60-Rodina Omp50 Porin (Omp50 Porin)
1.B. 61-Rodina Delta-Proteobakteriálních Porinů (Delta-Porin)
1.B. 62-domnělá bakteriální Rodina porinů (PBP)
1.B. 66-domnělá Beta-barelová Rodina Porin-2 (BBP2)
1.B. 67-domnělá Beta barelová Rodina Porin-4 (BBP4)
1.B. 68-domnělá Beta hlaveň Porin-5 (BBP5) nadčeledi
1.B. 70-Rodina vnějších membránových kanálů (OMC)
1.B. 71-Rodina Proteobakteriálních / Verrukomikrobiálních porinů (PVP)
1.B. 72-Rodina Protochlamydiálních Vnějších Membrán Porin (PomS/T)
1.B. 73-Rodina biogeneze/sestavy tobolek (CBA)
1.B.78 – DUF3374 Elektronový Transport-associated Porin (ETPorin) Rodina
Porin Nadčeleď II (MspA Nadčeleď)Upravit
1.B. 24-mykobakteriální porin
1.B. 58 – Nocardial Hetero-oligomerní Buněčné Stěny Kanálu (NfpA/B) Rodina
Porin Nadčeleď IIIEdit
1.B. 28-Plastidová vnější obálka Porin z rodiny 24 kDa (OEP24)
1.B.47 – Plastid Vnější Obálce Porin 37 kDa (OEP37) Rodina
Porin Nadčeleď IV (Tim17/OEP16/PxMPL (TOP) Nadčeleď)Upravit
Tato nadčeleď zahrnuje protein, který tvoří póry v vícesložkový protein translocases takto: 3.A. 8 -; 1.B. 69 -; 3.D. 9 –
1.B. 30-Plastidová vnější obálka Porin z rodiny 16 kDa (OEP16)
1.B. 69-Rodina Peroxysomální Membrány Porin 4 (PxMP4)
3.A. 8 – Mitochondriální Protein Translocase (MPT) Rodina
Porin Nadčeleď V (Corynebacterial PorA/PorH Nadčeleď)Upravit
1.B.34-Corynebakteriální Rodina Porin A (PorA) 1.B. 59-Vnější Membrána Porin, Porh (PorH) Rodina