Porine (eiwit)

volgens TCDB zijn er vijf evolutionair onafhankelijke superfamilies van porinen. Porin superfamily I omvat 47 families van porinen met een reeks van aantallen trans-membraan β-strengen (β-TMS). Deze omvatten de GBP, SP en RPP porin families. PSF I omvat 47 families, PSF II-V bevat elk slechts 2 families. Terwijl PSF I leden van gramnegatieve bacteriën hoofdzakelijk één familie van eukaryotic mitochondrial porins leidt, worden PSF II en v porins afgeleid van Actinobacteria. PSF III en V zijn afgeleid van eukaryotic organelle.

Porin Superfamily IEdit

1.B. 1 – de Algemene bacteriële porinefamilie
1.B. 2-De Chlamydial Porine (CP) familie
1.B. 3-De Suikerporine (SP) – familie
1.B. 4-De Brucella-Rhizobiumporine (BRP) – familie
1.B. 5-de Pseudomonas OprP Porin (POP) familie
1.B. 6-ompa-ompf porine (OOP) familie
1.B. 7 Rhodobacter PorCa porin (RPP) familie
1.B. 8 mitochondriale en plastide porine (MPP) familie
1.B. 9 Fadl outer membrane protein (Fadl) family
1.B. 10 Nucleoside-specifieke kanaalvormende buitenmembraan porine (Tsx) familie
1.B.11 buitenmembraan fimbriale usher porin (FUP) familie
1.B. 12 Autotransporter-1 (AT-1) familie
1.B. 13 alginaat exportporine (AEP) familie
1.B. 14 buitenmembraan receptor (OMR) familie
1.B. 15 Raffinoseporine (RafY) familie
1.B. 16 korte keten amide en ureumporine (SAP) familie
1.B. 17 buitenmembraan factor (OMF) familie
1.B. 18 Outer membrane auxiliary (OMA) protein family
1.B. 19 Glucose-selectieve oprb-porine (OprB) – familie
1.B. 20 Twee-partner secretie (TPS) familie
1.B. 21 ompg porin (ompg) familie
1.B.Buitenbacterieel membraan secretine (secretine) familie
1.B. 23 Cyanobacteriële porine (CBP) familie
1.B. 24 mycobacteriële porine
1.B. 25 Porine (Opr) – familie
1.B. 26 Cyclodextrine porin (CDP) familie
1.B. 31 Campylobacter jejuni major outer membraan porine (MomP) familie
1.B. 32 Fusobacteriële buitenmembraan porine (fomp) familie
1.B. 33 Buitenmembraaneiwittoevoeging porine (BAM complex) (ompip) familie
1.B. 34 corynebacteriële porinen
1.B. 35 Oligogalacturonaat-specifieke porine (KdgM) – familie
1.B. 39 bacteriële porine, ompw (ompw) familie
1.B.42-de buitenmembraan Lipopolysaccharide Export Porine (lps-EP) familie
1.B. 43-De Coxiella Porin P1 (CPP1) familie
1.B. 44-de vermoedelijke Eiwittranslocerende Porphyromonas gingivalis Porin (PorT) familie
1.B. 49-De Anaplasma P44 (A-P44) Porin Familie
1.B. 54-Intimin / Invasin (int / Inv) of Autotransporter-3 familie
1.B. 55-De Polyacetylglucosamineporine (Pgaa) – Familie
1.B. 57-de Legionella Major-Outer Membrane Protein (lm-OMP) familie
1.B. 60 – De Omp50 Porine (Omp50 Porine) Familie
1.B. 61-De Delta-Proteobacteriële Porine (Delta-Porine) Familie
1.B. 62-de vermeende bacteriële Porine (PBP) familie
1.B. 66-de vermeende β-Barrel Porine-2 (BBP2) familie
1.B. 67-de vermeende β-Barrel Porine-4 (BBP4) – familie
1.B. 68 – de veronderstelde superfamilie Porin-5 (BBP5) van Betabat Porin-5 (BBP5)
1.B. 70-de familie van de Buitenmembraankanalen (OMC)
1.B. 71-De Proteobacteriële / Verrucomicrobiële Porine (PVP) familie
1.B. 72-De Protochlamydial Outer Membraan Porine (PomS/T) Familie
1.B. 73 – De biogenese/assemblage (CBA) – familie van de Capsule
1.B.78-De DUF3374 Electron Transport-associated Porin (Etsporin) familie

Porin Superfamily II (MSPA Superfamily)Edit

1.B. 24 – mycobacteriële porine
1.B. 58-Nocardiale Heterooligomerische Celwandkanalen (NfpA/B) Familie

Porin Superfamily IIIEdit

1.B. 28-de plastide buitenkant Porine van 24 kDa (OEP24) familie
1.B.47-De plastide buitenste envelop Porin van 37 kDa (OEP37) familie

Porin Superfamily IV (Tim17/OEP16 / PXMPL (TOP) Superfamily) Edit

deze superfamilie omvat eiwitten die poriën bevatten in multicomponente eiwittranslocasen als volgt: 3.A. 8 -; 1.B. 69 -; 3.D. 9 –

1.B. 30-de plastide buitenkant Porine van 16 kDa (OEP16) familie
1.B. 69-Peroxysomaal Membraan Porine 4 (PxMP4) Familie
3.A. 8-de mitochondriale Eiwittranslocase (MPT) familie

Porin Superfamily V (Corynebacterial PorA/PorH Superfamily)Edit

1.B.34-De Corynebacteriële Porine A (PorA) Familie1.B. 59-Het Buitenmembraan Porine, Porh (PorH) Familie