Porin (Protein)

Laut TCDB gibt es fünf evolutionär unabhängige Superfamilien von Porinen. Die Porin-Superfamilie I umfasst 47 Familien von Porinen mit einer Reihe von Trans-Membran-β-Strängen (β-TMS). Dazu gehören die GBP-, SP- und RPP-Porin-Familien. Während PSF I 47 Familien umfasst, enthalten PSF II-V jeweils nur 2 Familien. Während PSF I Mitglieder von gramnegativen Bakterien in erster Linie einer Familie eukaryotischer mitochondrialer Porine ableitet, PSF II und V Porine stammen von Actinobakterien ab. PSF III und V stammen von eukaryotischen Organellen.

Porin Superfamilie ibearbeiten

1.B.1 – Die allgemeine bakterielle Porinfamilie
1.B.2 – Die Chlamydien-Porin (CP) -Familie
1.B.3 – Die Zuckerporin (SP)-Familie
1.B.4 – Die Brucella-Rhizobium porin (BRP)-Familie
1.B.5 – Die Pseudomonas OprP Porin (POP)-Familie
1.B.6 – ompA-OmpF-Porin (OOP)-Familie
1.B.7 Rhodobacter PorCa porin (RPP) Familie
1.B.8 Mitochondriale und Plastidporin (MPP) -Familie
1.B.9 FADL-Familie des äußeren Membranproteins (FadL)
1.B.10 Nukleosid-spezifische kanalbildende äußere Membran-Porin (Tsx)-Familie
1.B.11 Äußere Membran Fimbrial Usher Porin (FUP) Familie
1.B.12 Autotransporter-1 (AT-1) Familie
1.B.13 Alginat-Export-Porin (AEP)-Familie
1.B.14 Familie der äußeren Membranrezeptoren (OMR)
1.B.15 Raffinose Porin (RafY) Familie
1.B.16 Kurzkettige Amid- und Harnstoffporin (SAP)-Familie
1.B.17 Familie der äußeren Membranfaktoren (OMF)
1.B.18 Äußere Membranhilfsproteinfamilie (OMA)
1.B.19 Glucose-selektive OPRB-Porin (OprB) -Familie
1.B.20 Zwei-Partner-Sekretion (TPS) Familie
1.B.21 OmpG porin (OmpG) Familie
1.B.22 Äußere bakterielle Membran Sekretin (Sekretin) Familie
1.B.23 Cyanobakterielle Porin (CBP)-Familie
1.B.24 Mykobakterielles Porin
1.B.25 Äußere Membran Porin (Opr) Familie
1.B.26 Cyclodextrin-Porin (CDP)-Familie
1.B.31 Campylobacter jejuni major äußere Membran porin (MomP) Familie
1.B.32 Familie der fusobakteriellen äußeren Membranporine (FomP)
1.B.33 Familie der äußeren Membranprotein-Insertionsporine (Bam-Komplex) (OmpIP)
1.B.34 Corynebakterielle Porine
1.B.35 Oligogalacturonat-spezifische Porin (KdgM)-Familie
1.B.39 Bakterielle Porin, OmpW (OmpW) Familie
1.B.42 – Die äußere Membran Lipopolysaccharid Export Porin (LPS-EP) Familie
1.B.43 – Die Familie der Coxiella Porin P1 (CPP1)
1.B.44 – Das wahrscheinliche Protein, das die Porphyromonas gingivalis Porin (PorT) -Familie transloziert
1.B.49 – Die Porinfamilie des Anaplasmas P44 (A-P44)
1.B.54 – Intimin/Invasin (Int/Inv) oder Autotransporter-3-Familie
1.B.55 – Die Polyacetyl Glucosamin Porin (PgaA) Familie
1.B.57 – Die Legionella Major-Outer Membrane Protein (LM-OMP) Familie
1.B.60 – Die Omp50 Porin (Omp50 Porin)-Familie
1.B.61 – Die Delta-Proteobacterial Porin (Delta-Porin) Familie
1.B.62 – Die mutmaßliche bakterielle Porin (PBP) -Familie
1.B.66 – Die mutmaßliche Beta-Carotin-Porin-2 (BBP2) -Familie
1.B.67 – Die mutmaßliche Beta-Porin-4 (BBP4) -Familie
1.B.68 – Die mutmaßliche Beta-Porin-5 (BBP5) -Superfamilie
1.B.70 – Die Familie der äußeren Membrankanäle (OMC)
1.B.71 – Die proteobakterielle/verrukomikrobielle Porin (PVP)-Familie
1.B.72 – Die protochlamydiale äußere Membran Porin (PomS/T) Familie
1.B.73 – Die Familie der Kapselbiogenese / -assemblierung (CBA)
1.B.78 – Die DUF3374 Elektronentransport-assoziierte Porin (ETPorin) Familie

Porin Superfamilie II (MspA Superfamilie)Bearbeiten

1.B.24 – Mykobakterielles Porin
1.B.58 – Familie der hetero-oligomeren Zellwandkanäle (NfpA/B)

Porin-Superfamilie IIIEdit

1.B.28 – Die Plastide äußere Hülle Porin von 24 kDa (OEP24) Familie
1.B.47 – Die plastide äußere Hülle Porin von 37 kDa (OEP37) Familie

Porin Superfamilie IV (Tim17 / OEP16/PxMPL (TOP) Superfamilie)Bearbeiten

Diese Superfamilie umfasst Protein, das Poren in Mehrkomponenten-Protein-Translocasen wie folgt umfasst: 3.A.8 – ; 1.B.69 – ; 3.D.9 –

1.B.30 – Die Plastide äußere Hülle Porin von 16 kDa (OEP16) Familie
1.B.69 – Die peroxysomale Membran Porin 4 (PxMP4) Familie
3.A.8 – Die Familie der mitochondrialen Proteintranslokasen (MPT)

Porin-Superfamilie V (Corynebakterielle PorA / PorH-Superfamilie)Bearbeiten

1.B.34 – Die corynebakterielle Porin A (PorA) Familie1.B.59 – Die äußere Membran Porin, PorH (PorH) Familie