Porine (protéine)
Selon TCDB, il existe cinq superfamilles de porines indépendantes sur le plan évolutif. La superfamille I des porines comprend 47 familles de porines avec une gamme de nombres de brins β trans-membranaires (β-TMS). Il s’agit notamment des familles porin GBP, SP et RPP. Alors que PSF I comprend 47 familles, PSF II-V ne contient chacune que 2 familles. Alors que PSF I dérive des membres de bactéries à gram négatif principalement une famille de porines mitochondriales eucaryotes, les porines PSF II et V sont dérivées d’Actinobactéries. PSF III et V sont dérivés d’organites eucaryotes.
Superfamille de Porines IEdit
1.B.1 – La famille générale des porines bactériennes
1.B.2 – La Famille de la Porine à Chlamydia (CP)
1.B.3 – La famille des porines de sucre (SP)
1.B.4 – La Famille des porines de Brucella-Rhizobium (BRP)
1.B.5 – La Famille des Porines de Pseudomonas OprP (POP)
1.B. Famille de porines (POO) 6-OmpA-OmpF
1.B.7 Famille de Rhodobacter PorCa porin (RPP)
1.B.8 Famille des porines mitochondriales et plastidiennes (MPP)
1.B.9 Famille des protéines membranaires externes FadL (FadL)
1.B.10 Famille de porines à membrane externe formant des canaux spécifiques aux nucléosides (Tsx)
1.B.11 Famille de porines d’huissier fimbriales à membrane externe (FUP)
1.B.12 Famille d’Autotransporteurs-1 (AT-1)
1.B.13 Famille des porines d’exportation d’alginates (AEP)
1.B.14 Famille des récepteurs membranaires externes (OMR)
1.B.15 Famille de la porine de raffinose (RafY)
1.B.16 Famille d’amides à chaîne courte et de porines d’urée (SAP)
1.B.17 Famille de facteurs de membrane externe (OMF)
1.B.18 Famille de protéines auxiliaires de la membrane externe (OMA)
1.B.19 Famille de porines OprB sélectives du glucose (OprB)
1.B.20 Famille de sécrétions à deux partenaires (TPS)
1.B.21 Famille de porines OmpG (OmpG)
1.B.22 Famille des sécrétines de la membrane bactérienne externe (sécrétine)
1.B.23 Famille des porines cyanobactériennes (CBP)
1.B.24 Porine mycobactérienne
1.B.25 Famille de porines à membrane externe (Opr)
1.B.26 Famille de la porine de cyclodextrine (CDP)
1.B.31 Famille des porines principales de la membrane externe de Campylobacter jejuni (MomP)
1.B.32 Famille de porines de membrane externe fusobactérienne (FomP)
1.B.33 Famille des porines d’insertion des protéines membranaires externes (complexe Bam) (OmpIP)
1.B.34 Porines corynébactériennes
1.B.35 Famille de porines spécifiques aux oligogalacturonates (KdgM)
1.B.39 Porine bactérienne, famille OmpW (OmpW)
1.B.42 – La Famille des Porines d’exportation de Lipopolysaccharides de la Membrane Externe (LPS-EP)
1.B.43 – La Famille de Coxiella Porine P1 (CPP1)
1.B.44 – La Protéine Probable Translocatrice De Porphyromonas gingivalis Porine (PorT) Famille
1.B.49 – La Famille des Porines Anaplasma P44 (A-P44)
1.B.54 – Famille Intimine/Invasine (Int/Inv) ou Autotransporteur-3
1.B.55 – La Famille de la Polyacétyl Glucosamine Porine (PgaA)
1.B.57 – La Famille des Protéines de la Membrane Externe Majeure de Legionella (LM-OMP)
1.B.60 – La Famille de la Porine Omp50 (Porine Omp50)
1.B.61 – La Famille des Porines Delta-Protéobactériennes (Delta-Porine)
1.B.62 – La Famille des Porines Bactériennes Putatives (PBP)
1.B.66 – La Famille Putative De Porine Bêta-Baril-2 (BBP2)
1.B.67 – La Famille Putative De Porines à Barillet Bêta-4 (BBP4)
1.B.68 – La Superfamille Putative De Porine-5 (BBP5)
1.B.70 – La Famille des Canaux Membranaires Externes (OMC)
1.B.71 – La Famille des Porines Protéobactériennes/Verrucomicrobiennes (PVP)
1.B.72 – La Famille des Porines de Membrane Externe Protochlamydiales (PomS/T)
1.B.73 – La Famille de Biogenèse/Assemblage des Capsules (CBA)
1.B.78 – La Famille des Porines associées au transport d’électrons DUF3374 (Etporine)
Superfamille de Porines II (Superfamille MspA) Modifier
1.B.24 – Porine mycobactérienne
1.Famille des Canaux de Paroi Cellulaire Hétéro-oligomères (NfpA/B) B.58-Nocardial
Superfamille des Porines IIIEdit
1.B.28 – La Porine de l’Enveloppe Extérieure du Plastide de la Famille 24 kDa (OEP24)
1.B.47 – La Porine de l’Enveloppe Externe du Plastide de la Famille 37 kDa (OEP37)
Superfamille de Porines IV (Superfamille Tim17 / OEP16 / PxMPL (TOP)) Modifier
Cette superfamille comprend des protéines qui comprennent des pores dans des translocases protéiques à plusieurs composants comme suit: 3.A.8 -; 1.B.69 -; 3.D.9 –
1.B.30 – La Porine de l’Enveloppe Extérieure du Plastide de la Famille 16 kDa (OEP16)
1.B.69 – La Famille de la Porine de Membrane Peroxysomique 4 (PxMP4)
3.A.8 – La Famille de la Translocase des Protéines Mitochondriales (MPT)
Superfamille des Porines V (Superfamille Pora/ PorH Corynébactérienne) Modifier
1.B.34 – La Famille des Porines Corynébactériennes A (PorA)1.B.59 – La Membrane Externe Porine, Famille PorH (PorH)