Candida parapsilosis
a Candida parapsilosis egy gombafaj, amely az emberek számos betegségéért felelős . Az emberi kézen található sok mikrobák közül a C. parapsilosis a legelterjedtebb gombafajok közé tartozik . Ez a faj ismert, hogy szepszist okoz azoknál, akiknek immunrendszere károsodott, újszülöttek, intenzív betegek, beültetett eszközökkel rendelkező egyének, valamint olyan személyek, akik nemrégiben gyomor-bélrendszeri műtéten estek át . A kutatók azt találták, hogy a kórházakban a betegek által szerzett összes fertőzés nyolc-tizenöt százalékát C. parapsilosisnak tulajdonították . A taxon virulencia mechanizmusainak megértése miatt a kezelés nehéz és nem mindig hatékony . Ezért a jövőbeli kutatások szempontjából döntő fontosságú, hogy a fertőzésben részt vevő jelátviteli utak megértésére összpontosítsanak, valamint arra, hogy ezeket az útvonalakat hogyan szabályozzák, mivel ezeket nem értik jól.
magasabb rendű taxonok
a C. parapsilosis az Ascomycota családba tartozó gomba . C. a parapsilosis a Saccharomycetales osztály és a saccharomycetales rend tagja, amelyeket leggyakrabban kezdő élesztőknek neveznek, ami azt jelenti, hogy ivartalanul szaporodhatnak a mitózis folyamatán keresztül, amikor a tápanyagok bőségesek, és szexuálisan a haploid sejtek termelésével a meiózisban, amikor a tápanyagok nem bőségesek . A C. parapsilosis a Debaryomycetaceae család tagja ,amelyek általában az élesztő pseudohyphae használatával járnak. A C. parapsilosis a Candida nemzetség része, amely leginkább arról ismert, hogy képes betegséget okozni az emberekben . C. a parapsilosis a CTG klád tagja, a C. albicans mellett, ami azt jelenti, hogy CTG kodonjuk szerint kódol, nem pedig leucint.
Genomszerkezet
a C. parapsilosis genomszerkezetére vonatkozó konkrét információkat még fel kell fedezni. A gomba többnyire nem jellemző nyílt olvasókereteket (ORF-eket) tartalmaz, amelyek a fehérjét kódoló gének körülbelül 98,95% – át teszik ki . A többi gén az rRNS-t, a tRNS-t és a pszeudogéneket kódolja, amelyek a fehérjét kódoló gének 1,05% – át teszik ki. Az is ismert, hogy a molekuláris funkcióért felelős gének többsége hidroláz aktivitást alkalmaz, ezek a citoplazmában a leggyakoribbak, biológiai folyamatok szabályozására szolgálnak .
bár más jellemzők, mint például a G + C tartalom és a genomban lévő gének teljes száma még mindig nem állnak rendelkezésre, egy nemrégiben készült tanulmány rámutat a genomi variáció lehetőségére a C. parapsilosison belül. A kutatók teljes genomszekvenálást alkalmaztak a gomba három mintatörzsének elemzésére . Összehasonlítva a C kontroll referencia törzsével. parapsilosis, a Három minta törzs hasonló genetikai jellemzőket mutatott az egyes szekvenciákon belüli nagy variációs régiók mellett. A törzsek sok ALS gént tartalmaztak, amelyek kódolják a sejtfelszíni glikoproteineket, amelyek mindhárom mintában kissé változtak . A bőséges als gének különbségeinek felfedezése azt jelzi, hogy a C. parapsilosis képes genetikai rekombinációra, ami nagy variabilitást eredményez az egyes törzsek genomjában. Bár a tanulmány kutatói képesek voltak izolálni a törzseket, C. a parapsilosis izolátumokról ismert, hogy genetikailag nem differenciálhatók, és gyakran fejlett bioinformatikai rendszereken keresztül kell értelmezni őket . Ezenkívül a C. parapsilosis számos ismétlődő szekvenciát tartalmaz genomjának egy szekvenált szakaszában. Ez egy másik komplikáció, amellyel a kutatók szembesülnek, amikor megpróbálják szekvenálni a teljes genomját. Ugyanazon DNS-szekvenciák magas példányait nem lehet pontosan hozzárendelni egy adott genomi helyhez vagy funkcióhoz, mert több szerepük lehet a teljes genomban .
sejtszerkezet
C. a parapsilosis elsősorban egysejtű, kezdő állapotban létezik. Ugyanakkor képes pszeudohiphae kialakítására is, ami dimorfnak tűnik . Az élesztő fenotípusában a telepek simaak, a pszeudohiphae fenotípusban pedig a telepek koncentrikusak . A dextrózlemezen a C. parapsilosis fehér, krémes, fényes kolóniákat képez, amelyek hengeres sejtekből állnak .
bár a C. parapsilosis sejtösszetétele nem teljesen ismert, feltételezhető, hogy hasonló egy szorosan rokon fajhoz, a Candida albicanshoz . A sejtfal legbelső rétege kitinből, egy rostos poliszacharidból áll, amely fokozza a membrán merevségét . A sejtfal legkülső rétegét proteoglikánok borítják; konkrétan mannózban gazdag arginin maradványok (N-kapcsolt mannánok) és szerin/treonin maradványok (O-kapcsolt mannánok) . Az N-kapcsolt és O-kapcsolt mannánok fontos szerepet játszanak a sejtmorfológiában, a sejtdifferenciálódásban és a gazdaszervezet interakcióiban. Ezeknek a mannánoknak a elvesztése drámai módon csökkentheti a C. parapsilosis virulenciáját .
anyagcsere folyamatok
a környezetből származó tápanyagok felvétele érdekében A C. parapsilosis különféle extracelluláris enzimeket szabadít fel, amelyek a nagy makromolekulákat kisebb molekulákká bontják, ezáltal elérhetővé téve őket felszívódás céljából . A 172 C. parapsilosis izolátumból 63% foszfolipáz aktivitást mutat . Ez az extracelluláris enzim lehetővé teszi a foszfolipidek szabad zsírsavakká történő lebontását, amelyeket ezután felhasználnak a sejtek anyagcseréjében. Ezenkívül a C. parapsilosis izolátumok 92% – a zselatináz aktivitást, 47% – a kazeináz aktivitást mutatott . Mind a zselatináz, mind a kazeináz extracelluláris enzimek, amelyek a nagy fehérjéket aminosavakká bontják, amelyeket a sejtek anyagcseréjében is használnak .
a C. parapsilosis képes a tápanyagokat energiává alakítani mind oxidatív foszforiláció, mind fermentáció útján, bár az egyes útvonalakban részt vevő specifikus komplexek nem teljesen ismertek. A C. parapsilosis képes különféle cukrok fermentálására és asszimilálására, az 1 .táblázatban felsoroltak szerint.
érdemes megjegyezni, hogy a C. parapsilosis metabolikus aktivitása közvetlenül kapcsolódik virulencia képességeihez. A nagy makromolekulák lebontására használt extracelluláris enzimek közül sok létfontosságú a gazdaszervezet inváziójához. A foszfolipázokat a gazdasejt membránjaiban található észterkötések megzavarására használják . A proteázok, mint a zselatináz és a kazeináz, fontos szerepet játszanak a gazdaszervezet epitheliális és nyálkahártya gátjaiban található fehérjék lebontásában, valamint a gazda immunválaszában részt vevő fehérjék lebontásában . Ezenkívül a glükózkoncentráció közvetlenül kapcsolódik a biofilm modulációhoz a C. parapsilosisban. Bár a pontos mechanizmus továbbra sem ismert, a fokozott glükóz metabolizmus a biofilmképződésben részt vevő utak szabályozásához vezet .
1 .táblázat. Candida parapsilosis által fermentált és asszimilált cukrok.
| fermentáció ” + “pozitív,” – “negatív | asszimiláció” + “pozitív,” – ” negatív | |
|---|---|---|
| glükóz | + | + |
| szacharóz | + | + |
| galaktóz | + | + |
| laktóz | – | – |
| trehalóz | + | + |
| maltóz | + | + |
| Rafinózis | – | – |
ökológia
a C. parapsilosis gyakori lakója az emberi bőrnek, valamint számos más környezetnek és közösségnek. Ez a gombafaj ismert, hogy más organizmusokon, például háziállatokon és rovarokon él, és a talajban és a tengeri környezetben is megtalálható . Ezenkívül a C. parapsilosis a világ számos földrajzi helyén megtalálható; Észak-Amerikában, Európában, Latin-Amerikában, Afrikában és Ázsiában izolálták. A C. parapsilosis fertőzés előfordulása világszerte nőtt 1997 óta .
amellett, hogy az élő organizmusok között fennmaradt, a C. parapsilosis az ember alkotta környezetben és a háztartási készülékekben is megtalálható. Egy tanulmány szerint D. D. D. D. G. et al., a kutatók megvizsgálták a különböző helyszíneken 99 mosógépek különböző rezidenciák Törökországban, hogy vizsgálja meg a prevalenciája C. parapsilosis . Eredményeik azt mutatták, hogy a C. parapsilosis az összes mosógép közel egynegyedében található .
patológia
a C. parapsilosis olyan patogén gomba, amely könnyen terjed az emberek és állatok fogékony populációiban. A gomba szepszist, endocarditist, endophthalmitist, fungémiát, peritonitist, ízületi gyulladást okoz emberekben. Leggyakrabban a protéziseken, katétereken és más orvosi eszközökön található, amelyeket az egészségügyi dolgozók megérintenek . A C. parapsilosis virulenciáját növeli az a képessége, hogy biofilmeket képezzen ezeken az orvostechnikai eszközökön ,és hosszabb ideig tartó kötődésből nő. Továbbá, a gomba könnyen átterjedhet az egészségügyi dolgozóról a betegre, ha az érintkezés előtt nem végeznek alapos kézmosást .
a testben, C. a parapsilosis a beültetett eszköz körül kolonizál, és a közeli nyálkahártya felületekhez kapcsolódik. A Biofilm termelés védelmet nyújt, és ellenállóvá teszi a mikrobát a gombaellenes gyógyszerekkel szemben . Ez megnehezíti a természetes immunsejtek számára a gomba elleni küzdelmet, mivel nem képesek a biofilm csúszós felületére kapcsolódni. Így a C. parapsilosis végső soron felelős a műtét utáni szövődményekért és a korai halálozásért az érzékeny populációkban. A fertőzés fertőzésének leginkább veszélyeztetett populációja az újszülött betegek, az intenzív betegek és az immunhiányos betegek . Más Candida fajoktól eltérően, mint például a C. albicans, a C. parapsilosis nem kötelező kórokozó, és csak ezekben a specifikus populációkban okoz candidiasist . A C. parapsilosis hasonló módon befolyásolhatja az állatok immunrendszerét is. Az állatok lenyelhetik a kórokozót a talajból, rovarokból és más környezeti forrásokból, ami fertőzéshez és halálhoz vezethet .
a C mellett. a parapsilosis azon képessége, hogy megvédje magát az immunválasz és a gombaellenes gyógyszerek ellen, képes elrejteni a kimutatást . A C. parapsilosis kórszövettani aláírásai hasznosak a gomba fertőző útjának azonosításában. A szűrés során azonban nem mindig észlelik őket . Az egyik vizsgálatban a C. parapsilosis fertőzésben elhunyt újszülöttek vér-és tüdőtenyészeteit elemezték a kórszövettani jelek szempontjából. A boncolás és az immunfestés után a populáció 61% – ánál találtak jelentős gombás jelenlétet, de a 14 újszülött közül csak 187-nél diagnosztizáltak C. parapsilosis okozta fertőzést . A C. parapsilosis túlnyomó prevalenciája a vizsgált populáció többségében normál szűrési módszerekkel nem észlelhető, ami azt mutatja, hogy a C. parapsilosis fertőzések gyakran aluldiagnosztizáltak.
jelenlegi kutatás
a jelenlegi kutatás leginkább a C. parapsilosis által fertőzött egyének kezelési eredményeinek javítására összpontosít. A japán kutatók 2000-2010 között retrospektív megfigyelési vizsgálatot végeztek, amely a C. parapsilosis izolátumok gombaellenes szerekre való érzékenységét vizsgálta, és milyen egyéb társbetegségek álltak fenn azoknál a betegeknél, akik nem élték túl a fertőzést . A vizsgálat olyan nozokomiális candidémiában szenvedő betegeket vizsgált, akiknek protéziseket helyeztek be. A kutatók minimális gátló koncentrációval (MIC) számszerűsítették a gombaellenes érzékenységet. A tanulmány arra a következtetésre jutott, hogy a nozokomiális candidémia korábbi standard kezelése módosítható echinocandinokkal, mivel sikeresnek bizonyultak a betegek halálozásának csökkentésében .
egy hasonló vizsgálat a C. parapsilosisra adott humán immunválaszt vizsgálta. Ezt úgy végeztük, hogy összehasonlítottuk a különböző Candida fajok által mutatott citokin válaszok koncentrációját, amikor stimulálták a perifériás vér mononukleáris sejtjeit (Pbmc-k) . A kutatók azt találták, hogy a C. parapsilosis által stimulált sejtek kevesebb interleukin 17-et és 22-et termeltek, mint a C. albicans. Azt is megállapították, hogy a mitogén-aktivált protein-kinázok gátlása szükséges ahhoz, hogy a szervezet felismerje, hogy Candida faj fertőzte meg .
Trofa, D., G Xhamstercser, A., & Nosanchuk, J. D. (2008). Candida parapsilosis, egy feltörekvő gombás kórokozó. Klinikai Mikrobiológiai Vélemények, 21(4), 606-625. http://doi.org/10.1128/CMR.00013-08
Silva S, Negri M, Henriques M, Oliveira R, Williams D, Azeredo J. 2012. Candida glabrata, Candida parapsilosis és Candida tropicalis: biológia, epidemiológia, patogenitás és gombaellenes rezisztencia. FEMS mikrobiológiai vélemények. 36(2): 288-305. o. https://doi.org/10.1111/j.1574-6976.2011.00278.x
Papadimitriou-Olivgeris, M., Spiliopoulou, A., Kolonitsiou, F., Bartzavali, C., Lambropoulou, A., Xaplanteri, P., . . . Christofidou, M. (2018). A candidaemia növekvő előfordulása és az epidemiológia megváltoztatása a Candida nem albicans javára egy 9 éves időszakban (2009-2017) egy egyetemi görög kórházban. Fertőzés. doi:https://doi.org/10.1007/s15010-018-1217-2
Candida parapsilosis. A lap eredeti címe: https://www-ncbi-nlm-nih-gov.ezproxy.bu.edu/Taxonomy/Browser/wwwtax.cgi?mode=Info&id=5480&lvl=3&lin=f&keep=1&srchmode=1&unlock
Duina, A., Miller, M., & Keeney, J. (2014). Kezdő élesztő kezdő genetikusok számára: alapozó a Saccharomyces Cerevisiae modellrendszeren. Genetika, 197(1), 33-48. A lap eredeti címe: https://doi.org/10.1534/genetics.114.163188
Hui, F., Ren, Y., Chen, L., Li, Y., Zhang, L., & Niu, Q. (2014). A molekuláris filogenetikai elemzés feltárja a debaryomycetaceae család új hemisphaericaspora nemzetségét. PLOS egy. 9 (7), e103737. A lap eredeti címe: https://doi.org/10.1371/journal.pone.0103737
Turner, S., & Butler, G. (2014). A Candida patogén fajok komplexe. Hideg tavaszi kikötő perspektívái az orvostudományban, 4(9). A lap eredeti címe: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC4143104/
Skrzypek MS, Binkley J, Binkley G, MIYASATO SR, Simison M, Sherlock G (2017). A Candida Genom Adatbázis (CGD): 22 szerelvény beépítése, szisztematikus azonosítók és nagy áteresztőképességű szekvenálási adatok megjelenítése. Nukleinsavak Res 45 (D1); D592-D596.
Pryszcz, L. P., N., T., G., A., Gabald, T., T. (2013). Váratlan genomiális variabilitás a Candida parapsilosis kórokozó élesztő klinikai és környezeti törzseiben. Genombiológia és evolúció, 5(12), 2382-2392. https://doi.org/10.1093/gbe/evt185
Wikipedia közreműködők. (2018, július 5). Candida parapsilosis. A Wikipédiában, Az Ingyenes Enciklopédia. Lekért 15:52, szeptember 20, 2018, tól től https://en.wikipedia.org/w/index.php?title=Candida_parapsilosis&oldid=848995454
Hemedez, C., Trail-Burns, E., Mao, Q., Chu, S., Shaw, S. K., Boldogság, J. M., Paepe, M. E. (2018).Újszülöttkori nem albican Candidiasis patológiája: boncolási tanulmány és irodalmi áttekintés. Gyermekgyógyászati és fejlődési patológia, 7(4), 655-673. https://doi.org/10.1177/1093526618798773
Perez-Garcia LA, Csonka K, Flores-Carreon A, Estrada-Mata E, Mellado-Mojica E, Nemeth T, Lopez-Ramirez LA, Tóth R, Lopez MG, Vizler C, Marton a, Tóth A, Nosanchuk JD, Gacser A, Mora-Montes HM. 2016. A fehérje glikoziláció szerepe a Candida parapsilosis sejtfal integritásában és a gazdaszervezet kölcsönhatásában. Határok a mikrobiológiában. 7 (306): 1-16. https://doi.org/10.3389/fmicb.2016.00306
Neji S, Hadrich I, Trabelsi H, Abbes S, Cheikhrouhou F, Sellami H, Makni F, Ayadi A. 2017. Klinikai mintákból nyert virulencia faktorok, gombaellenes érzékenység és azolrezisztencia molekuláris mechanizmusai Candida parapsilosis komplex izolátumok között. Biomedical Science folyóirat. 24(67). https://doi.org/10.1186/s12929-017-0376-2
Pereira L, Silva S, Ribeiro B, Henriques M, Azeredo J. 2015. A glükózkoncentráció hatása a Candida parpsilosis által képződött biofilmek szerkezetére és mennyiségére. FEMS élesztő kutatás. 15(5). https://doi.org/10.1093/femsyr/fov043
D Ons, A., Sav, H., Gonca, S., Kaplan, E., Ilkit, M., Babi 6, M. N.,. . . Sybren de Hoog, G. (2017). Candida parapsilosis a háztartási mosógépekben. Nemzetközi emberi és állati mikológiai Társaság, 55, 813-819. doi: 10.1093 / mmy / myx008
Hirai, Y., Asahata, S., Ainoda, Y., Goto, A., Fujita, T., & Totsuka, K. (2014). Nosocomialis Candida parapsilosis candidaemia: kockázati tényezők, gombaellenes érzékenység és kimenetel. Kórházi fertőzés folyóirata, 87(1), 54-58. doi: / / doi-org. ezproxy.bu. edu / 10.1016 / j. jhin.2014.02.006
Tóth, A., Csonka, K., Jacobs, C., Vagvolgyi, C., Nosancsuk, J. D., Netea, M. G., & Gacser, A.(2013). A Candida albicans és a Candida parapsilosis különböző T-sejt válaszokat indukál az emberi perifériás vér mononukleáris sejtjeiben. Fertőző betegségek lapja, 208(4), 690-698. doi: 10.1093 / infdis / jit188
szerkesztette Natalia Aneiros, Dominick Milano, Sharmetha Ramanan és Quintashia Wilson, Jennifer Bhatnagar hallgatói a BI 311 Általános mikrobiológia számára, 2018, Boston Egyetem.