Oligomer

a kémiában és a biokémiában az oligomer (/633>erről a hangról figyelj) egy molekula, amely néhány hasonló vagy azonos ismétlődő egységből áll, amelyek ténylegesen vagy fogalmilag származtathatók egy kisebb molekula, annak monomerjének másolataiból. A név görög elemekből áll oligo -, “néhány” és-mer, “részek”. A melléknév formája oligomer.

a 15-Korona-5 Korona éter, egy ciklikus oligomer, és monomer, etilén-oxid.

az oligomer koncepció ellentétben állt a polimerével, amelyről általában azt értik, hogy nagy számú egység van, esetleg több ezer vagy millió. E két fogalom között azonban nincs éles különbség. Az egyik javasolt kritérium az, hogy a molekula tulajdonságai jelentősen eltérnek-e egy vagy néhány egység eltávolításával.

egy meghatározott számú egységgel rendelkező oligomerre a görög előtag utal, amely ezt a számot a végződéssel jelöli-mer: így dimer, trimer, tetramer, pentamer két, három, négy, illetve öt egységgel rendelkező molekulákra utal. Az oligomer egységei elrendezhetők lineáris láncban (mint a melamban, a melamin dimerjében), zárt gyűrűben (mint a trioxánban, a formaldehid ciklikus trimerében) vagy összetettebb szerkezetben (mint a tellúr-tetrabromidban, a tebr tetramer
4 kockaszerű maggal). Ha az egységek azonosak, akkor van egy homo-oligomer; különben lehet használni hetero-oligomer. A homo-oligomer fehérje példája a kollagén, amely három azonos fehérjeláncból áll.

tetrapeptid, a valin (zöld), glicin (fekete), szerin (fekete) és alanin (kék) aminosavak heterooligomerje. Az egységeket összekapcsoltuk az egyik monomer karbonsavcsoportjának –C(=O)OH− nak a következő h
2n amincsoporttal való kondenzációjával.

néhány biológiailag fontos oligomer makromolekulákból áll, például fehérjékből vagy nukleinsavakból; például a hemoglobin egy fehérje tetramer. Az aminosavak oligomerjét oligopeptidnek vagy csak peptidnek nevezik. Az oligoszacharid a monoszacharidok (egyszerű cukrok) oligomere. Az oligonukleotid a nukleinsav rövid, egyszálú fragmense, például DNS vagy RNS, vagy hasonló nukleinsavak analógjainak fragmensei, például peptid nukleinsav vagy Morfolinók.

a fő kapszid fehérje VP1 pentamer egysége. Minden monomer más színű.

az oligomer egységei összekapcsolhatók kovalens kötésekkel, amelyek a kötés átrendeződéséből vagy kondenzációs reakcióiból származhatnak, vagy gyengébb erőkkel, például hidrogénkötésekkel. A kifejezés multimer (/+m + m + m/) a biokémiában olyan fehérjék oligomerjeire használják, amelyek nem kovalensen kötődnek. A fő kapszidfehérje VP1 amely a polio vírus héját tartalmazza, egy önszerelő multimer 72 pentamerek, amelyeket helyi elektromos töltések tartanak össze.

sok olaj oligomer, például folyékony paraffin. A lágyítók oligomer észterek, amelyeket széles körben használnak a hőre lágyuló műanyagok, például a PVC lágyítására. Előállíthatók monomerekből összekapcsolásukkal, vagy a nyersolaj magasabb frakcióitól való elválasztással. A polibutén egy oligomer olaj, amelyet gitt készítéséhez használnak.

az Oligomerizáció olyan kémiai folyamat, amely a monomereket makromolekuláris komplexekké alakítja véges fokú polimerizáció révén. A telomerizáció olyan oligomerizáció, amelyet olyan körülmények között hajtanak végre, amelyek láncátvitelt eredményeznek, korlátozva az oligomerek méretét. (Ezt a fogalmat nem szabad összetéveszteni a telomer, a kromoszóma végén erősen ismétlődő DNS régiójának kialakulásával.)