Porin (fehérje)

a TCDB szerint öt evolúciósan független Porin szupercsalád létezik. A Porin superfamily I 47 Porin családot foglal magában, amelyek száma transz-membránon keresztül történik. Ide tartoznak a GBP, SP és RPP porin családok. Míg az I. PSF 47 családot tartalmaz, a II-V PSF csak 2 családot tartalmaz. Míg a PSF I tagjai gram-negatív baktériumokból származnak, elsősorban az eukarióta mitokondriális porinok egyik családjából, addig a PSF II és V porinok Aktinobaktériumokból származnak. A PSF III és V eukarióta organellákból származik.

Porin Superfamily IEdit

1.B. 1-az Általános bakteriális porin család
1.B. 2-a chlamydialis Porin (CP) család
1.B. 3-A Cukorporin (SP) család
1.B. 4-a Brucella-Rhizobium porin (BRP) család
1.B. 5-a Pseudomonas OprP Porin (POP) család
1.B. 6-OmpA-OmpF porin (OOP) család
1.B. 7 Rhodobacter PorCa porin (RPP) család
1.B. 8 mitokondriális és plasztid porin (MPP) család
1.B. 9 Fadl külső membránfehérje (Fadl) család
1.B. 10 nukleozid-specifikus csatornaképző külső membrán porin (Tsx) család
1.B.11 külső membrán fimbriális usher porin (FUP) család
1.B. 12 Autotransporter-1 (AT-1) család
1.B. 13 alginát export porin (AEP) család
1.B. 14 külső membrán receptor (OMR) család
1.B. 15 raffinóz porin (RafY) család
1.B. 16 rövid láncú amid és karbamid porin (SAP) család
1.B. 17 külső membrán faktor (OMF) család
1.B. 18 külső membrán kiegészítő (OMA) fehérjecsalád
1.B. 19 Glükózszelektív OprB Porin (OprB) család
1.B. 20 Kétpartner szekréció (TPS) család
1.B. 21 OmpG porin (OmpG) család
1.B.22 Külső bakteriális membrán szekretin (szekretin) család
1.B. 23 cianobaktérium porin (CBP) család
1.B. 24 Mycobacterium porin
1.B. 25 külső membrán porin (Opr) család
1.B. 26 ciklodextrin porin (CDP) család
1.B. 31 Campylobacter jejuni fő külső membrán porin (MomP) család
1.B. 32 Fusobakteriális külső membrán porin (FomP) család
1.B. 33 Külső membránfehérje-behelyező porin (Bam komplex) (OmpIP) család
1.B. 34 Corynebakteriális porinok
1.B. 35 Oligogalakturonát-specifikus porin (KdgM) család
1.B. 39 bakteriális porin, OmpW (OmpW) család
1.B.42-a külső membrán lipopoliszacharid Export Porin (LPS-EP) család
1.B. 43 – a Coxiella Porin P1 (CPP1) család
1.B. 44-a valószínű fehérje Transzlokáló Porphyromonas gingivalis Porin (PorT) család
1.B. 49-Az Anaplasma P44 (A-P44) Porin Család
1.B. 54-Intimin / Invazin (Int/Inv) vagy Autotransporter-3 család
1.B. 55-A Poli-Acetil-Glükózamin Porin (PgaA) Család
1.B. 57-a Legionella Major-külső membránfehérje (LM-OMP) család
1.B. 60-Az Omp50 Porin (Omp50 Porin) Család
1.B. 61-A Delta-Proteobaktérium Porin (Delta-Porin) Család
1.B. 62-a feltételezett bakteriális Porin (PBP) család
1.B. 66-a feltételezett béta-hordó Porin-2 (BBP2) család
1.B. 67-a feltételezett béta hordó Porin-4 (BBP4) család
1.B. 68-a feltételezett béta hordó Porin-5 (BBP5) szupercsalád
1.B. 70-a külső Membráncsatorna (OMC) család
1.B. 71-A Proteobaktérium/Verrucomikrobiális Porin (PVP) család
1.B. 72-A Protochlamydial Külső Membrán Porin (PomS/T) Család
1.B. 73-a kapszula Biogenesis/Assembly (CBA) család
1.B.78-a DUF3374 Elektrontranszporthoz kapcsolódó Porin (ETPorin) család

Porin szupercsalád II (MspA szupercsalád)Szerkesztés

1.B. 24-Mycobacterium porin
1.B. 58-Nocardialis Hetero-oligomer sejtfal csatorna (NfpA/B) család

Porin szupercsalád IIIEdit

1.B. 28-a 24 kDa (OEP24) családba tartozó plasztid külső burok Porin
1.B.47-A 37 kDa (OEP37) család plasztid külső burkolata

Porin IV szupercsalád (Tim17/OEP16/PxMPL (felső) szupercsalád)szerkesztése

ez a szupercsalád olyan fehérjét tartalmaz, amely többkomponensű fehérje transzlokázokban pórusokat tartalmaz az alábbiak szerint: 3.A. 8 -; 1.B. 69 -; 3.D. 9 –

1.B. 30-a plasztid külső boríték Porin 16 kDa (OEP16) család
1.B. 69-A Peroxiszomális Membrán Porin 4 (PxMP4) Család
3.A. 8-a mitokondriális Protein Transzlokáz (MPT) család

Porin V szupercsalád (Corynebakteriális PorA/PorH szupercsalád)Szerkesztés

1.B.34-A Corynebakteriális Porin A (PorA) Család1.B. 59-A Külső Membrán Porin, PorH (PorH) Család