Porina (proteina)
Secondo TCDB, ci sono cinque superfamiglie evolutivamente indipendenti di porine. La superfamiglia I di porina comprende 47 famiglie di porine con una gamma di numeri di filamenti β trans-membrana (β-TMS). Questi includono le famiglie GBP, SP e RPP porin. Mentre le PSF I comprendono 47 famiglie, le PSF II-V contengono ciascuna solo 2 famiglie. Mentre PSF I deriva membri da batteri gram-negativi principalmente una famiglia di porine mitocondriali eucariotiche, PSF II e V porine sono derivati da Actinobacteria. PSF III e V sono derivati da organelli eucariotici.
Superfamiglia di Porin IEdit
1.B. 1-La famiglia generale delle porine batteriche
1.B. 2-La famiglia dei porini da clamidia (CP)
1.B. 3-La famiglia dei porini dello zucchero (SP)
1.B. 4-La famiglia Brucella-Rhizobium porin (BRP)
1.B. 5-La famiglia Pseudomonas Porp Porin (POP)
1.B. 6-pora-porf porin (OOP) famiglia
1.B. 7 Famiglia di Rhodobacter PorCa porin (RPP)
1.B. 8 Famiglia di porine mitocondriali e plastidiche (MPP)
1.B. 9 Famiglia delle proteine della membrana esterna (FadL)
1.B. 10 Famiglia di porine (Tsx) a membrana esterna formante canali nucleosidici
1.B.11 Membrana esterna fimbrial usher porin (FUP) famiglia
1.B. 12 Autotrasportatore-1 (AT-1) famiglia
1.B. 13 Famiglia di porine da esportazione di alginato (AEP)
1.B. 14 Famiglia del recettore della membrana esterna (OMR)
1.B. 15 Raffinosio porin (RafY) famiglia
1.B. 16 Famiglia di porine ammide e urea a catena corta (SAP)
1.B. 17 Famiglia di fattori di membrana esterna (OMF)
1.B. 18 Famiglia di proteine ausiliarie della membrana esterna (OMA)
1.B. 19 Famiglia di porine Glucoseb selettive al glucosio (Glucoseb)
1.B. 20 Famiglia di secrezione a due partner (TPS)
1.B. 21 porg porin (Omg) famiglia
1.B.22 Membrana batterica esterna secretina (secretina) famiglia
1.B. 23 Famiglia di porine cianobatteriche (CBP)
1.B. 24 Porina micobatterica
1.B. 25 Famiglia porina (membrane) a membrana esterna
1.B. 26 Ciclodestrina porina (CDP) famiglia
1.B. 31 Famiglia delle porine principali della membrana esterna del Campylobacter jejuni (MomP)
1.B. 32 Famiglia dei porini della membrana esterna dei fusobatteri (FomP)
1.B. 33 Outer membrane protein insertion porin (Bam complex) (familyip) family
1.B. 34 Porine corinebatteriche
1.B. 35 Famiglia di porine oligogalatturonate-specifiche (KdgM)
1.B. 39 Porina batterica, famiglia Omw (Omw)
1.B.42-La famiglia esterna del porin (LPS-EP) dell’esportazione del lipopolisaccaride della membrana
1.B. 43-La famiglia di Coxiella Porin P1 (CPP1)
1.B. 44-La probabile proteina traslocante Porphyromonas gingivalis Porin (PorT) Famiglia
1.B. 49-La famiglia di porine dell’anaplasma P44 (A-P44)
1.B. 54-Famiglia Intimina/Invasina (Int/Inv) o Autotrasportatore-3
1.B. 55-La famiglia di poli acetil glucosamina porina (PgaA)
1.B. 57-La famiglia della Legionella Major-Outer Membrane Protein (LM-OMP)
1.B. 60-La famiglia Om50 Porin (Por50 Porin)
1.B. 61-La famiglia dei porini Delta-proteobatteri (Delta-Porin)
1.B. 62-La famiglia di porine batteriche putative (PBP)
1.B. 66-Il presunto Beta-Barile Porin-2 (BBP2) Famiglia
1.B. 67-Il putativo Beta Barrel Porin-4 (BBP4) Famiglia
1.B. 68-Il presunto Beta Barrel Porin-5 (BBP5) Superfamiglia
1.B. 70-La famiglia di canali a membrana esterna (OMC)
1.B. 71-La famiglia di porine proteobatteriche/verrucomicrobiche (PVP)
1.B. 72-La famiglia di Porin (PomS/T) della membrana esterna Protochlamydial
1.B. 73-La famiglia di biogenesi/assemblaggio della capsula (CBA)
1.B.78-La famiglia DUF3374 Electron Transport-associated Porin (ETPorin)
Porin Superfamily II (MspA Superfamily)Edit
1.B. 24-Porina micobatterica
1.B. 58-Canale della parete cellulare etero-oligomerico nocardiale (NfpA / B) Famiglia
Superfamiglia di Porin IIIEdit
1.B. 28-L’involucro esterno del plastide Porin della famiglia di 24 kDa (OEP24)
1.B.47-Il Plastid Porin involucro esterno di 37 kDa (OEP37) Famiglia
Porin Superfamiglia IV (Tim17/OEP16/pxmpl (TOP)Superfamiglia) Modifica
Questa superfamiglia include proteine che comprendono pori in translocasi proteiche multicomponenti come segue: 3.A. 8 -; 1.B. 69 – ; 3.D. 9 –
1.B. 30-L’involucro esterno del plastide Porin di 16 kDa (OEP16) Famiglia
1.B. 69-La famiglia di Porin 4 (PxMP4) della membrana perossisomiale
3.A. 8-La famiglia delle translocasi proteiche mitocondriali (MPT)
Superfamiglia di porina V (superfamiglia corinebatterica PorA/Porh)Modifica
1.B.34-La famiglia Porin A (PorA) Corinebacteriale1.B. 59-La membrana esterna Porin, PorH (PorH) Famiglia