ポリン(タンパク質)

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TCDBによると、ポリンの5つの進化的に独立したスーパーファミリーがあります。 Porin superfamily Iには、トランス膜β-ストランド（β-TMS）の数の範囲を持つ47ファミリーのporinsが含まれています。 これらはGBP、SPおよびRPPのporin家族を含んでいます。 PSF Iには47家族が含まれていますが、PSF II-Vにはそれぞれ2家族しか含まれていません。 PSF Iはグラム陰性細菌に由来するが、PSF IIおよびVポリンはアクチノバクテリアに由来する。 PSF IIIおよびVは真核生物細胞小器官に由来する。

Porin Superfamily IEdit

1.B.1-一般的な細菌のポリンファミリー
1。B.2-クラミジアポリン(CP)ファミリー
1.B.3-シュガーポリン(SP)ファミリー
1.B.4-Brucella-Rhizobium porin(BRP)ファミリー
1.B.5-Pseudomonas OprP Porin(POP)ファミリー
1.B.6-OmpA-OmpFポリン(OOP)ファミリー
1.B.7Rhodobacter PorCa porin(RPP)family
1.B.8ミトコンドリアと色素体ポリン(MPP)ファミリー
1.B.9FadL外膜タンパク質(FadL)ファミリー
1.B.10ヌクレオシド特異的チャネル形成外膜ポリン(Tsx)ファミリー
1.B.11外膜線毛アッシャー porin(FUP)family
1.B.12Autotransporter-1(AT-1)ファミリー
1.B.13アルギン酸塩エクスポートポリン(AEP)ファミリー
1.B.14外膜受容体(OMR)ファミリー
1.B.15ラフィノース・ポリン(RafY)ファミリー
1.B.16短鎖アミドおよび尿素ポリン(SAP)ファミリー
1.B.17外膜因子(OMF)ファミリー
1.B.18外膜補助タンパク質(OMA)ファミリー
1.B.19グルコース選択的OprBポリン(OprB)ファミリー
1.B.20Two-partner分泌(TPS)ファミリー
1.B.21OmpGポリン(OmpG)ファミリー
1.B.22外細菌膜セクレチン(secretin)ファミリー
1.B.23シアノバクテリアporin(CBP)family
1.B.24マイコバクテリアporin
1.B.25外膜ポリン(Opr)ファミリー
1.B.26シクロデキストリンポリン(CDP)ファミリー
1.B.31カンピロバクター・ジェジュニ主要外膜ポリン(MomP)ファミリー
1.B.32フソバクテリア外膜ポリン(FomP)ファミリー
1.B.33外膜タンパク質挿入ポリン(Bam複合体)(OmpIP)ファミリー
1.B.34コリネバクテリアporins
1.B.35オリゴガラクツロン酸特異的ポリン(KdgM)ファミリー
1.B.39Bacterial porin,OmpW(OmpW)family
1.B.42-外膜リポ多糖エクスポートポリン(LPS-EP)ファミリー
1.B.43-Coxiella Porin P1(CPP1)ファミリー
1.B.44-Porphyromonas gingivalis Porin(PorT)ファミリー
1.B.49-アナプラズマP44(A-P44)Porinファミリー
1.B.54-Intimin/Invasin(Int/Inv)またはAutotransporter-3ファミリー
1.B.55-ポリアセチルグルコサミンポリン(PgaA)ファミリー
1.B.57-レジオネラ大外膜タンパク質(LM-OMP)ファミリー
1.B.60-Omp50Porin(Omp50Porin)ファミリー
1.B.61-デルタ-プロテオバクテリアPorin(Delta-Porin)Family
1.B.62-推定細菌ポリン（PBP）ファミリー
1。B.66-推定ベータバレルポリン-2(BBP2)ファミリー
1。B.67-推定ベータバレルPorin-4(BBP4)ファミリー
1.B.68-推定ベータバレルPorin-5(BBP5)スーパーファミリー
1.B.70-外膜チャネル(OMC)ファミリー
1.B.71-プロテオバクテリア/Verrucomicrobial Porin(PVP)ファミリー
1.B.72-プロトクラミジア外膜ポリン(PomS/T)ファミリー
1.B.73-カプセル生物形成/集合体(CBA)ファミリー
1.B.78-DUF3374電子輸送関連ポリン（ETPorin）ファミリー

ポリンスーパーファミリー II（MspAスーパーファミリー）編集

1。B.24-マイコバクテリアporin
1.B.58-Nocardial Hetero-oligomeric Cell Wall Channel(NfpA/B)ファミリー

Porinスーパーファミリー IIIEdit

1.B.28-24kDa(OEP24)ファミリー
の色素体外膜ポリン1。B.47-37kDa(OEP37)ファミリーの色素体外側エンベロープPorin

Porin Superfamily IV(Tim17/OEP16/PxMPL(TOP)Superfamily)Edit

このスーパーファミリーには、以下のように多成分タンパク質トランスロカーゼの細孔を含むタンパク質が含まれている:3.A.8-;1.B.69-;3.D.9 –

1.B.30-16kDa(OEP16)ファミリーの色素体外膜ポリン
1.B.69-ペルオキシソーム膜ポリン4(Pxmp4)ファミリー
3.A.8-ミトコンドリアタンパク質トランスロカーゼ(MPT)ファミリー

Porin Superfamily V(Corynebacterial PorA/PorH Superfamily)Edit

1.B.34-コリネバクテリアPorin A(PorA)ファミリー1。B.59-外膜Porin,PorH(PorH)ファミリー