Oligomer

innen kjemi og biokjemi er en oligomer (/əˈlɪɡəə/ ( lytt)) et molekyl som består av noen få like eller identiske repeterende enheter som kan utledes, faktisk eller konseptuelt, fra kopier av et mindre molekyl, dets monomer. Navnet er sammensatt av greske elementer oligo-, «noen få» og-mer, «deler». En adjektivform er oligomerisk.

den 15-krone-5 kroneeter, en syklisk oligomer, og dens monomer, etylenoksid.

oligomerkonseptet står i motsetning til det for en polymer som vanligvis forstås å ha et stort antall enheter, muligens tusenvis eller millioner. Det er imidlertid ingen skarp forskjell mellom disse to konseptene. Et foreslått kriterium er om molekylets egenskaper varierer betydelig med fjerning av en eller noen få av enhetene.

en oligomer med et bestemt antall enheter refereres til av det greske prefikset som angir det tallet med slutten-mer: dermed refererer dimer, trimer, tetramer, pentamer til molekyler med henholdsvis to, tre, fire og fem enheter. Enhetene til en oligomer kan være anordnet i en lineær kjede (som i melam, en dimer av melamin), en lukket ring (som i trioksan, en syklisk trimer av formaldehyd), eller mer kompleks struktur (som i tellur tetrabromid, en tetramer av tebr
4 med en kube-lignende kjerne). Hvis enhetene er identiske, har man en homo-oligomer; ellers kan man bruke hetero-oligomer. Et eksempel på et homo-oligomert protein er kollagen, som består av tre identiske proteinkjeder.

et tetrapeptid, en hetero-oligomer av aminosyrene valin (grønn), glycin (svart), serin (svart) og alanin (blå). Enhetene ble forbundet med kondensering av karboksylsyregruppen-C (=O)OH av en monomer med amingruppen H
2N – av den neste.

noen biologisk viktige oligomerer består av makromolekyler som proteiner eller nukleinsyrer; for eksempel er hemoglobin et proteintetramer. En oligomer av aminosyrer kalles et oligopeptid eller bare et peptid. Et oligosakkarid er en oligomer av monosakkarider (enkle sukkerarter). Et oligonukleotid er et kort enkeltstrenget fragment av nukleinsyre SOM DNA ELLER RNA, eller lignende fragmenter av analoger av nukleinsyrer som peptid nukleinsyre eller Morpholinos.

en pentamer-enhet av det store kapsidproteinet VP1. Hver monomer er i en annen farge.

enhetene til en oligomer kan være forbundet med kovalente bindinger, som kan skyldes omlegging av bindinger eller kondensasjonsreaksjoner, eller ved svakere krefter som hydrogenbindinger. Begrepet multimer (/④m@ltɪə/) brukes i biokjemi for oligomerer av proteiner som ikke er kovalent bundet. Det store kapsidproteinet VP1 som består av skallet av polio-viruset, er en selvmonterende multimer av 72 pentamere holdt sammen av lokale elektriske ladninger.

mange oljer er oligomere, som flytende paraffin. Myknere er oligomere estere mye brukt til å myke termoplast som PVC. De kan være laget av monomerer ved å koble dem sammen, eller ved separasjon fra de høyere fraksjoner av råolje. Polybuten er en oligomerisk olje som brukes til å lage kitt.

Oligomerisering er en kjemisk prosess som omdanner monomerer til makromolekylære komplekser gjennom en endelig grad av polymerisering. Telomerisering er en oligomerisering utført under forhold som resulterer i kjedeoverføring, og begrenser størrelsen på oligomerer. (Dette konseptet må ikke forveksles med dannelsen av en telomer, en region med svært repeterende DNA på slutten av et kromosom.)