Porin (protein))

BY admin
|

IFØLGE TCDB er det fem evolusjonært uavhengige superfamilier av poriner. Porin superfamily i inkluderer 47 familier med poriner med et antall trans-membran β-tråder (β-TMS). DISSE inkluderer GBP, SP og rpp porin familier. MENS PSF i inkluderer 47 familier, INNEHOLDER PSF II-V hver bare 2 familier. MENS PSF i stammer medlemmer fra gram-negative bakterier primært en familie av eukaryote mitokondrie poriner, PSF II og v poriner er avledet Fra Actinobacteria. PSF III OG V er avledet fra eukaryote organeller.

Porin Superfamilie IEdit

1.B. 1-den Generelle bakterielle porinfamilien
1.B. 2-Chlamydial Porin (CP) Familien
1.B. 3-Sukker porin (SP) Familien
1.B. 4-Familien Brucella-Rhizobium porin (BRP)
1.B. 5-Pseudomonas OprP Porin (POP) Familien
1.B. 6-ompa-ompf porin (OOP) familie
1.B. 7 Familien Rhodobacter PorCa porin (RPP)
1.B. 8 mitokondriell og plastid porin (MPP) familie
1.B. 9 FadL ytre membran protein (FadL) familie
1.B. 10 Nukleosid-spesifikk kanaldannende ytre membran porin (Tsx) familie
1.B.11 Ytre membran fimbrial usher porin (FUP) familie
1.B. 12 Autotransporter-1 (AT-1) familie
1.B. 13 Alginat eksport porin (aep) familie
1.B. 14 Ytre membranreseptor (Omr) familie
1.B. 15 Raffinose porin (RafY) familie
1.B. 16 Kortkjedet amid og ureaporin (SAP) familie
1.B. 17 Ytre membranfaktor (OMF) familie
1.B. 18 Ytre membran hjelpe (Oma) protein familie
1.B. 19 Glukose-selektiv oprb porin (OprB) familie
1.B. 20 to-partner sekresjon (TPS) familie
1.B. 21 ompg porin (OmpG) familie
1.B.22 ytre bakteriell membran secretin (secretin) familie
1.B. 23 Cyanobakteriell porin (CBP) familie
1.B. 24 Mykobakteriell porin
1.B. 25 Ytre membran porin (Opr) familie
1.B. 26 Cyklodekstrinporin (CDP) familie
1.B. 31 Campylobacter jejuni stor ytre membran porin (MomP) familie
1.B. 32 Fusobakteriell ytre membran porin (FomP) familie
1.B. 33 Ytre membran protein innsetting porin (bam kompleks) (OmpIP) familie
1.B. 34 Korynebakterielle poriner
1.B. 35 Oligogalakturonatspesifikk porin (KdgM) familie
1.B. 39 Bakteriell porin, ompw (OmpW) familie
1.B.42-Ytre Membran Lipopolysaccharide Eksport Porin (LPS-EP) Familien
1.B. 43-Familien Coxiella Porin P1 (CPP1)
1.B. 44-Den Sannsynlige Proteintranslokerende Porphyromonas gingivalis Porin (PorT) Familien
1.B. 49-Anaplasma P44 (A-P44) Porin Familien
1.B. 54-Intimin / Invasin (Int/Inv) eller Autotransporter-3 familie
1.B. 55-Familien Poly Acetyl Glucosamine Porin (PgaA)
1.B. 57-Legionella Major-Ytre Membranprotein (Lm-OMP) Familien
1.B. 60-Familien Omp50 Porin (Omp50 Porin)
1.B. 61-Delta-Proteobakteriell Porin (Delta-Porin) Familien
1.B. 62-Den Antatte Bakterielle Porin (PBP) Familien
1.B. 66 – Den Antatte Beta-Fat Porin-2 (BBP2) Familien
1.B. 67-Den Antatte Beta Fat Porin-4 (BBP4) Familien
1.B. 68-Den Antatte Beta Fat Porin-5 (BBP5) Superfamilie
1.B. 70-Den Ytre Membran Kanal (OMC) Familien
1.B. 71-FAMILIEN Proteobakteriell/Verrucomikrobiell Porin (PVP)
1.B. 72-Protochlamydial Ytre Membran Porin (PomS/T) Familien
1.B. 73-Kapselbiogenese/Montering (Cba) Familien
1.B.78-DUF3374 Elektron Transport-assosiert Porin (ETPorin) Familien

Porin Superfamily II (MspA Superfamily)Rediger

1.B. 24-Mykobakteriell porin
1.B. 58-Nocardial Hetero-oligomeric Celleveggkanal (NfpA/B) Familie

Porin Superfamilie IIIEdit

1.B. 28-Plastid Ytre Konvolutt Porin av 24 kDa (OEP24) Familie
1.B.47 – Plastid Ytre Konvolutt Porin Av 37 kDa (OEP37) Familie

Porin Superfamily IV (Tim17/OEP16/PXMPL (TOPP) Superfamily) Rediger

denne superfamilien inneholder protein som utgjør porene i multikomponent proteintranslokaser som følger: 3.A. 8 -; 1.B. 69 -; 3.D. 9 –

1.B. 30-Plastid Ytre Konvolutt Porin av 16 kDa (OEP16) Familie
1.B. 69-Den Peroksysomale Membranen Porin 4 (PxMP4) Familien
3.A. 8-Familien Av Mitokondriell Proteintranslokase (MPT)

Porin Superfamilie V (Corynebakteriell PorA/PorH Superfamilie)Rediger

1.B.34-Den Corynebakterielle Porin A (PorA) Familien1.B. 59-Den Ytre Membran Porin, PorH (PorH) Familie