Oligomeer

in de scheikunde en biochemie is een oligomeer (luisteren) een molecuul dat bestaat uit een paar soortgelijke of identieke herhalende eenheden die feitelijk of conceptueel kunnen worden afgeleid uit kopieën van een kleiner molecuul, zijn monomeer. De naam is samengesteld uit Griekse elementen oligo -, ” een paar “en-mer,”delen”. Een bijvoeglijk naamwoord is oligomeer.

de 15-crown – 5 crown ether, een cyclisch oligomeer, en zijn monomeer, ethyleenoxide.

het oligomeerconcept contrasteerde met dat van een polymeer dat gewoonlijk wordt begrepen om een groot aantal eenheden te hebben, misschien duizenden of miljoenen. Er is echter geen duidelijk onderscheid tussen deze twee begrippen. Één voorgesteld criterium is of de eigenschappen van de molecule beduidend met de verwijdering van één of enkele eenheden variëren.

een oligomeer met een specifiek aantal eenheden wordt aangeduid met het Griekse voorvoegsel dat dat getal aanduidt met de uitgang-mer: dus dimeer, trimer, tetramer, pentamer verwijzen naar moleculen met twee, drie, vier, en vijf eenheden, respectievelijk. De eenheden van een oligomeer kunnen worden gerangschikt in een lineaire keten (zoals in melam, een dimeer van melamine), een gesloten ring (zoals in trioxaan, een cyclisch Trimer van formaldehyde), of een complexere structuur (zoals in telluriumtetrabromide, een tetrameer van tebr
4 met een kubusvormige kern). Als de eenheden identiek zijn, heeft men een homo-oligomeer; anders kan men heterooligomeer gebruiken. Een voorbeeld van een homo-oligomeric eiwit is collageen, dat uit drie identieke eiwitketens is samengesteld.

een tetrapeptide, een heterooligomeer van de aminozuren valine (groen), glycine (zwart), serine (Zwart) en alanine (blauw). De eenheden werden samengevoegd door condensatie van de carboxylzuurgroep –C(=O)OH van één monomeer met de aminegroep H
2N− van de volgende.

sommige biologisch belangrijke oligomeren bestaan uit macromoleculen zoals proteã NEN of nucleic zuren; bijvoorbeeld, hemoglobine is een eiwittetrameer. Een oligomeer van aminozuren wordt genoemd oligopeptide of enkel peptide. Een oligosaccharide is een oligomeer van monosacchariden (eenvoudige suikers). Oligonucleotide is een kort single-stranded fragment van nucleic zuur zoals DNA of RNA, of gelijkaardige fragmenten van analogen van nucleic zuren zoals peptide nucleic zuur of Morfolinos.

een pentamer-eenheid van het belangrijkste capside-eiwit VP1. Elk monomeer heeft een andere kleur.

de eenheden van een oligomeer kunnen worden verbonden door covalente bindingen, die het gevolg kunnen zijn van bindingherschikking of condensatiereacties, of door zwakkere krachten zoals waterstofbindingen. De term multimer wordt gebruikt in de biochemie voor oligomeren van eiwitten die niet covalent gebonden zijn. Het belangrijkste capside-eiwit VP1 dat het omhulsel van het poliovirus omvat is een zelf-assemblerende multimer van 72 pentamers die door lokale elektrische ladingen bij elkaar worden gehouden.

veel oliën zijn oligomeer, zoals vloeibare paraffine. Weekmakers zijn oligomere esters die veel worden gebruikt om thermoplasten zoals PVC te verzachten. Zij kunnen worden vervaardigd uit monomeren door ze aan elkaar te koppelen of door ze te scheiden van de hogere fracties Ruwe olie. Polybuteen is een oligomere olie die wordt gebruikt om stopverf te maken.

Oligomerisatie is een chemisch proces dat monomeren omzet in macromoleculaire complexen door middel van een eindige polymerisatiegraad. Telomerization is een oligomerization die onder voorwaarden wordt uitgevoerd die in kettingoverdracht resulteren, die de grootte van oligomers beperken. (Dit concept moet niet worden verward met de vorming van een telomeer, een gebied van zeer repetitief DNA aan het eind van een chromosoom.)