Oligomer

I kemi og biokemi, en oligomer (/əˈlɪɡəmər/ (lytte) – er et molekyle, der består af et par lignende eller identiske gentagelse af enheder, som kunne udledes, faktisk eller begrebsmæssigt, fra kopier af et mindre molekyle, sin monomer. Navnet er sammensat af græske elementer oligo -,” et par “og-mer,”dele”. En adjektivform er oligomer.

15-krone-5-kronether, en cyklisk oligomer, og dens monomer, ethylenoksid.

oligomerbegrebet står i kontrast til det for en polymer, der normalt forstås at have et stort antal enheder, muligvis tusinder eller millioner. Der er dog ingen skarp skelnen mellem disse to begreber. Et foreslået kriterium er, om molekylets egenskaber varierer betydeligt med fjernelsen af en eller nogle få af enhederne.

en oligomer med et specifikt antal enheder henvises til af det græske præfiks, der angiver dette nummer med slutningen-mer: således henviser dimer, trimer, tetramer, pentamer til molekyler med henholdsvis to, tre, fire og fem enheder. Enhederne af en oligomer kan være anbragt i en lineær kæde (som i melam, en dimer af melamin), en lukket ring (som i trioksan, en cyklisk trimer af formaldehyd) eller mere kompleks struktur (som i telluriumtetrabromid, en tetramer af TeBr
4 med en terninglignende kerne). Hvis enhederne er identiske, har man en homo-oligomer; ellers kan man bruge hetero-oligomer. Et eksempel på et homo-oligomert protein er kollagen, som består af tre identiske proteinkæder.

et tetrapeptid, en hetero-oligomer af aminosyrerne valin (grøn), glycin (sort), serin (sort) og alanin (blå). Enhederne blev forbundet med kondensering af carboksilsyregruppen-C (=O)OH af en monomer med amingruppen H
2n− af den næste.

nogle biologisk vigtige oligomerer består af makromolekyler som proteiner eller nukleinsyrer; for eksempel er hæmoglobin en proteintetramer. En oligomer af aminosyrer kaldes et oligopeptid eller bare et peptid. Et oligosaccharid er en oligomer af monosaccharider (simple sukkerarter). Et oligonukleotid er et kort enkeltstrenget fragment af nukleinsyre, såsom DNA eller RNA, eller lignende fragmenter af analoger af nukleinsyrer, såsom peptidnukleinsyre eller Morpholinos.

en pentamer enhed af det store kapsidprotein VP1. Hver monomer er i en anden farve.

enhederne i en oligomer kan være forbundet med kovalente bindinger, som kan være resultatet af bindingsomlejring eller kondensationsreaktioner eller af svagere kræfter såsom hydrogenbindinger. Udtrykket multimer (/pritm prislt pritm pritr/) anvendes i biokemi til oligomerer af proteiner, der ikke er kovalent bundet. Det største kapsidprotein VP1, der omfatter poliovirusens skal, er en selvsamlende multimeter på 72 pentamerer, der holdes sammen af lokale elektriske ladninger.

mange olier er oligomere, såsom flydende paraffin. Blødgørere er oligomere estere, der i vid udstrækning bruges til at blødgøre termoplast såsom PVC. De kan fremstilles af monomerer ved at forbinde dem sammen eller ved adskillelse fra de højere fraktioner af råolie. Polybuten er en oligomerolie, der bruges til at fremstille kitt.

Oligomerisering er en kemisk proces, der omdanner monomerer til makromolekylære komplekser gennem en endelig grad af polymerisering. Telomerisering er en oligomerisering udført under betingelser, der resulterer i kædeoverførsel, hvilket begrænser oligomernes størrelse. (Dette koncept må ikke forveksles med dannelsen af en telomer, en region med meget gentagne DNA i slutningen af et kromosom.)