Oligomer

w chemii i biochemii, oligomer (/əˈlɪɡəmər/ (posłuchaj)) jest cząsteczką, która składa się z kilku podobnych lub identycznych powtarzających się jednostek, które można uzyskać, faktycznie lub koncepcyjnie, z kopii mniejszej cząsteczki, jej monomeru. Nazwa składa się z greckich elementów oligo-, „kilka” i-mer, „części”. Forma przymiotnikowa jest oligomeryczna.

eter 15-Koronowo-5-koronowy, cykliczny oligomer i jego monomer, tlenek etylenu.

koncepcja oligomeru kontrastuje z polimerem, który zwykle ma dużą liczbę jednostek, być może tysiące lub miliony. Nie ma jednak wyraźnego rozróżnienia między tymi dwoma pojęciami. Jednym z proponowanych kryteriów jest to, czy właściwości cząsteczki różnią się znacznie przy usuwaniu jednej lub kilku jednostek.

oligomer o określonej liczbie jednostek określany jest greckim przedrostkiem oznaczającym tę liczbę końcówką-mer: tak więc dimer, trimer, tetramer, pentamer odnoszą się do cząsteczek z odpowiednio dwoma, trzema, czterema i pięcioma jednostkami. Jednostki oligomeru mogą być ułożone w łańcuch liniowy (jak w melamie, dimerze melaminy), zamknięty pierścień (jak w trioksanie, cyklicznym trimerze formaldehydu) lub bardziej złożoną strukturę (jak w tetrabromku telluru, tetramerze TeBr
4 z rdzeniem podobnym do sześcianu). Jeśli jednostki są identyczne, ma się homo-oligomer; w przeciwnym razie można użyć hetero-oligomer. Przykładem białka homo-oligomerycznego jest kolagen, który składa się z trzech identycznych łańcuchów białkowych.

tetrapeptyd, hetero-oligomer aminokwasów waliny (zielonej), glicyny (czarnej), seryny (czarnej) i alaniny (niebieskiej). Jednostki zostały połączone przez kondensację grupy kwasu karboksylowego-C (=O)OH jednego monomeru z grupą aminową H
2N− następnego.

niektóre biologicznie ważne oligomery składają się z makrocząsteczek, takich jak białka lub kwasy nukleinowe; na przykład hemoglobina jest tetramerem białkowym. Oligomer aminokwasów nazywany jest oligopeptydem lub po prostu peptydem. Oligosacharyd jest oligomerem monosacharydów (cukrów prostych). Oligonukleotyd jest krótkim jednoniciowym fragmentem kwasu nukleinowego, takiego jak DNA lub RNA, lub podobnymi fragmentami analogów kwasów nukleinowych, takich jak peptydowy kwas nukleinowy lub Morfolinos.

Jednostka pentameru głównego białka kapsydu VP1. Każdy monomer jest w innym kolorze.

jednostki oligomeru mogą być połączone wiązaniami kowalencyjnymi, które mogą wynikać z przegrupowania wiązań lub reakcji kondensacji lub słabszych sił, takich jak wiązania wodorowe. Termin multimer (/ˈmʌltɪmər/) jest używany w biochemii dla oligomerów białek, które nie są kowalencyjnie związane. Głównym białkiem kapsydu VP1, które zawiera skorupę wirusa polio, jest samoskładający się multimer składający się z 72 pentamerów utrzymywanych razem przez lokalne ładunki elektryczne.

wiele olejów jest oligomerycznych, takich jak ciekła parafina. Plastyfikatory są estrami oligomerycznymi szeroko stosowanymi do zmiękczania tworzyw termoplastycznych, takich jak PVC. Mogą być wytwarzane z monomerów przez łączenie ich ze sobą lub przez oddzielenie od wyższych frakcji ropy naftowej. Polibuten jest olejem oligomerycznym stosowanym do produkcji Kit.

Oligomeryzacja jest procesem chemicznym, który przekształca monomery w kompleksy makromolekularne poprzez skończony stopień polimeryzacji. Telomeryzacja jest oligomeryzacją przeprowadzaną w warunkach, które powodują przenoszenie łańcucha, ograniczając rozmiar oligomerów. (Pojęcia tego nie należy mylić z tworzeniem telomeru, regionu wysoce powtarzalnego DNA na końcu chromosomu.)