Porin (białko)

według TCDB istnieje pięć ewolucyjnie niezależnych superfamili Porin. Nadrodzina Porin i obejmuje 47 rodzin Porin z zakresem liczby Trans-błonowych nici β (β-TMS). Należą do nich rodziny Porin GBP, SP i RPP. Podczas gdy PSF I obejmuje 47 rodzin, PSF II – V każda zawiera tylko 2 rodziny. Podczas gdy PSF i wywodzi się z bakterii gram-ujemnych, głównie z jednej rodziny eukariotycznych poryn mitochondrialnych, PORYNY PSF II I V pochodzą z Actinobacteria. PSF III i V pochodzą z organelli eukariotycznych.

Porin Superfamily IEdit

1.B. 1-Ogólna bakteryjna rodzina porin
1.B. 2-Rodzina Porin Chlamydialnych (CP)
1.B. 3-Rodzina Porin cukrowych (SP)
1.B. 4-Rodzina Brucella-Rhizobium porin (BRP)
1.B. 5-Rodzina Pseudomonas OprP Porin (POP)
1.B. 6-Rodzina ompa-OmpF porin (OOP)
1.B. 7 Rodzina Rhodobacter PorCa porin (RPP)
1.B. 8 mitochondrialna i plastyd porin (MPP)
1.B. 9 Fadl z rodziny białek błony zewnętrznej (Fadl)
1.B. 10 specyficzna dla nukleozydów rodzina Porin błony zewnętrznej tworzącej kanał (Tsx)
1.B.Membrana zewnętrzna Fimbrialna usher porin (FUP)
1.B. 12 Rodzina autotransporterów-1 (AT-1)
1.B. 13 rodzina porin eksportowych alginianów (AEP)
1.B. 14 Rodzina receptorów błony zewnętrznej (OMR)
1.B. 15 Rodzina Raffinose porin (RafY)
1.B. 16 Krótkołańcuchowa rodzina amidów i Porin mocznika (SAP)
1.B. 17 Rodzina czynników zewnętrznych membrany (OMF)
1.B. 18 rodzina białek pomocniczych błony zewnętrznej (oma)
1.B. 19 selektywna glukoza rodzina porin OprB (OprB)
1.B. 20 Dwuizbowa rodzina wydzielania (TPS)
1.B. 21 rodzina ompg porin (OmpG)
1.B.Zewnętrzna błona bakteryjna z rodziny secretin (secretin)
1.B. 23 rodzina sinicobacterial porin (CBP)
1.B. 24 Mycobacterial porin
1.B. 25 zewnętrzna membrana porin (Opr) rodzina
1.B. 26 cyklodekstryna z rodziny Porin (CDP)
1.B. 31 Campylobacter jejuni major Outer membrane porin (MomP) family
1.B. 32 rodzina Fusobacterial outer membrane porin (FomP)
1.B. 33 rodzina porin (BAM complex) (OmpIP) z insercją białek błony zewnętrznej
1.B. 34 poriny Korynebakteryjne
1.B. 35 rodzina porin specyficznych dla oligogalakturonianów (KdgM)
1.B. 39 Porin bakteryjny, rodzina OmpW
1.B.42-zewnętrzna membrana lipopolisacharyd Export Porin (LPS-EP) rodzina
1.B. 43-Rodzina Coxiella Porin P1 (CPP1)
1.B. 44-prawdopodobna translokacja białka Porphyromonas gingivalis Porin (PorT)
1.B. 49-Rodzina Porin Anaplasma P44 (A-P44)
1.B. 54-Rodzina Intimin/Invasin (Int / Inv) lub Autotransporter-3
1.B. 55-Rodzina Poliacetylo-Glukozaminy Porin (PgaA)
1.B. 57-Rodzina Legionella Major-Outer Membrane Protein (LM-OMP)
1.B. 60-Rodzina Porin Omp50 (Omp50 Porin)
1.B. 61-Rodzina Delta-Proteobakteryjnych Porin (Delta-Porin)
1.B. 62-przypuszczalna bakteryjna Rodzina Porin (PBP)
1.B. 66-przypuszczalna Rodzina Porin-2 Beta-beczki (BBP2)
1.B. 67-przypuszczalna Rodzina beczek Beta Porin-4 (BBP4)
1.B. 68-przypuszczalna Nadrodzina beczki Beta Porin-5 (BBP5)
1.B. 70-Rodzina kanałów membranowych zewnętrznych (OMC)
1.B. 71-Rodzina Proteobacterial / Verrucomicrobial Porin (PVP)
1.B. 72-Protochlamydialna Błona Zewnętrzna Porin (PomS/T)
1.B. 73-Rodzina kapsułek Biogeneza/montaż (CBA)
1.B.78-Rodzina Porin (ETPorin) związana z transportem elektronów DUF3374

Nadrodzina Porin II (Nadrodzina MSPA)Edytuj

1.B. 24-Mycobacterial porin
1.B. 58-Nocardialna Hetero-oligomeryczna Rodzina kanału ściany komórkowej (NFPA/B)

Nadrodzina Porin IIIEdit

1.B. 28-Plastid zewnętrzny Porin z rodziny 24 kDa (OEP24)
1.B.47-Plastidowa otoczka zewnętrzna Porin z rodziny 37 kDa (OEP37)

Nadrodzina Porin IV (Nadrodzina Tim17/Oep16/PXMPL (TOP)) Edytuj

Nadrodzina ta obejmuje białko, które zawiera pory w wieloskładnikowych translokazach białkowych w następujący sposób: 3.A. 8 -; 1.B. 69 -; 3.D. 9 –

1.B. 30-Plastidowa Powłoka Zewnętrzna z rodziny 16 kDa (OEP16)
1.B. 69-Rodzina Błon Peroksysomalnych Porin 4 (PxMP4)
3.A. 8-Rodzina Translokaz białek mitochondrialnych (MPT)

Nadrodzina Porin V (Nadrodzina Korynebakteryjna PorA/PorH)Edit

1.B.34-Rodzina Corynebacterial Porin A (PorA) 1.B. 59-Błona Zewnętrzna Porin, Rodzina PorH (PorH)