Porin (protein)

ifølge TCDB er der fem evolutionært uafhængige superfamilier af poriner. Porin superfamilie i inkluderer 47 familier af poriner med en række Antal transmembran-Kurt-strenge (Kurt-TMS). Disse omfatter GBP, SP og RPP porin familier. Mens PSF i inkluderer 47 familier, indeholder PSF II-V hver kun 2 familier. Mens PSF i stammer medlemmer fra gramnegative bakterier primært en familie af eukaryote mitokondrielle poriner, PSF II og V poriner stammer fra Actinobacteria. PSF III og V er afledt af eukaryot organel.

Porin Superfamilie IEdit

1.B. 1 – den generelle bakterielle porinfamilie
1.B. 2-familien Chlamydial Porin (CP)
1.B. 3-familien Sukkerporin (SP)
1.B. 4-familien Brucella-jordstængler (BRP)
1.B. 5-familien Pseudomonas OprP Porin (POP)
1.B. 6-OmpA-ompf porin (OOP) familie
1.B. 7 Rhodobacter PorCa porin (RPP) familie
1.B. 8 familie af mitokondrie-og plastidporin (MPP)
1.B. 9 FadL ydre membranprotein (FadL) familie
1.B. 10 nukleosid-specifik kanaldannende ydre membranporinfamilie
1.B.11 ydre membran fimbrial usher porin (FUP) familie
1.B. 12 autotransporter-1 (at-1) familie
1.B. 13 alginat eksport porin (AEP) familie
1.B. 14 ydre membranreceptor (OMR) familie
1.B. 15 Raffinose porin (RafY) familie
1.B. 16 kortkædede amid-og urinstofporinfamilier
1.B. 17 ydre membranfaktor (OMF) familie
1.B. 18 ydre membran-hjælpeproteinfamilie (oma)
1.B. 19 Glucoseselektiv OprB porin (OprB) familie
1.B. 20 to-partner sekretion (TPS) familie
1.B. 21 OmpG porin (OmpG) familie
1.B.22 ydre bakteriemembran secretin (secretin) familie
1.B. 23 Cyanobakteriel porin (CBP) familie
1.B. 24 mycobakteriel porin
1.B. 25 ydre membranporin (Opr) familie
1.B. 26 Cyclodekstrinporin (CDP) familie
1.B. 31 Campylobacter jejuni major ydre membranporin (MomP) familie
1.B. 32 Fusobakteriel ydre membranporin (Fomp) familie
1.B. 33 ydre membranproteinindsættelsesporin (Bam-kompleks) (OmpIP) familie
1.B. 34 Corynebakterielle poriner
1.B. 35 Oligogalacturonat-specifik porin (KdgM) familie
1.B. 39 bakteriel porin, Ompv (Ompv) familie
1.B.42-den ydre membran lipopolysaccharid Eksportporin (LPS-EP) familie
1.B. 43-familien P1 (Cpp1)
1.B. 44-den sandsynlige Proteintranslokerende Porphyromonas gingivalis Porin (PorT) familie
1.B. 49-Anaplasma P44 (A-P44) Porinfamilien
1.B. 54-Intimin / Invasin (Int / Inv) eller Autotransporter-3 Familie
1.B. 55 – Familien Poly Acetyl Glucosamin Porin (PgaA)
1.B. 57 – Legionella Major-ydre membranprotein (lm-OMP) – familien
1.B. 60-Familien Omp50 Porin (Omp50 Porin)
1.B. 61 – Familien Delta-Proteobakteriel Porin (Delta-Porin)
1.B. 62-den formodede bakterielle Porin (PBP) familie
1.B. 66-den formodede Beta-tønde Porin-2 (BBP2) familie
1.B. 67-den formodede Beta-tønde Porin-4 (BBP4) familie
1.B. 68-den formodede Beta-tønde Porin-5 (BBP5) superfamilie
1.B. 70-den ydre Membrankanal (OMC) familie
1.B. 71-familien Proteobakteriel / Verrucomikrobiel Porin (PVP)
1.B. 72-Den Protochlamydiale Ydre Membranporin (PomS/T) Familie
1.B. 73-Kapselbiogenese / samling (CBA) familie
1.B.78-Duf3374 Elektrontransportassocieret Porin (Etporin) familie

Porin Superfamily II (MSPA Superfamily)Rediger

1.B. 24-mycobakteriel porin
1.B. 58-Nokardial Hetero-oligomer Cellevægskanal (NfpA/B) familie

Porin superfamilie IIIEdit

1.B. 28-Plastid ydre kuvert Porin af 24 kDa (OEP24) familie
1.B.47-Plastid ydre kuvert Porin af 37 kDa (OEP37) familie

Porin superfamilie IV (Tim17/OEP16/Pmmpl (TOP) superfamilie)Rediger

denne superfamilie inkluderer protein, der omfatter porer i multikomponentproteintranslokaser som følger: 3.A. 8 -; 1.B. 69 -; 3.D. 9 –

1.B. 30-Plastid ydre kuvert Porin af 16 kDa (OEP16) familie
1.B. 69 – Den Peroksysomale Membranporin 4 (Pmmp4) Familie
3.A. 8-Den mitokondrie Protein Translokase (MPT) familie

Porin superfamilie V (Corynebakteriel PorA/PorH superfamilie)Rediger

1.B.34-Den Corynebakterielle Porin A (PorA) Familie1.B. 59-Den Ydre Membran Porin, PorH (PorH) Familie