Oligomer

în chimie și biochimie, un oligomer (/unktil unktil/ ( ascultați)) este o moleculă care constă din câteva unități repetate similare sau identice care ar putea fi derivate, de fapt sau conceptual, din copii ale unei molecule mai mici, monomerul său. Numele este compus din elemente grecești oligo-, „câteva” și-mer, „părți”. O formă adjectivă este oligomerică.

eterul coroanei 15-coroană-5, un oligomer ciclic și monomerul său, oxid de etilenă.

conceptul de oligomer contrastează cu cel al unui polimer despre care se înțelege de obicei că are un număr mare de unități, posibil mii sau milioane. Cu toate acestea, nu există o distincție clară între aceste două concepte. Un criteriu propus este dacă proprietățile moleculei variază semnificativ odată cu îndepărtarea uneia sau a câtorva dintre unități.

un oligomer cu un anumit număr de unități este menționat de prefixul grecesc care denotă acel număr cu sfârșitul-mer: astfel dimer, trimer, tetramer, pentamer se referă la molecule cu două, trei, patru și, respectiv, cinci unități. Unitățile unui oligomer pot fi aranjate într-un lanț liniar (ca în melam, un dimer de melamină), un inel închis (ca în trioxan, un trimer ciclic de formaldehidă) sau o structură mai complexă (ca în tetrabromură de telur, un tetramer de TeBr
4 cu un miez asemănător cubului). Dacă unitățile sunt identice, unul are un homo-oligomer; altfel se poate folosi hetero-oligomer. Un exemplu de proteină homo-oligomerică este colagenul, care este compus din trei lanțuri proteice identice.

o tetrapeptidă, un hetero-oligomer al aminoacizilor valină (verde), glicină (negru), serină (negru) și alanină (albastru). Unitățile au fost unite prin condensarea grupării acidului carboxilic− C (=O)OH a unui monomer cu gruparea amină H
2N-a următorului.

unii oligomeri biologic importanți constau din macromolecule precum proteine sau acizi nucleici; de exemplu, hemoglobina este un tetramer proteic. Un oligomer de aminoacizi se numește oligopeptidă sau doar o peptidă. O oligozaharidă este un oligomer de monozaharide (zaharuri simple). O oligonucleotidă este un fragment monocatenar scurt de acid nucleic, cum ar fi ADN sau ARN, sau fragmente similare de analogi ai acizilor nucleici, cum ar fi acidul nucleic peptidic sau Morfolinos.

o unitate pentamer a proteinei majore capsid VP1. Fiecare monomer are o culoare diferită.

unitățile unui oligomer pot fi conectate prin legături covalente, care pot rezulta din rearanjarea legăturilor sau reacții de condensare sau prin forțe mai slabe, cum ar fi legăturile de hidrogen. Termenul multimer (/ˈmʌltɪmər/) este folosit în biochimie pentru oligomeri de proteine care nu sunt legate covalent. Proteina majoră de capsidă VP1 care cuprinde învelișul virusului poliomielitei este un multimer auto-asamblat de 72 de pentameri ținuți împreună de sarcini electrice locale.

multe uleiuri sunt oligomerice, cum ar fi parafina lichidă. Plastifianții sunt esteri oligomerici utilizați pe scară largă pentru a înmuia termoplasticele, cum ar fi PVC-ul. Ele pot fi făcute din monomeri prin legarea lor împreună sau prin separarea de fracțiunile superioare ale țițeiului. Polibutena este un ulei oligomeric folosit pentru a face chit.

Oligomerizarea este un proces chimic care transformă monomerii în complexe macromoleculare printr-un grad finit de polimerizare. Telomerizarea este o oligomerizare efectuată în condiții care au ca rezultat transferul lanțului, limitând dimensiunea oligomerilor. (Acest concept nu trebuie confundat cu formarea unui telomer, o regiune de ADN extrem de repetitiv la capătul unui cromozom.)