Porin (protein)

enligt TCDB finns det fem evolutionärt oberoende superfamiljer av poriner. Porin superfamily I innehåller 47 familjer av poriner med ett antal antal trans-membranaxi-strängar (Bisexuell-TMS). Dessa inkluderar GBP, SP och RPP Porin familjer. Medan PSF I omfattar 47 familjer, innehåller PSF II-V vardera endast 2 familjer. Medan PSF i härrör medlemmar från gramnegativa bakterier främst en familj av eukaryota mitokondriella poriner, PSF II och V poriner härrör från aktinobakterier. PSF III och V är härledda från eukaryot organell.

Porin Superfamilj IEdit

1.B. 1-den allmänna bakteriella porin-familjen
1.B. 2-Familjen Chlamydial Porin (CP)
1.B. 3-Sockerporin (SP) – familjen
1.B. 4-familjen Brucella-Rhizobium porin (BRP)
1.B. 5-familjen Pseudomonas OprP Porin (POP)
1.B. 6-OmpA-OmpF Porin (OOP) familj
1.B. 7 Rhodobacter PorCa porin (RPP) familj
1.B. 8 mitokondriell och plastid porin (MPP) familj
1.B. 9 Fadl yttre membranprotein (FadL) familj
1.B. 10 Nukleosidspecifik kanalbildande yttre membranporin (Tsx) familj
1.B.11 yttre membran fimbrial usher porin (FUP) familj
1.B. 12 Autotransporter-1 (AT-1) familj
1.B. 13 alginat export porin (AEP) familj
1.B. 14 yttre membranreceptor (omr) familj
1.B. 15 raffinos porin (RafY) familj
1.B. 16 kortkedjig amid och urea porin (SAP) familj
1.B. 17 yttre membranfaktor (OMF) familj
1.B. 18 yttre membranhjälpmedel (OMA) proteinfamilj
1.B. 19 Glukosselektiv OprB porin (OprB) familj
1.B. 20 tvåpartnersekretion (TPS) familj
1.B. 21 OmpG Porin (OmpG) familj
1.B.22 yttre bakteriemembransekretin (sekretin) familj
1.B. 23 cyanobakteriell porin (CBP) familj
1.B. 24 mykobakteriell porin
1.B. 25 yttre membranporin (Opr) familj
1.B. 26 cyklodextrin porin (CDP) familj
1.B. 31 Campylobacter jejuni större yttre membran porin (MomP) familj
1.B. 32 Fusobakteriell yttre membranporin (FomP) familj
1.B. 33 yttre membranproteininsättning porin (Bam-komplex) (OmpIP) familj
1.B. 34 Korynebakteriella poriner
1.B. 35 Oligogalakturonat-specifik porin (KdgM) familj
1.B. 39 bakteriell porin, OmpW (OmpW) familj
1.B.42-det yttre membranet lipopolysackarid Export Porin (LPS-EP) familj
1.B. 43-familjen Coxiella Porin P1 (CPP1)
1.B. 44-den troliga Proteintranslokerande Porphyromonas gingivalis Porin (PorT) – familjen
1.B. 49-Anaplasma P44 (A-P44) Porin Familj
1.B. 54-Intimin/Invasin (Int / Inv) eller Autotransporter-3-familj
1.B. 55-Familjen Polyacetylglukosamin Porin (PgaA)
1.B. 57-Legionella Major-yttre membranprotein (LM-OMP) familj
1.B. 60-Omp50 Porin (Omp50 Porin) – Familjen
1.B. 61-Familjen Delta-Proteobakteriell Porin (Delta-Porin)
1.B. 62-den förmodade bakteriella Porin-familjen (PBP)
1.B. 66-den förmodade Beta-Fat Porin-2 (BBP2) familj
1.B. 67-den förmodade Beta Fat Porin-4 (BBP4) familj
1.B. 68-den förmodade Beta Fat Porin-5 (BBP5) superfamilj
1.B. 70-den yttre Membrankanalen (OMC) familjen
1.B. 71-familjen Proteobakteriell/Verrucomicrobial Porin (PVP)
1.B. 72-Protochlamydial Yttre Membran Porin (PomS/T) Familj
1.B. 73-Kapselbiogenes / sammansättning (CBA) familj
1.B.78-Duf3374 Elektrontransportassocierad Porin (ETPorin) familj

Porin superfamilj II (MSPA superfamilj)redigera

1.B. 24-Mykobakteriellt porin
1.B. 58-Nocardial Hetero-oligomer Cellväggskanal (NfpA/B) familj

Porin superfamilj IIIEdit

1.B. 28-Plastid yttre kuvert Porin av 24 kDa (OEP24) familj
1.B.47-Plastid yttre kuvert Porin av 37 kDa (OEP37) familj

Porin superfamilj IV (Tim17/OEP16/PXMPL (TOP) superfamilj)redigera

denna superfamilj innehåller protein som innefattar porer i multikomponent proteintranslokaser enligt följande: 3.A. 8 -; 1.B. 69 -; 3.D. 9 –

1.B. 30-Plastid yttre kuvert Porin av 16 kDa (OEP16) familj
1.B. 69-Det Peroxysomala Membranet Porin 4 (PxMP4) Familj
3.A. 8-mitokondriell Proteintranslokas (MPT)familj

Porin superfamilj V (Corynebacterial PorA/PorH superfamilj) redigera

1.B.34-Familjen Corynebacterial Porin A (PorA) 1.B. 59-Det Yttre Membranet Porin, PorH (PorH) Familj