Enteric bacteries: friend or foe?
normaali ruoansulatuskanava sisältää valtavan määrän aerobisia ja anaerobisia bakteereja, joilla on normaalisti symbioottinen suhde isäntään, mutta joilla voi olla haittavaikutuksia, joilla on paikallisia ja systeemisiä seurauksia. Ohutsuoli muodostaa siirtymävyöhykkeen harvaan asutun mahan ja paksusuolen rehevän bakteerikasvuston välillä. Suolistoflooran säätely riippuu monimutkaisista vuorovaikutuksista monien tekijöiden välillä, mukaan lukien mahahapon eritys, suoliston motiliteetti, sapen ja haiman eritteet, paikallinen immuniteetti, pintaglycokalyx ja limakerros sekä ruokavalio. Mikrobien yhteisvaikutukset ovat myös tärkeitä, ja niihin voi liittyä muutoksia redox-potentiaalissa, substraattikadossa ja bakteerien kasvua estävien aineiden, kuten bakteriosiinien, tuotannossa. Normaalin suolistoflooran suotuisiin vaikutuksiin kuuluvat mahdollisesti patogeenisten organismien kilpailullinen poissulkeminen sekä ravintoaineiden, kuten lyhytketjuisten rasvahappojen (jotka ovat tärkeä energianlähde paksusuolen limakalvolle) ja vitamiinien tuotanto. Suolistoflooran haitallisia vaikutuksia ovat kilpailu kaloreista ja välttämättömistä ravintoaineista, erityisesti ohutsuolessa sijaitsevat bakteerit, ja kyky vahingoittaa limakalvoa, mikä joissakin olosuhteissa aiheuttaa tai edistää tulehduksellista suolistosairautta. Nämä ongelmat voivat korostua, jos intraluminaalisten bakteerien fysiologiseen säätelyyn kohdistuu häiriöitä, jotka sallivat tavallisen asukkaan liikakasvun, tai jos ohimenevä taudinaiheuttaja aiheuttaa kolonisaation. Patofysiologiset seuraukset voivat aiheuttaa suoraa vahinkoa suolen limakalvolle ja intraluminaalisten ainesosien bakteeriaineenvaihduntaan, esimerkiksi muodostaen dekonjugoituja sappihappoja ja hydroksyloituja rasvahappoja, jotka stimuloivat nesteen eritystä. Muita ongelmia syntyy, jos limakalvoesteeseen tulee häiriöitä, sillä se voi lisätä limakalvotulehdusta stimuloivien bakteerien ja bakteerituotteiden kulkeutumista, kun taas bakteerien translokaatio voi johtaa bakteremiaan ja verenmyrkytykseen. Bakteeripatogeeneihin liittyviä ongelmia kuvaavat patogeenisen Escherichia coli-bakteerin spektrin ominaisuudet, joista osa helpottaa pitkäaikaista kolonisaatiota kiinnittymällä enterosyyttien pintaan tai invaasioon.