: ami ou ennemi ?
Le tractus gastro-intestinal normal contient un nombre énorme de bactéries aérobies et anaérobies qui jouissent normalement d’une relation symbiotique avec l’hôte mais peuvent avoir des effets indésirables avec des conséquences locales et systémiques. L’intestin grêle constitue une zone de transition entre l’estomac peu peuplé et la flore bactérienne luxuriante du côlon. La régulation de la flore intestinale dépend d’interactions complexes entre de nombreux facteurs, notamment la sécrétion d’acide gastrique, la motilité intestinale, les sécrétions biliaires et pancréatiques, l’immunité locale, le glycocalyx de surface et la couche de mucus, et l’alimentation. Les interactions microbiennes sont également importantes et peuvent impliquer des altérations du potentiel redox, de l’épuisement du substrat et de la production de substances telles que les bactériocines qui inhibent la croissance bactérienne. Les effets bénéfiques de la flore entérique normale comprennent l’exclusion compétitive des organismes potentiellement pathogènes et la production de nutriments tels que les acides gras à chaîne courte (qui représentent une source d’énergie importante pour la muqueuse du côlon) et les vitamines. Les effets néfastes de la flore entérique comprennent la compétition pour les calories et les nutriments essentiels, en particulier par les bactéries situées dans l’intestin grêle, et une capacité à endommager la muqueuse, provoquant ou contribuant dans certaines circonstances à une maladie inflammatoire de l’intestin. Ces problèmes peuvent être accentués par une interférence avec la régulation physiologique des bactéries intraluminales permettant la prolifération par un résident normal, ou la colonisation par des agents pathogènes transitoires. Les conséquences physiopathologiques peuvent impliquer des dommages directs à la muqueuse intestinale, et le métabolisme bactérien des constituants intraluminaux, par exemple la formation d’acides biliaires déconjugués et d’acides gras hydroxylés qui stimulent la sécrétion de liquide. Des problèmes supplémentaires surviennent en cas d’interférence avec la barrière muqueuse, car cela peut entraîner un passage accru de bactéries et de produits bactériens stimulant l’inflammation des muqueuses, tandis que la translocation bactérienne peut entraîner une bactériémie et une septicémie. Les problèmes associés aux agents pathogènes bactériens sont illustrés par les propriétés du spectre des Escherichia coli pathogènes, dont certaines facilitent la colonisation à long terme par adhérence à la surface ou invasion des entérocytes.